| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-19页 |
| 1.1 辣椒园艺性状的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.1.1 辣椒的起源与分类 | 第13页 |
| 1.1.2 辣椒园艺性状遗传位点的研究进展 | 第13-14页 |
| 1.1.3 传统QTL定位存在的问题 | 第14页 |
| 1.2 全基因组关联分析 | 第14-17页 |
| 1.2.1 全基因组关联分析的提出 | 第15页 |
| 1.2.2 全基因组关联分析的基本原理和优势 | 第15页 |
| 1.2.3 连锁不平衡的意义和计算方法 | 第15页 |
| 1.2.4 全基因组关联分析基本路线 | 第15-16页 |
| 1.2.5 全基因组关联分析在植物中的应用 | 第16-17页 |
| 1.3 全基因组关联分析在辣椒作物中的应用 | 第17页 |
| 1.4 本研究的目的和技术路线 | 第17-19页 |
| 1.4.1 研究目的 | 第17-18页 |
| 1.4.2 技术路线 | 第18-19页 |
| 第二章 我国辣椒核心种质主要园艺性状多样性的分析和评价 | 第19-27页 |
| 2.1 材料与方法 | 第19-21页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第19页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第19-21页 |
| 2.2 结果与分析 | 第21-25页 |
| 2.2.1 我国辣椒核心种质主要园艺性状的多样性分析 | 第21-23页 |
| 2.2.1.1 质量性状多样性 | 第21-22页 |
| 2.2.1.2 数量性状多样性 | 第22-23页 |
| 2.2.2 我国辣椒核心种质主要园艺性状的聚类分析 | 第23-25页 |
| 2.3 结论与讨论 | 第25-27页 |
| 2.3.1 我国辣椒核心种质主要园艺性状的多样性 | 第25-26页 |
| 2.3.2 我国辣椒核心种质植物学性状的聚类比较 | 第26-27页 |
| 第三章 我国辣椒核心种质基于全基因组SNP的群体结构分析 | 第27-34页 |
| 3.1 材料与方法 | 第27-28页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第27页 |
| 3.1.2 测序样品的制备 | 第27页 |
| 3.1.3 全基因组高倍重测序 | 第27-28页 |
| 3.1.4 测序数据与参考基因组的比对分析 | 第28页 |
| 3.1.5 我国辣椒核心种质进化树的构建 | 第28页 |
| 3.1.6 我国辣椒核心种质主成分分析 | 第28页 |
| 3.1.7 我国辣椒核心种质群体结构分析 | 第28页 |
| 3.2 结果与分析 | 第28-32页 |
| 3.2.1 全基因组SNPs的鉴定 | 第28-30页 |
| 3.2.2 我国辣椒核心种质群体进化树分析 | 第30-31页 |
| 3.2.3 我国辣椒核心种质群体主成分分析 | 第31页 |
| 3.2.4 我国辣椒核心种质群体结构分析 | 第31-32页 |
| 3.3 讨论 | 第32-34页 |
| 3.3.1 SNP标记的挖掘 | 第32页 |
| 3.3.2 群体结构分析 | 第32-34页 |
| 第四章 我国辣椒核心种质主要园艺性状的全基因组关联分析 | 第34-45页 |
| 4.1 材料与方法 | 第34-35页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第34页 |
| 4.1.2 主要园艺性状的调查 | 第34页 |
| 4.1.3 全基因组高倍重测序 | 第34页 |
| 4.1.4 连锁不平衡分析 | 第34-35页 |
| 4.1.5 全基因组关联分析 | 第35页 |
| 4.2 结果与分析 | 第35-43页 |
| 4.2.1 表型鉴定 | 第35-36页 |
| 4.2.2 连锁不平衡分析 | 第36页 |
| 4.2.3 主要园艺性状关联分析 | 第36-43页 |
| 4.3 结论与讨论 | 第43-45页 |
| 4.3.1 表型调查相关性的讨论 | 第43页 |
| 4.3.2 连锁不平衡程度 | 第43页 |
| 4.3.3 全基因组关联分析 | 第43-45页 |
| 第五章 全文结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-53页 |
| 附录 | 第53-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 作者简历 | 第66页 |
