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EDCs暴露对稀有鮈鲫脑中生殖调控相关基因表达及转录组的影响

摘要第6-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 文献综述第15-38页
    1.1 前言第15页
    1.2 下丘脑-垂体-性腺轴研究进展第15-26页
        1.2.1 促性腺激素释放激素及其受体研究进展第16-20页
        1.2.2 促性腺激素及其受体研究进展第20-23页
        1.2.3 性类固醇激素及其受体研究进展第23-26页
    1.3 内分泌干扰物(EDCs)对 HPG 轴相关基因的影响第26-30页
        1.3.1 激素与环境激素第26-27页
        1.3.2 内分泌干扰物危害第27-28页
        1.3.3 内分泌干扰物与 HPG 轴关系第28-29页
        1.3.4 受试化合物的选择第29-30页
    1.4 实时定量 PCR第30-33页
        1.4.1 传统内参基因第31-32页
        1.4.2 内参基因表达稳定性的评价第32-33页
    1.5 Illumina 测序技术在鱼类研究中的应用第33-36页
        1.5.1 Illumina/Solexa 测序技术第33-34页
        1.5.2 转录组测序的用途及在硬骨鱼类研究上的应用第34-36页
    1.6 实验材料的选择第36-37页
        1.6.1 鱼类在内分泌干扰实验中的研究应用第36页
        1.6.2 稀有鮈鲫作为内分泌干扰实验材料的优点第36-37页
    1.7 选题的目的和意义第37-38页
第二章 稀有鮈鲫内参基因筛选第38-53页
    2.1 引言第38页
    2.2 材料与方法第38-42页
        2.2.1 实验材料第38-39页
        2.2.2 试验方法第39-42页
        2.2.3 数据分析第42页
    2.3 结果第42-50页
        2.3.1 稀有鮈鲫内参基因的克隆和实时定量引物检测第42-44页
        2.3.2 内参基因稳定性分析第44-48页
        2.3.3 cyp19a1b 基因表达的 qRT-PCR 分析第48-50页
    2.4 讨论第50-52页
    2.5 小结第52-53页
第三章 稀有鮈鲫促性腺激素释放激素、促性腺激素及其受体的基因克隆和组织表达第53-76页
    3.1 前言第53页
    3.2 材料与方法第53-57页
        3.2.1 实验材料第53页
        3.2.2 试验方法第53-57页
        3.2.3 生物信息学分析及数据分析第57页
    3.3 结果第57-73页
        3.3.1 总 RNA 的检测第57-58页
        3.3.2 稀有鮈鲫 GnRH2、GnRH3、GnRHR1A、GnRHR1B、FSHβ、LHβ、FSHR和 LHR 基因全长 cDNA 分子克隆第58页
        3.3.3 稀有鮈鲫 GnRH2、GnRH3、GnRHR1A、GnRHR1B、FSHβ、LHβ、FSHR和 LHR 序列特征分析第58-63页
        3.3.4 稀有鮈鲫 GnRHs、GnRHRs、GtHβs 和 GtHRs 氨基酸序列相似性分析第63-66页
        3.3.5 稀有鮈鲫 GnRHs 和 GnRHR1s 基因系统发育分析第66-69页
        3.3.6 GnRH2、GnRH3、GnRHR1A、GnRHR1B、FSHβ、LHβ、FSHR 和 LHR 的组织表达分析第69-73页
    3.4 讨论第73-75页
        3.4.1 GnRH 基因的结构与功能第73-74页
        3.4.2 GnRHR 基因的结构与功能第74页
        3.4.3 GtH 基因的结构与功能第74-75页
        3.4.4 GtHR 基因的结构与功能第75页
    3.5 小结第75-76页
第四章 双酚 A 对稀有鮈鲫 GnRH 系统和 GtH 系统基因表达的影响第76-90页
    4.1 引言第76页
    4.2 材料与方法第76-78页
        4.2.1 实验材料第76-77页
        4.2.2 试验方法第77-78页
        4.2.3 统计学分析及启动子区分析第78页
