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群体微囊藻XW01无菌化培养及全基因组测序

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第1章 前言第9-19页
    1 蓝藻的概述第9-10页
        1.1 蓝藻的危害第9页
        1.2 蓝藻与环境微生物共生的方式第9-10页
    2 微囊藻主要无菌化方法及无菌化研究进展第10-13页
        2.1 物理方法第10-11页
        2.2 化学方法第11-12页
        2.3 抗生素的使用第12-13页
    3 基因组和蓝藻基因组学研究进展第13-17页
        3.1 蓝藻基因组学研究进展第13-15页
        3.2 蓝藻基因组学研究第15-17页
            3.2.1 蓝藻结构基因组学的研究第16-17页
            3.2.2 蓝藻功能基因组学的研究第17页
    4 本论文研究的目的及意义第17-18页
    5 技术路线第18-19页
第2章 不同方法纯化群体铜绿微囊藻XW01的比较研究第19-44页
    第1节 常规物理方法分离纯化铜绿微囊藻XW01效果比较第19-24页
        1 实验材料第19页
            1.1 实验藻种第19页
            1.2 藻种培养第19页
        2 实验方法第19-20页
            2.1 藻液中藻细胞与细菌数量的测定第20页
            2.2 常规物理方法常规物理方法分离纯化铜绿微囊藻XW01第20页
                2.2.1 离心洗涤法第20页
                2.2.2 稀释划线法第20页
                2.2.3 超声波震荡洗涤法第20页
            2.3 数据计算及统计分析第20页
        3 结果与分析第20-24页
            3.1 微囊藻培养过程中细菌含量的变化第20-21页
            3.2 常规物理方法常规物理方法分离纯化铜绿微囊藻XW01第21-23页
                3.2.1 离心洗涤除菌效果分析第21-22页
                3.2.2 稀释平板法除菌效果分析第22-23页
                3.2.3 超声波震荡洗涤法除菌效果分析第23页
            3.3 常规物理纯化方法除菌效果的比较与分析第23-24页
        4 讨论第24页
    第2节 抗生素处理法纯化微囊藻XW01第24-39页
        1 实验化学试剂第25-26页
        2 实验方法第26-28页
            2.1 抗生素对XW01生长的影响第26页
            2.2 XW01藻液中细菌的分离鉴定第26-27页
                2.2.1 菌种的培养第26页
                2.2.2 细菌基因组DNA的提取第26页
                2.2.3 16S rDNA序列扩增第26-27页
                2.2.4 16S rDNA序列测定第27页
            2.3 分离细菌对抗生素的敏感性检测第27页
            2.4 抗生素除菌时间的选择第27-28页
            2.5 抗生素作用后藻的处理第28页
        3 结果与分析第28-38页
            3.1 五种抗生素对XW01生长的影响第28-31页
            3.2 XW01藻液中细菌的分离鉴定结果第31-35页
                3.2.1 附生细菌的分离培养结果第31-32页
                3.2.2 菌株PCR检测结果第32-33页
                3.2.3 序列分析结果第33-35页
            3.3 分离细菌对抗生素的敏感性检测结果第35-36页
            3.4 抗生素除菌时间的选择结果第36-37页
            3.5 抗生素作用后藻的处理结果第37-38页
        4 讨论第38-39页
    第3节 紫外(UV)照射处理法纯化微囊藻第39-44页
        1 实验方法第39-40页
            1.1 实验室培养藻紫外(UV)照射除菌第39-40页
            1.2 阳光(UV)诱导处理第40页
            1.3 抗生素结合UV照射的除菌效果第40页
        2 实验结果第40-43页
            2.1 实验室培养藻紫外(UV)照射除菌结果分析第40-41页
            2.2 阳光(UV)诱导处理结果分析第41页
            2.3 抗生素结合UV照射的除菌效果分析第41-43页
        3 讨论第43-44页
第3章 群体微囊藻XW01全基因组测序第44-56页
    1 实验材料第44页
        1.1 实验试剂第44页
        1.2 实验仪器第44页
    2 实验方法第44-48页
        2.1 提取XW01基因组DNA第44-45页
        2.2 Illumina Hiseq2000测序流程第45-46页
        2.3 序列组装及生物信息学分析第46-48页
            2.3.1 组装第46-47页
            2.3.2 基因组组分分析第47-48页
            2.3.4 比较基因组分析第48页
    3 实验结果第48-55页
        3.1 电泳图谱第48页
        3.2 基因组概述第48-49页
            3.2.1 测序的基本数据第48-49页
            3.2.2 测序数据的处理和结果第49页
        3.3 基因组组分分析第49-51页
            3.3.1 基因成分分析第49-50页
            3.3.2 重复序列分析第50-51页
            3.3.3 非编码RNA第51页
        3.4 基因功能分析-通用功能注释第51-53页
        3.5 比较基因组分析结果第53-55页
    4 讨论第55-56页
本文小结第56-57页
参考文献第57-64页
附录第64-65页
在读期间发表的学术论文及研究成果第65-66页
致谢第66页

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