| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第13-21页 |
| 1.1 AIV的简介 | 第13页 |
| 1.2 AIV的主要检测技术 | 第13-15页 |
| 1.2.1 病毒的分离鉴定 | 第13页 |
| 1.2.2 血清学诊断技术 | 第13-14页 |
| 1.2.3 分子生物学检测 | 第14-15页 |
| 1.2.4 高通量测序技术 | 第15页 |
| 1.3 AIV的致病性及致病性分子基础 | 第15-18页 |
| 1.3.1 HA蛋白 | 第16页 |
| 1.3.2 NA蛋白 | 第16-17页 |
| 1.3.3 PB2蛋白 | 第17页 |
| 1.3.4 PB1蛋白 | 第17页 |
| 1.3.5 PA蛋白 | 第17页 |
| 1.3.6 NS1蛋白 | 第17-18页 |
| 1.3.7 M1蛋白 | 第18页 |
| 1.3.8 PB1-F2蛋白 | 第18页 |
| 1.3.9 PA-X蛋白 | 第18页 |
| 1.4 禽流感的流行病学 | 第18-20页 |
| 1.4.1 全球禽流感流行现况 | 第18-19页 |
| 1.4.2 我国禽流感流行动态 | 第19页 |
| 1.4.3 野鸟在全球禽流感流行中的角色 | 第19-20页 |
| 1.5 本实验研究目的及意义 | 第20-21页 |
| 第二章 NGS在AIV检测中的应用 | 第21-31页 |
| 2.1 材料 | 第21页 |
| 2.1.1 样品 | 第21页 |
| 2.1.2 主要试剂及仪器 | 第21页 |
| 2.2 方法 | 第21-23页 |
| 2.2.1 引物的设计与合成 | 第21页 |
| 2.2.2 病毒RNA的提取 | 第21-22页 |
| 2.2.3 反转录合成cDNA | 第22页 |
| 2.2.4 聚合酶链式反应(PCR)扩增病毒各节段 | 第22页 |
| 2.2.5 PCR产物的鉴定与纯化 | 第22-23页 |
| 2.2.6 Illumina高通量测序及生物信息学分析 | 第23页 |
| 2.3 结果 | 第23-30页 |
| 2.3.1 PCR产物的鉴定 | 第23-24页 |
| 2.3.2 测序质量控制分析 | 第24-29页 |
| 2.3.3 参考序列比对与质量分析 | 第29-30页 |
| 2.4 讨论 | 第30-31页 |
| 第三章 野鸟源H5亚型HPAIVS的遗传演化分析 | 第31-58页 |
| 3.1 试验材料 | 第31-32页 |
| 3.1.1 病毒株 | 第31页 |
| 3.1.2 主要试剂及仪器 | 第31-32页 |
| 3.1.3 实验动物 | 第32页 |
| 3.1.4 引物与参考序列 | 第32页 |
| 3.2 方法 | 第32-34页 |
| 3.2.1 病毒RNA的提取及反转录合成cDNA | 第32页 |
| 3.2.2 聚合酶链式反应(PCR)扩增病毒各节段 | 第32-33页 |
| 3.2.3 PCR产物的鉴定与纯化 | 第33页 |
| 3.2.4 各节段核酸序列的测定 | 第33页 |
| 3.2.5 利用磁珠法纯化测序反应产物 | 第33-34页 |
| 3.2.6 各节段序列的拼接和进化树构建 | 第34页 |
| 3.3 试验结果 | 第34-55页 |
| 3.3.1 HA节段特征及遗传演化分析 | 第34-38页 |
| 3.3.2 NA节段特征及遗传演化分析 | 第38-43页 |
| 3.3.3 内部基因节段特征及遗传演化分析 | 第43-54页 |
| 3.3.4 基因型的划分 | 第54-55页 |
| 3.4 讨论 | 第55-58页 |
| 第四章 野鸟源H5亚型HPAIVS对BALB/C小鼠的致病性研究 | 第58-64页 |
| 4.1 试验材料 | 第58页 |
| 4.1.1 病毒株 | 第58页 |
| 4.1.2 SPF胚及试验动物 | 第58页 |
| 4.1.3 生物安全性 | 第58页 |
| 4.2 方法 | 第58-59页 |
| 4.2.1 H5亚型AIVs的纯化 | 第58页 |
| 4.2.2 鸡胚半数感染量(EID_(50))测定 | 第58-59页 |
| 4.2.3 BALB/c小鼠的感染与致病性试验 | 第59页 |
| 4.3 结果 | 第59-63页 |
| 4.3.1 病毒MLD50的测定 | 第59-60页 |
| 4.3.2 小鼠各脏器中病毒复制情况 | 第60-62页 |
| 4.3.3 不同AIVs感染后小鼠体重变化情况 | 第62-63页 |
| 4.4 讨论 | 第63-64页 |
| 第五章 全文结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 作者简介 | 第72页 |
