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基于CRISPR/Cas9技术的奶山羊SCD1基因敲除及功能研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
主要符号对照表第17-18页
第一章 文献综述第18-36页
    1.1 羊奶脂肪酸的营养价值第18页
    1.2 乳腺脂肪酸合成代谢调控第18-20页
        1.2.1 脂肪酸的从头合成第18页
        1.2.2 脂肪酸的延伸与去饱和第18-20页
    1.3 SCD1 基因研究进展第20-23页
        1.3.1 SCD1 基因的结构与亚型第20页
        1.3.2 SCD1 基因在生理代谢中的作用第20-22页
        1.3.3 SCD1 基因在反刍动物乳腺的功能第22-23页
        1.3.4 SCD1 基因的表达调控第23页
    1.4 CRISPR/Cas9 基因编辑系统概述第23-29页
        1.4.1 CRISPR系统的发展第23-25页
        1.4.2 CRISPR/Cas9 系统的作用途径第25-27页
        1.4.3 CRISPR/Cas9 系统的脱靶效应第27-29页
    1.5 CRISPR/Cas9 系统的应用第29-32页
        1.5.1 CRISPR/Cas9 系统应用于转录调控第29-30页
        1.5.2 sgRNA文库注释内源顺式作用元件及筛选功能基因第30-31页
        1.5.3 CRISPR/Cas9 系统应用于表观遗传学第31页
        1.5.4 单碱基编辑器第31-32页
    1.6 CRISPR/Cas9 系统在转基因动物生产中的应用第32-35页
        1.6.1 CRISPR/Cas9 技术应用于动物疾病模型第32-33页
        1.6.2 CRISPR/Cas9 技术应用于畜牧学生产第33-35页
    1.7 研究的目的与意义第35-36页
第二章 山羊SCD1 基因sgRNA设计筛选与同源重组载体构建第36-49页
    2.1 材料与方法第36-42页
        2.1.1 试验材料第36-37页
        2.1.2 试验仪器设备第37页
        2.1.3 细胞培养及处理第37页
        2.1.4 山羊SCD1 基因sgRNA设计第37-38页
        2.1.5 sgRNA/Cas9 真核表达载体构建第38-39页
        2.1.6 乳腺上皮细胞嘌呤霉素最适浓度筛选第39页
        2.1.7 细胞转染及筛选第39-40页
        2.1.8 T7EN1 酶切检测打靶效率第40-41页
        2.1.9 同源重组载体构建第41-42页
    2.2 结果与分析第42-45页
        2.2.1 乳腺上皮细胞最适嘌呤霉素浓度确定第42-43页
        2.2.2 sgRNA基因编辑效率鉴定第43-44页
        2.2.3 sgRNA打靶突变类型分析第44页
        2.2.4 同源臂克隆第44-45页
        2.2.5 5 ’arm+EGFP+PURO+3’arm同源重组载体构建第45页
    2.3 讨论第45-48页
        2.3.1 sgRNA的设计与筛选第45-46页
        2.3.2 基因编辑效率影响因素第46-47页
        2.3.3 基于同源重组模板的HDR修复途径第47-48页
    2.4 小结第48-49页
第三章 基于非同源末端连接修复(NHEJ)和同源导向修复(HDR)机制的SCD1 敲除乳腺上皮细胞的制备第49-65页
    3.1 材料与方法第49-54页
        3.1.1 试验材料第49-50页
        3.1.2 试验仪器设备第50页
        3.1.3 PX330-sgRNA载体构建第50页
        3.1.4 细胞转染及单克隆细胞筛选第50-51页
        3.1.5 单克隆细胞基因编辑情况检测第51页
        3.1.6 脱靶位点分析及检测第51-52页
        3.1.7 细胞培养及处理第52页
        3.1.8 RNA提取及RT-qPCR第52-53页
        3.1.9 蛋白提取及Western Blot第53页
        3.1.10 细胞免疫荧光第53-54页
        3.1.11 数据分析第54页
    3.2 结果与分析第54-62页
        3.2.1 NHEJ途径介导的SCD1 基因序列突变第54-55页
        3.2.2 PX330-sgRNA3 载体构建第55页
        3.2.3 HDR途径介导的SCD1 基因序列突变第55-58页
        3.2.4 SCD1 敲除乳腺上皮细胞脱靶位点分析第58-60页
        3.2.5 SCD1 敲除乳腺上皮细胞表达量分析第60-62页
    3.3 讨论第62-64页
        3.3.1 NHEJ与 HDR介导的DNA修复途径与基因编辑效率第62-63页
