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绒山羊毛乳头细胞全转录组学分析及与毛母质细胞分子互作机制的研究

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表第13-18页
文献综述第18-32页
    第一章 绒山羊毛囊生物学及其内部关键细胞系研究进展第18-32页
        1.1 毛囊发育基本规律及相关机制第18-23页
            1.1.1 毛囊的形态发生第19-21页
            1.1.2 毛囊的周期性再生第21-23页
        1.2 毛乳头细胞研究进展第23-29页
            1.2.1 毛乳头细胞体外培养技术第23-25页
            1.2.2 编码基因和非编码基因在毛乳头细胞中的功能第25-27页
            1.2.3 全反式视黄酸和瘦素在毛囊发育中的作用第27-29页
        1.3 毛母质细胞体外培养研究第29-30页
        1.4 共培养技术在毛囊生物学中的应用第30页
        1.5 研究目的及意义第30-32页
试验研究第32-165页
    第二章 绒山羊毛囊毛乳头细胞的全转录组建谱及分析第32-80页
        2.1 材料与方法第33-35页
            2.1.1 主要生化试剂与实验动物第34页
            2.1.2 毛囊毛乳头细胞和皮肤成纤维细胞的原代和传代培养第34页
            2.1.3 绒山羊毛囊毛乳头细胞编码和非编码基因的建谱及分析第34-35页
            2.1.4 qRT-PCR验证测序结果第35页
        2.2 结果与分析第35-74页
            2.2.1 毛乳头细胞和成纤维细胞的分离培养第35-36页
            2.2.2 毛乳头细胞和成纤维细胞总RNA的提取及质量检测第36-37页
            2.2.3 测序数据质控分析第37-43页
            2.2.4 测序数据匹配分析第43-46页
                2.2.4.1 Lnc RNAs 文库匹配第43-45页
                2.2.4.2 MiRNAs文库匹配第45-46页
            2.2.5 LncRNAs文库的可变剪切分析第46-47页
            2.2.6 LncRNAs和 mRNAs分析第47-53页
                2.2.6.1 mRNAs筛选第47页
                2.2.6.2 LncRNAs筛选第47-48页
                2.2.6.3 LncRNAs和 mRNAs特征比较分析第48-50页
                2.2.6.4 LncRNAs和 mRNAs表达水平比较分析第50-53页
            2.2.7 CircRNAs鉴定及结构分析第53-54页
            2.2.8 MiRNAs鉴定及结构分析第54-56页
            2.2.9 基因差异表达分析第56-61页
            2.2.10 差异表达基因及靶基因KEGG和 GO分析第61-64页
            2.2.11 差异表达转录本的联合分析第64-69页
                2.2.11.1 LncRNAs和mRNAs的联合分析第64-65页
                2.2.11.2 LncRNAs和miRNAs联合分析第65-66页
                2.2.11.3 MiRNAs和 m RNAs联合分析第66-67页
                2.2.11.4 LncRNAs-miRNAs-mRNAs和CircRNAs-miRNAs-mRNAs调控网络分析第67-69页
            2.2.12 NcRNAs对 HOXC8和RSPO1 的表达调控分析第69-74页
        2.3 讨论第74-79页
            2.3.1 毛乳头细胞和成纤维细胞的异质性及基因表达差异第75-76页
            2.3.2 毛乳头细胞介导激素对毛囊发育的调控第76-77页
            2.3.3 非编码基因在毛乳头细胞中的表达及作用第77-78页
            2.3.4 毛乳头细胞核心基因的鉴定及表达调控第78-79页
        2.4 小结第79-80页
    第三章 全反式视黄酸和瘦素对毛乳头细胞的影响第80-98页
        3.1 材料与方法第81-83页
            3.1.1 化学试剂第81页
            3.1.2 皮肤样品的收集第81页
            3.1.3 细胞的培养第81页
            3.1.4 MTT检测第81-82页
            3.1.5 细胞免疫组化第82页
            3.1.6 EdU检测第82页