    4.3 结果第78-86页
        4.3.1 性腺组织学第78-79页
        4.3.2 总 RNA 的提取与检测第79-80页
        4.3.3 BPA 对 cyp19a1a、GnRH2、GnRH3、GnRHR1A、GnRHR1B、FSHβ、LHβ、FSHR 和 LHR 基因表达模式的影响第80-83页
        4.3.4 GnRH2、GnRH3、FSHβ、LHβ 5’端调控序列的分子克隆及分析第83-86页
    4.4 讨论第86-89页
        4.4.1 BPA 暴露对稀有鲫性腺的影响第87页
        4.4.2 BPA 暴露对稀有鮈鲫 GnRH 系统和 GtH 系统的影响第87-88页
        4.4.3 5’端转录元件与 GnRH 表达的关系第88-89页
    4.5 小结第89-90页
第五章 17α-乙炔雌二醇对稀有鮈鲫 GtH 系统基因表达的影响第90-97页
    5.1 引言第90页
    5.2 材料与方法第90-91页
        5.2.1 实验材料第90页
        5.2.2 试验方法第90页
        5.2.3 数据分析第90-91页
    5.3 结果第91-93页
        5.3.1 总 RNA 的检测第91页
        5.3.2 EE2 对脑中雌激素受体和促性腺激素β亚基基因表达的影响第91-92页
        5.3.3 EE2 对性腺中 cyp19a1a 和促性腺激素受体基因表达的影响第92页
        5.3.4 EE2 暴露后目的基因相关性分析第92-93页
    5.4 讨论第93-96页
        5.4.1 EDCs 处理对脑中 FSHβ、LHβ和雌激素受体基因表达的影响第93-95页
        5.4.2 EDCs 暴露对稀有鮈鲫性腺中 cyp19a1a、FSHR 和 LHR 基因表达的影响第95-96页
        5.4.3 5’端转录元件与 GtHβ表达的关系第96页
    5.5 小结第96-97页
第六章 高通量测序技术分析 EE2 对稀有鮈鲫脑组织转录组的影响第97-127页
    6.1 引言第97页
    6.2 材料与方法第97-103页
        6.2.1 实验材料第97-98页
        6.2.2 试验方法第98-100页
        6.2.3 数据分析第100-103页
    6.3 结果第103-120页
        6.3.1 总 RNA 的检测第103-104页
        6.3.2 脑组织基因表达谱高通量测序数据第104页
        6.3.3 高通量测序序列分布规律第104-105页
        6.3.4 高通量测序序列映射比对分析第105页
        6.3.5 稀有鮈鲫脑组织差异表达基因筛选第105-108页
        6.3.6 EE2 诱导下脑组织差异基因 GO 富集分析第108-111页
        6.3.7 EE2 诱导下脑组织通路显著性富集分析第111-118页
        6.3.8 稀有鮈鲫脑中 DGE 测序结果可靠性验证第118-120页
    6.4 讨论第120-125页
        6.4.1 脑组织基因表达谱构建第120页
        6.4.2 脑组织基因表达谱高通量测序数据第120-121页
        6.4.3 EE2 诱导对稀有鮈鲫脑组织中生殖调控相关基因的影响第121页
        6.4.4 EE2 暴露对稀有鮈鲫脑组织氧化磷酸化通路的影响第121-122页
        6.4.5 EE2 暴露对稀有鮈鲫脑组织核糖体信号通路的影响第122-123页
        6.4.6 EE2 暴露对稀有鮈鲫脑组织总代谢通路的影响第123-124页
        6.4.7 EE2 暴露影响的能量代谢脑中 GnRH 神经元的影响第124-125页
        6.4.8 EE2 暴露对稀有鮈鲫脑组织性别差异第125页
    6.5 小结第125-127页
结论、创新点与展望第127-129页
    结论第127页
    创新点第127-128页
    展望第128-129页
参考文献第129-153页
附录第153-161页
缩略词第161-164页
附表第164-180页
附图第180-182页
致谢第182-183页
作者简介第183页

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