| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| 1.1 滇山茶概述 | 第11-13页 |
| 1.1.1 滇山茶形态和生物学特征 | 第11-12页 |
| 1.1.2 滇山茶的地理分布 | 第12页 |
| 1.1.3 滇山茶起源研究 | 第12-13页 |
| 1.1.4 滇山茶的应用价值 | 第13页 |
| 1.2 植物异源多倍化基因表达研究进展 | 第13-20页 |
| 1.2.1 研究的技术手段 | 第13-15页 |
| 1.2.2 多倍体植物基因表达变化特点 | 第15-19页 |
| 1.2.3 基因表达变化的分子机制 | 第19-20页 |
| 1.3 植物异源多倍体及其优势 | 第20页 |
| 1.4 研究内容 | 第20-22页 |
| 1.4.1 主要研究内容 | 第20-21页 |
| 1.4.2 拟解决科学问题 | 第21页 |
| 1.4.3 技术路线图 | 第21-22页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第22-23页 |
| 第二章 滇山茶异源多倍体与亲本的高通量转录组测序 | 第23-45页 |
| 2.1 试验材料与仪器 | 第23-25页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第23-25页 |
| 2.1.2 试验试剂、设备和耗材 | 第25页 |
| 2.2 试验方法 | 第25-28页 |
| 2.2.1 总RNA的提取及RNA浓度、完整性检测 | 第25-26页 |
| 2.2.2 cDNA文库构建及上机测序 | 第26页 |
| 2.2.3 数据的组装 | 第26-27页 |
| 2.2.4 功能注释 | 第27页 |
| 2.2.5 CDS预测 | 第27页 |
| 2.2.6 SSR分析 | 第27-28页 |
| 2.3 结果与分析 | 第28-42页 |
| 2.3.1 RNA浓度和完整性检测 | 第28-29页 |
| 2.3.2 测序结果及从头组装 | 第29-31页 |
| 2.3.3 功能注释 | 第31-32页 |
| 2.3.4 功能分类 | 第32-35页 |
| 2.3.5 CDS预测 | 第35-39页 |
| 2.3.6 SSR位点信息分析 | 第39-42页 |
| 2.4 结论与讨论 | 第42-45页 |
| 第三章 滇山茶异源多倍体与亲本间基因差异表达分析 | 第45-69页 |
| 3.1 实验方法 | 第45-46页 |
| 3.1.1 基因表达量统计 | 第45页 |
| 3.1.2 差异表达基因的筛选 | 第45页 |
| 3.1.3 差异表达基因的富集分析 | 第45-46页 |
| 3.2 结果与分析 | 第46-64页 |
| 3.2.1 基因表达的总体情况 | 第46-48页 |
| 3.2.2 差异表达基因的筛选 | 第48-49页 |
| 3.2.3 差异表达基因的功能分析 | 第49-53页 |
| 3.2.4 与倍性相关的差异表达基因 | 第53-55页 |
| 3.2.5 异源多倍体中基因非加性表达情况 | 第55-59页 |
| 3.2.6 异源多倍体中亲本表达显性 | 第59-62页 |
| 3.2.7 异源多倍体中基因沉默与新基因的表达 | 第62-64页 |
| 3.3 讨论 | 第64-69页 |
| 3.3.1 多倍体与亲本基因差异表达情况 | 第64-65页 |
| 3.3.2 多倍体与亲本差异基因表达的特点 | 第65-69页 |
| 第四章 结论与展望 | 第69-73页 |
| 4.1 本文主要结论 | 第69-71页 |
| 4.1.1 滇山茶叶片转录组学分析 | 第69-70页 |
| 4.1.2 滇山茶异源多倍体与亲本间基因差异表达分析 | 第70-71页 |
| 4.2 存在的不足 | 第71-72页 |
| 4.2.1 滇山茶亲本种的实验材料有限 | 第71页 |
| 4.2.2 关键差异表达基因的分析深度有待进一步拓展 | 第71页 |
| 4.2.3 差异表达基因未展开Q-PCR验证 | 第71-72页 |
| 4.3 展望 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-83页 |
| 附录A：攻读学位期间发表论文目录 | 第83-85页 |
| 附录B：图表索引 | 第85-89页 |
| 附录C：附表 | 第89页 |