            3.1.7 细胞凋亡检测第82页
            3.1.8 细胞周期检测第82页
            3.1.9 总RNA提取和实时荧光定量第82页
            3.1.10 FGF7 报告载体的构建及双荧光素酶检测第82-83页
            3.1.11 FGF7 启动子区域转录因子结合位点的预测第83页
            3.1.12 数据分析第83页
        3.2 结果与分析第83-93页
            3.2.1 ATRA对毛乳头细胞的影响第83-90页
            3.2.2 瘦素对毛乳头细胞的影响第90-93页
        3.3 讨论第93-95页
            3.2.1 ATRA对毛乳头细胞的影响第93-95页
            3.3.2 瘦素对毛乳头细胞的影响第95页
        3.4 小结第95-98页
    第四章 绒山羊毛囊毛母质细胞的分离培养及应用第98-123页
        4.1 材料与方法第99-103页
            4.1.1 试验动物及主要生化试剂第99页
            4.1.2 毛母质细胞和毛乳头细胞的分离培养第99-101页
            4.1.3 毛母质细胞在不同培养基中形态变化和增殖情况第101页
            4.1.4 不同贴壁介质对毛母质细胞贴壁和形态的影响第101页
            4.1.5 毛母质细胞生长曲线的绘制及细胞倍增时间的计算第101-102页
            4.1.6 钙离子对毛母质细胞体外培养的影响第102页
            4.1.7 全反式视黄酸对毛母质细胞体外培养的影响第102页
            4.1.8 EdU检测第102-103页
            4.1.9 细胞RNA提取及实时荧光定量第103页
            4.1.10 蛋白质提取及蛋白免疫印记分析第103页
            4.1.11 细胞周期检测第103页
            4.1.12 数据分析第103页
        4.2 结果与分析第103-118页
            4.2.1 毛母质细胞从毛球部外植体的迁出及传代第103页
            4.2.2 毛母质细胞体外培养条件的优化第103-108页
            4.2.3 毛母质细胞的生长曲线和细胞倍增时间第108-109页
            4.2.4 毛母质细胞的鉴定第109-111页
            4.2.5 钙离子对毛母质细胞增殖和分化的影响第111-115页
            4.2.6 全反式视黄酸对毛母质细胞增殖和分化的影响第115-118页
        4.3 讨论第118-122页
        4.4 小结第122-123页
    第五章 绒山羊毛囊毛乳头细胞和毛母质细胞分子互作分析第123-163页
        5.1 材料与方法第124页
            5.1.1 毛乳头细胞和毛母质细胞的共培养第124页
            5.1.2 细胞周期检测第124页
            5.1.3 转录组测序分析第124页
        5.2 结果与分析第124-154页
            5.2.1 共培养细胞和单独培养的细胞细胞周期变化第124-125页
            5.2.2 测序细胞样品RNA质量检测与分析第125-126页
            5.2.3 测序文库构建结果与质量分析第126-129页
            5.2.4 测序数据的比对分析第129-130页
            5.2.5 基因结构分析第130-135页
            5.2.6 基因表达水平分析第135-141页
            5.2.7 差异基因表达分析第141-147页
            5.2.8 差异基因GO分析第147-150页
            5.2.9 差异基因KEGG分析第150-152页
            5.2.10 IL-1α调控基因表达机制第152-154页
        5.3 讨论第154-160页
            5.3.1 共培养对毛乳头细胞和毛母质细胞增殖的影响第155-156页
            5.3.2 共培养对毛乳头细胞基因表达的影响第156-158页
            5.3.3 共培养对毛母质细胞基因表达的影响第158-160页
        5.4 小结第160-163页
    第六章 结论第163-165页
        6.1 总结第163页
        6.2 创新点第163页
        6.3 还需进一步深入研究的问题第163-165页
参考文献第165-183页
附录第183-189页
致谢第189-191页
作者简介第191页

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