        3.3.2 CRISPR/Cas9 系统的脱靶效应第63-64页
    3.4 小结第64-65页
第四章 山羊乳腺上皮细胞SCD1 基因敲除对脂肪酸代谢的影响研究第65-75页
    4.1 材料与方法第65-66页
        4.1.1 试验材料第65页
        4.1.2 试验仪器设备第65页
        4.1.3 甘油三酯和胆固醇含量测定第65-66页
        4.1.4 细胞脂肪酸成分测定第66页
        4.1.5 RNA提取及RT-qPCR第66页
        4.1.6 蛋白提取及Western blot第66页
        4.1.7 数据分析第66页
    4.2 结果与分析第66-72页
        4.2.1 SCD1 基因敲除对乳腺上皮细胞甘油三酯含量的影响第66-67页
        4.2.2 SCD1 基因敲除对乳腺上皮细胞胆固醇含量的影响第67-68页
        4.2.3 SCD1 基因敲除对乳腺上皮细胞脂肪酸含量的影响第68-69页
        4.2.4 SCD1 基因敲除对乳腺上皮细胞脂质合成相关基因的影响第69-71页
        4.2.5 SCD1 基因敲除对SREBP1 表达的影响第71-72页
    4.3 讨论第72-74页
        4.3.1 SCD1 基因敲除对脂肪酸合成及相关基因表达的影响第72-73页
        4.3.2 RNA干扰与CRISPR/Cas9 基因编辑技术第73-74页
    4.4 小结第74-75页
第五章 小鼠受精卵SCD1 基因敲除研究第75-88页
    5.1 材料与方法第75-80页
        5.1.1 试验材料第75页
        5.1.2 仪器设备第75-76页
        5.1.3 小鼠受精卵分离培养第76页
        5.1.4 小鼠SCD1 基因sgRNA设计第76-77页
        5.1.5 小鼠SCD1 基因sgRNA体外转录载体构建第77-78页
        5.1.6 sgRNA体外转录第78页
        5.1.7 Cas9 mRNA体外转录第78-79页
        5.1.8 sgRNA体外切割试验第79页
        5.1.9 sgRNA与 Cas9 mRNA显微注射小鼠受精卵第79-80页
        5.1.10 小鼠胚胎基因组DNA提取及基因编辑情况检测第80页
    5.2 结果与分析第80-85页
        5.2.1 sgRNA与 Cas9 mRNA的体外转录第80-81页
        5.2.2 sgRNA体外切割试验第81-82页
        5.2.3 小鼠SCD1 基因sgRNA基因编辑效率第82-84页
        5.2.4 小鼠胚胎发育分析第84-85页
    5.3 讨论第85-87页
        5.3.1 小鼠胚胎应用于基因编辑技术改良模型第85页
        5.3.2 CRISPR/Cas9 系统应用于转基因小鼠研究第85-86页
        5.3.3 SCD1 敲除小鼠对脂质代谢的影响第86-87页
    5.4 小结第87-88页
第六章 山羊孤雌激活胚胎SCD1 基因敲除研究第88-100页
    6.1 材料与方法第88-92页
        6.1.1 试验材料第88-89页
        6.1.2 仪器设备第89页
        6.1.3 山羊卵母细胞分离第89页
        6.1.4 山羊卵母细胞培养及体外成熟第89页
        6.1.5 山羊卵母细胞孤雌激活第89页
        6.1.6 山羊SCD1 基因sgRNA设计及筛选第89-91页
        6.1.7 山羊SCD1 基因sgRNA体外转录载体的构建第91-92页
        6.1.8 sgRNA及 Cas9 mRNA体外转录第92页
        6.1.9 sgRNA体外切割试验第92页
        6.1.10 sgRNA与 Cas9 mRNA显微注射山羊孤雌激活胚胎第92页
        6.1.11 孤雌激活胚胎基因组DNA提取及基因编辑检测第92页
    6.2 结果与分析第92-97页
        6.2.1 乳腺上皮细胞sgRNA打靶效率验证第92-93页
        6.2.2 sgRNA与 Cas9 mRNA的体外转录结果第93-94页
        6.2.3 sgRNA体外切割试验第94页
        6.2.4 SCD1 基因sgRNA基因编辑效率分析第94-97页
        6.2.5 山羊孤雌激活胚胎卵裂率分析第97页
    6.3 讨论第97-99页
        6.3.1 CRISPR/Cas9 技术应用于转基因动物胚胎基因编辑第97-99页
        6.3.2 显微注射技术应用于CRISPR/Cas9 介导的基因编辑第99页
    6.4 小结第99-100页
结论第100-101页
创新点第101-102页
存在问题及展望第102-103页
参考文献第103-118页
附录第118-123页
致谢第123-125页
个人简历第125页

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