亲和体蛋白聚类研究和信息库构建
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-21页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-15页 |
| 1.1.1 生物信息学 | 第11-12页 |
| 1.1.2 蛋白质组学 | 第12页 |
| 1.1.3 亲和体蛋白 | 第12-15页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第15-19页 |
| 1.2.1 亲和体蛋白的筛选和应用 | 第15-16页 |
| 1.2.2 生物信息学中的聚类算法 | 第16-17页 |
| 1.2.3 蛋白质相关数据库 | 第17-19页 |
| 1.3 论文的主要工作及组织结构 | 第19-21页 |
| 第二章 相关理论和技术 | 第21-33页 |
| 2.1 蛋白质和蛋白质相互作用 | 第21-24页 |
| 2.1.1 蛋白质组成和结构 | 第21-23页 |
| 2.1.2 蛋白质相互作用 | 第23-24页 |
| 2.2 聚类算法 | 第24-28页 |
| 2.2.1 两步聚类 | 第24-25页 |
| 2.2.2 K ohonen网络聚类 | 第25-26页 |
| 2.2.3 K- means聚类 | 第26-27页 |
| 2.2.4 X- means聚类 | 第27页 |
| 2.2.5 系统聚类 | 第27-28页 |
| 2.3 聚类工具 | 第28-32页 |
| 2.3.1 SPSS | 第28-29页 |
| 2.3.2 C le ment ine | 第29-31页 |
| 2.3.3 Weka | 第31-32页 |
| 2.4 本章小结 | 第32-33页 |
| 第三章亲和体蛋白聚类分析方法 | 第33-47页 |
| 3.1 总体思路和流程设计 | 第33-35页 |
| 3.1.1 总体思路 | 第33页 |
| 3.1.2 流程设计 | 第33-35页 |
| 3.2 氨基酸分类 | 第35-38页 |
| 3.3 亲和体蛋白编码 | 第38-41页 |
| 3.3.1 氨基酸指数编码方法 | 第39-40页 |
| 3.3.2 氨基酸疏水值编码方法 | 第40-41页 |
| 3.3.3 氨基酸组成编码方法 | 第41页 |
| 3.4 综合聚类分析 | 第41-45页 |
| 3.4.1 生成阶段 | 第42-43页 |
| 3.4.2 集成阶段 | 第43-45页 |
| 3.5 本章小结 | 第45-47页 |
| 第四章 实验结果和分析 | 第47-72页 |
| 4.1 亲和体蛋白聚类结果和分析 | 第47-67页 |
| 4.1.1 氨基酸分2类时的聚类结果和分析 | 第47-57页 |
| 4.1.2 氨基酸分4类时的聚类结果和分析 | 第57-61页 |
| 4.1.3 氨基酸分11类时的聚类结果和分析 | 第61-64页 |
| 4.1.4 序列完全展开时的聚类结果和分析 | 第64-67页 |
| 4.2 聚类效果评测 | 第67-71页 |
| 4.3 本章小结 | 第71-72页 |
| 第五章 亲和体蛋白信息库设计实现 | 第72-81页 |
| 5.1 需求分析 | 第72-73页 |
| 5.2 系统设计 | 第73-80页 |
| 5.2.1 数据库设计 | 第73-74页 |
| 5.2.2 系统总体架构 | 第74-75页 |
| 5.2.3 系统前台设计 | 第75-78页 |
| 5.2.4 系统后台设计 | 第78-80页 |
| 5.3 本章小结 | 第80-81页 |
| 总结与展望 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-90页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 附页 | 第92页 |
