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水稻/玉米CIPK基因家族的比较和水稻锌指蛋白基因ZFP252功能研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
第一部分 文献综述第11-34页
    第一章 植物逆境相关CBL-CIPK信号系统的研究进展第12-24页
        1 CBL-CIPK信号系统的构成和结构特征第12-16页
            1.1 CBL家族及其结构特征第12-14页
            1.2 CIPK家族及其结构特征第14-16页
        2 CBL-CIPK信号系统的进化第16-17页
        3 CBL-CIPK信号系统的亚细胞定位第17-18页
            3.1 CBL蛋白的亚细胞定位第17页
            3.2 CBL-CIPK蛋白复合体的亚细胞定位第17-18页
        4 CBL-CIPK信号系统的特异性机制第18-20页
            4.1 CBL-CIPK对钙信号的识别第18-19页
            4.2 CBL-CIPK的互作方式第19页
            4.3 CBL-CIPK对靶蛋白的调控第19-20页
        5 CBL-CIPK信号系统在植物逆境应答中的功能第20-24页
            5.1 盐胁迫下CBL-CIPK的应答第20-21页
            5.2 低钾胁迫下CBL-CIPK的应答第21页
            5.3 水淹胁迫下CBL-CIPK的应答第21-22页
            5.4 干旱胁迫下CBL-CIPK的应答第22-23页
            5.5 高pH胁迫下CBL-CIPK的应答第23-24页
    第二章 植物锌指蛋白转录因子的抗逆性研究进展第24-34页
        1 锌指蛋白转录因子的结构特征第26页
        2 锌指蛋白转录因子的调控机理第26-27页
        3 锌指蛋白转录因子在植物抗逆应答中的功能第27-34页
            3.1 拟南芥Zat和AZF第27-30页
            3.2 水稻ZFP和DST第30-31页
            3.3 矮牵牛ZPT第31页
            3.4 大豆SCOF-1、辣椒CAZFP1和杨树PtaZFP2第31-34页
第二部分 研究报告第34-93页
    第三章 水稻与玉米CIPK基因家族的比较分析第35-53页
        1 材料与方法第36-39页
            1.1 玉米的培养和逆境处理第36页
            1.2 玉米CIPK基因的搜索和序列分析第36-37页
            1.3 Alignment与系统进化分析第37页
            1.4 基于UniGene/EST的基因表达分析第37页
            1.5 基于Microarray的逆境下基因表达分析第37-38页
            1.6 逆境相关的顺式作用元件分析第38页
            1.7 第一链cDNA的合成和半定量RT-PCR第38-39页
        2 结果与分析第39-50页
            2.1 玉米CIPK基因家族的鉴定第39页
            2.2 水稻和玉米CIPK基因的结构比较第39-42页
            2.3 水稻和玉米CIPK蛋白比较第42页
            2.4 水稻和玉米CIPK家族的进化比较第42-45页
            2.5 水稻和玉米CIPK基因的组织表达比较第45-47页
            2.6 逆境下水稻和玉米CIPK基因的表达比较第47-50页
        3 讨论第50-53页
            3.1 关于水稻和玉米CIPK基因家族的进化第50-52页
            3.2 关于水稻和玉米CIPK基因的表达第52-53页
    第四章 过表达ZFP252转基因水稻的转录组分析第53-77页
        1 材料与方法第54-62页
            1.1 水稻培养和胁迫处理第54-55页
            1.2 Southern杂交第55-56页
            1.3 总RNA的提取第56页
            1.4 芯片杂交第56-59页
            1.5 芯片数据处理和生物信息学分析第59页
            1.6 基因的启动子元件分析第59-60页
            1.7 基因位点的耐逆相关QTL分析第60页
            1.8 基因表达的PCR分析第60-62页
        2 结果与分析第62-71页
            2.1 基因芯片材料分析第62-63页
            2.2 基因芯片的数据统计和Realtime-PCR验证第63-64页
            2.3 差异表达基因的功能分类和Pathway分析第64-66页
            2.4 差异表达基因的启动子元件分析第66-67页
            2.5 差异表达基因位点与水稻耐盐、旱QTL的比较第67-68页
            2.6 ZFP252下游调控基因的筛选第68页
            2.7 ZFP252下游调控基因的表达分析第68-71页
        3 讨论第71-77页
            3.1 RING型锌指蛋白OsRING-1第72-73页
            3.2 肿瘤坏死因子受体相关因子(TRAF)第73页
            3.3 同源异型盒结构域(Homeodomain,HD)第73-74页
            3.4 囊泡相关的膜蛋白(VAMP)第74-77页
    第五章 过表达ZFP252转基因水稻的蛋白组分析第77-93页
        1 材料与方法第78-83页
            1.1 植物材料的培养第78页
            1.2 水稻总蛋白的提取第78-79页
            1.3 第一向等电聚焦第79页
            1.4 第二向SDS-PAGE电泳第79-80页
            1.5 染色第80页
            1.6 图像扫描分析第80-81页
            1.7 差异蛋白的胶内酶解第81页
            1.8 MALDI-TOF/TOF质谱分析和数据库搜索第81-82页
            1.9 差异蛋白的基因表达分析第82-83页
        2 结果与分析第83-88页
            2.1 蛋白双向电泳的效果分析第83-84页
            2.2 野生型和转基因水稻的蛋白组比较第84-86页
            2.3 差异表达蛋白点的质谱鉴定第86-88页
            2.4 差异蛋白的基因表达分析第88页
        3 讨论第88-93页
            3.1 关于蛋白双向技术的分离效果第88-89页
            3.2 关于差异表达蛋白的功能第89-90页
            3.3 关于ZFP252的抗逆机制第90-93页
参考文献第93-105页
附录第105-115页
攻读博士期间发表或待发表的研究论文第115-117页
致谢第117页

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