摘要 | 第6-8页 |
abstract | 第8-9页 |
第一章 引言 | 第15-25页 |
1.1 黄曲霉菌 | 第15-16页 |
1.1.1 黄曲霉菌及其分布 | 第15页 |
1.1.2 黄曲霉菌侵染循环 | 第15-16页 |
1.1.3 黄曲霉菌致病性 | 第16页 |
1.2 黄曲霉毒素 | 第16-19页 |
1.2.1 黄曲霉毒素发生及危害 | 第16-17页 |
1.2.2 黄曲霉毒素理化性质 | 第17页 |
1.2.3 黄曲霉毒素限量标准 | 第17-18页 |
1.2.4 黄曲霉毒素检测方法 | 第18页 |
1.2.5 黄曲霉毒素代谢基因簇和生物合成 | 第18-19页 |
1.3 花生概况 | 第19-22页 |
1.3.1 我国花生产业发展现况 | 第19-20页 |
1.3.2 花生营养价值 | 第20页 |
1.3.3 花生黄曲霉毒素污染情况 | 第20页 |
1.3.4 花生黄曲霉毒素污染影响因素 | 第20-22页 |
1.4 花生黄曲霉毒素污染防控措施 | 第22-23页 |
1.4.1 收获前防控 | 第22-23页 |
1.4.2 收获后防控 | 第23页 |
1.5 转录组测序技术在黄曲霉菌研究中的应用 | 第23页 |
1.6 本研究目的意义及主要内容 | 第23-25页 |
1.6.1 研究目的及意义 | 第23-24页 |
1.6.2 研究内容 | 第24-25页 |
第二章 我国典型花生产区黄曲霉菌株的分布 | 第25-38页 |
2.1 概述 | 第25页 |
2.2 .材料与方法 | 第25-29页 |
2.2.1 仪器与试剂 | 第25-26页 |
2.2.2 花生及土壤样品采集 | 第26-27页 |
2.2.3 黄曲霉菌分离与纯化 | 第27页 |
2.2.4 黄曲霉菌分子生物学鉴定 | 第27-29页 |
2.2.4.1 基因组DNA提取 | 第27页 |
2.2.4.2 引物设计 | 第27页 |
2.2.4.3 PCR扩增 | 第27-28页 |
2.2.4.4 PCR产物回收 | 第28页 |
2.2.4.5 序列比对 | 第28-29页 |
2.3 结果与讨论 | 第29-36页 |
2.3.1 黄曲霉菌形态学鉴定 | 第29页 |
2.3.2 黄曲霉菌分子生物学鉴定 | 第29-30页 |
2.3.3 不同花生种植地黄曲霉菌分布情况 | 第30-31页 |
2.3.4 土壤、花生壳、花生仁黄曲霉菌株分布 | 第31-32页 |
2.3.5 收获前30 天和收获期黄曲霉菌株分布 | 第32-34页 |
2.3.6 不同土壤类型黄曲霉菌株分布 | 第34-35页 |
2.3.7 不同经度土壤黄曲霉菌株分布 | 第35页 |
2.3.8 不同纬度土壤黄曲霉菌株分布 | 第35页 |
2.3.9 不同海拔高度土壤黄曲霉菌株分布 | 第35-36页 |
2.4 小结 | 第36-38页 |
第三章 花生黄曲霉菌株产毒力与侵染力研究 | 第38-50页 |
3.1 概述 | 第38页 |
3.2 材料与方法 | 第38-40页 |
3.2.1 仪器与试剂 | 第38页 |
3.2.2 菌株产毒力测定 | 第38-39页 |
3.2.2.1 产毒培养 | 第39页 |
3.2.2.2 前处理 | 第39页 |
3.2.2.3 液质联用条件 | 第39页 |
3.2.3 花生黄曲霉菌侵染试验 | 第39-40页 |
3.2.3.1 侵染试验材料 | 第39-40页 |
3.2.3.2 花生黄曲霉菌接种 | 第40页 |
3.2.3.3 花生中AFB1 含量测定 | 第40页 |
3.3 结果与讨论 | 第40-49页 |
3.3.1 黄曲霉毒素定性、定量分析 | 第40-41页 |
3.3.2 不产毒菌株与产毒菌株分布 | 第41-42页 |
3.3.3 不同花生种植地黄曲霉菌株产毒力 | 第42-44页 |
3.3.4 黄曲霉菌株产毒类型 | 第44-45页 |
3.3.5 不同经度黄曲霉菌株产毒力 | 第45-46页 |
3.3.6 不同纬度黄曲霉菌株产毒力 | 第46页 |
3.3.7 不同海拔高度黄曲霉菌株产毒力 | 第46页 |
3.3.8 不同产毒力菌株侵染花生研究 | 第46-48页 |
3.3.9 低、高产毒菌在花生中产AFB1 的含量 | 第48-49页 |
3.4 小结 | 第49-50页 |
第四章 不同产毒力黄曲霉菌株表达谱研究 | 第50-68页 |
4.1 概述 | 第50页 |
4.2 材料与方法 | 第50-54页 |
4.2.1 试验材料 | 第50页 |
4.2.2 仪器与试剂 | 第50-51页 |
4.2.3 转录组测序样品准备 | 第51页 |
4.2.4 样品RNA提取及质量检测 | 第51页 |
4.2.5 mRNA文库构建 | 第51-52页 |
4.2.6 转录组测序数据分析 | 第52-53页 |
4.2.6.1 测序数据过滤 | 第52页 |
4.2.6.2 参考基因组序列比对 | 第52-53页 |
4.2.6.3 基因表达量分析 | 第53页 |
4.2.6.4 差异表达基因检测及功能分析 | 第53页 |
4.2.7 qRT-PCR验证 | 第53-54页 |
4.2.7.1 总RNA提取 | 第53页 |
4.2.7.2 c DNA第一链合成 | 第53页 |
4.2.7.3 荧光定量PCR | 第53-54页 |
4.3 结果与分析 | 第54-67页 |
4.3.1 总RNA样品质量检测 | 第54-55页 |
4.3.2 数据过滤后的Reads质量评估 | 第55-56页 |
4.3.3 与参考基因组比对 | 第56-57页 |
4.3.4 新转录本预测 | 第57页 |
4.3.5 基因表达量分析 | 第57页 |
4.3.6 差异表达基因分析 | 第57-59页 |
4.3.6.1 差异表达基因数量 | 第57-58页 |
4.3.6.2 差异基因维恩分析 | 第58-59页 |
4.3.7 候选基因的筛选 | 第59-67页 |
4.3.7.1 差异基因GO功能富集分析 | 第59-62页 |
4.3.7.2 差异基因KEGG Pathway功能富集分析 | 第62-64页 |
4.3.7.3 与黄曲霉毒素生物合成相关基因差异表达分析 | 第64-65页 |
4.3.7.4 qRT-PCR验证候选基因 | 第65-67页 |
4.4 小结 | 第67-68页 |
第五章 全文结论 | 第68-70页 |
参考文献 | 第70-76页 |
附录 | 第76-88页 |
致谢 | 第88-89页 |
作者简介 | 第89页 |