| 摘要 | 第6-8页 |
| abstract | 第8-9页 |
| 第1章 绪论 | 第12-23页 |
| 1.1 p53与肿瘤 | 第12-15页 |
| 1.1.1 p53结构与功能 | 第12-14页 |
| 1.1.2 p53与DNA损伤 | 第14页 |
| 1.1.3 p53介导的肿瘤相关生物进程和信号通路 | 第14-15页 |
| 1.2 MicroRNA与肿瘤 | 第15-18页 |
| 1.2.1 miRNA生物学合成与作用机制 | 第15-17页 |
| 1.2.2 miRNA生物学功能 | 第17页 |
| 1.2.3 miRNA与肿瘤 | 第17-18页 |
| 1.3 p53与microRNA调控网络 | 第18-20页 |
| 1.3.1 p53-microRNA调控 | 第18-19页 |
| 1.3.2 p53-microRNA网络研究进展 | 第19-20页 |
| 1.4 课题研究目的、意义和内容 | 第20-23页 |
| 1.4.1 本课题的研究目的和意义 | 第20页 |
| 1.4.2 本课题的研究内容 | 第20-22页 |
| 1.4.3 本课题创新点 | 第22-23页 |
| 第2章 肝癌细胞中DNA损伤诱导下p53调控microRNA的高通量筛选 | 第23-48页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23-32页 |
| 2.1.1 细胞培养与阿霉素药物处理 | 第23-25页 |
| 2.1.2 mRNA水平检测DNA损伤应激条件下p53与p21表达变化 | 第25-28页 |
| 2.1.3 蛋白水平检测DNA损伤应激条件下p53表达情况 | 第28-30页 |
| 2.1.4 小RNA测序样品的制备 | 第30-31页 |
| 2.1.5 sRNA文库构建与测序数据分析 | 第31-32页 |
| 2.1.6 差异表达miRNA筛选 | 第32页 |
| 2.1.7 miRNA的疾病功能分析 | 第32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-46页 |
| 2.2.1 DNA损伤应激条件下p53与下游靶基因表达活化 | 第32-37页 |
| 2.2.2 小RNA测序样本总RNA纯度及完整性鉴定 | 第37-38页 |
| 2.2.3 小RNA长度分布、碱基偏好性和染色体分布特征 | 第38-41页 |
| 2.2.4 HepG2细胞中受p53调控的差异表达miRNA筛选 | 第41-44页 |
| 2.2.5 mir2disease介导的疾病功能分析 | 第44-46页 |
| 2.3 讨论 | 第46-47页 |
| 2.4 本章小结 | 第47-48页 |
| 第3章 p53调控差异表达miRNA靶基因预测与功能分析 | 第48-66页 |
| 3.1 材料与方法 | 第48-52页 |
| 3.1.1 miRNA靶基因预测 | 第48页 |
| 3.1.2 Gene Ontology和KEGG通路富集分析 | 第48-49页 |
| 3.1.3 p53结合位点ChIP-seq数据分析 | 第49页 |
| 3.1.4 p53-miRNA-mRNA调控网络构建 | 第49页 |
| 3.1.5 差异表达miRNA的qRT-PCR验证 | 第49-51页 |
| 3.1.6 miR-3661对肝癌细胞HepG2增殖的影响 | 第51-52页 |
| 3.2 结果与分析 | 第52-64页 |
| 3.2.1 miRNA靶基因预测结果 | 第52页 |
| 3.2.2 GO功能注释结果 | 第52-54页 |
| 3.2.3 KEGG信号通路富集分析结果 | 第54-56页 |
| 3.2.4 p53-miRNA结合位点识别 | 第56-58页 |
| 3.2.5 p53-miRNA-mRNA调控网络构建 | 第58-60页 |
| 3.2.6 差异表达miRNA qRT-PCR验证结果 | 第60-62页 |
| 3.2.7 miR-3661抑制HepG2细胞增殖 | 第62-64页 |
| 3.3 讨论 | 第64-65页 |
| 3.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 结论 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-77页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第77页 |
