| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 主要符号对照表 | 第8-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-17页 |
| 1.1 课题的研究背景与意义 | 第10-11页 |
| 1.2 研究现状 | 第11-15页 |
| 1.2.1 关于预测疾病关联因子问题的介绍 | 第11-12页 |
| 1.2.2 预测潜在的疾病关联LncRNA的研究现状 | 第12-13页 |
| 1.2.3 预测潜在的疾病关联微生物的研究现状 | 第13-15页 |
| 1.3 论文的主要工作 | 第15页 |
| 1.4 论文的组织结构 | 第15-17页 |
| 第2章 基于网络预测疾病关联因子的基础 | 第17-25页 |
| 2.1 生物数据的收集与处理 | 第17页 |
| 2.2 网络及二分网络的理论基础 | 第17-18页 |
| 2.3 基于网络结构的相似性测度的基础 | 第18-21页 |
| 2.3.1 基于局部信息的相似性测度 | 第19-20页 |
| 2.3.2 基于全局信息的相似性测度 | 第20-21页 |
| 2.3.3 基于随机游走的相似性测度 | 第21页 |
| 2.4 预测模型的评价方法 | 第21-24页 |
| 2.4.1 评价指标 | 第21-23页 |
| 2.4.2 交叉验证 | 第23-24页 |
| 2.4.3 案例分析 | 第24页 |
| 2.5 本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 基于二分网络的疾病关联LncRNA的预测模型研究 | 第25-38页 |
| 3.1 引言 | 第25页 |
| 3.2 疾病关联LncRNA预测模型的理论概述 | 第25-26页 |
| 3.3 疾病关联的LncRNA预测模型的构建 | 第26-30页 |
| 3.3.1 二分网络的构建 | 第27页 |
| 3.3.2 基于共同邻居的疾病相似性和LncRNA相似性 | 第27-28页 |
| 3.3.3 基于SimRank的疾病相似性和LncRNA相似性 | 第28-29页 |
| 3.3.4 整合的疾病相似性和LncRNA相似性 | 第29页 |
| 3.3.5 构建疾病与LncRNA的关联关系 | 第29-30页 |
| 3.4 预测模型的性能分析与评价 | 第30-37页 |
| 3.4.1 实验数据资源 | 第30-31页 |
| 3.4.2 基于疾病与LncRNA的二分网络的分析 | 第31-32页 |
| 3.4.3 实验结果与对比分析 | 第32-34页 |
| 3.4.4 案例分析 | 第34-37页 |
| 3.5 本章小结 | 第37-38页 |
| 第4章 基于二分网络的疾病关联微生物的预测模型研究 | 第38-48页 |
| 4.1 引言 | 第38-39页 |
| 4.2 疾病关联微生物的预测模型的理论概述 | 第39页 |
| 4.3 疾病关联微生物预测模型的设计与实现 | 第39-43页 |
| 4.3.1 二分网络的构建 | 第40页 |
| 4.3.2 基于基因的疾病相似性 | 第40-41页 |
| 4.3.3 基于疾病的微生物相似性 | 第41-42页 |
| 4.3.4 基于微生物的疾病相似性 | 第42页 |
| 4.3.5 构建疾病与微生物的关联关系 | 第42-43页 |
| 4.4 预测模型的性能分析与评价 | 第43-47页 |
| 4.4.1 实验数据 | 第43-44页 |
| 4.4.2 实验结果与对比分析 | 第44-45页 |
| 4.4.3 与其它预测模型的对比分析 | 第45-47页 |
| 4.5 本章小结 | 第47-48页 |
| 第5章 总结与展望 | 第48-51页 |
| 5.1 总结 | 第48-49页 |
| 5.2 本文展望 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-56页 |
| 致谢 | 第56-58页 |
| 附录A 个人在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第58-59页 |
| 附录B 攻读学位期间所参与的科研项目、获奖情况 | 第59页 |
