| 目录 | 第4-7页 |
| 中文摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第零章 绪论 | 第14-39页 |
| 1 前言 | 第14-15页 |
| 2 文献综述 | 第15-38页 |
| 2.1 亚洲栽培稻的起源和亚种分化 | 第15-21页 |
| 2.1.1 稻属植物的种类 | 第15页 |
| 2.1.2 起源和驯化(domestication) | 第15页 |
| 2.1.3 栽培稻的亚种分化 | 第15-21页 |
| 2.1.3.1 亚洲栽培稻的亚种分类和遗传分化 | 第15-17页 |
| 2.1.3.2 单系(monophyletic)起源论 | 第17-18页 |
| 2.1.3.3 二系(diphyletic)或多系(polyphyletic)起源论 | 第18-20页 |
| 2.1.3.4 亚洲栽培稻的起源中心 | 第20-21页 |
| 2.2 水稻杂种不育及广亲和的遗传研究 | 第21-26页 |
| 2.2.1 生殖隔离及Bateson-Dobzhansky-Muller模型 | 第21-23页 |
| 2.2.2 水稻杂种不育 | 第23-24页 |
| 2.2.3 水稻的广亲和性 | 第24-26页 |
| 2.2.3.1 广亲和性的鉴定 | 第25-26页 |
| 2.2.3.2 水稻广亲和性的相对性 | 第26页 |
| 2.3 水稻杂种不育及广亲和的遗传模型 | 第26-29页 |
| 2.3.1 重复隐性配子致死模型 | 第27页 |
| 2.3.2 等位基因互作模型 | 第27-29页 |
| 2.3.2.1 单位点孢子体-配子体互作模型 | 第27-28页 |
| 2.3.2.2 广亲和模型 | 第28-29页 |
| 2.4 杂种不育及广亲和基因克隆和分子机理研究 | 第29-33页 |
| 2.4.1 杂种雌配子不育及广亲和基因S5 | 第29-30页 |
| 2.4.2 杂种雄配子不育及广亲和基因Sa | 第30-31页 |
| 2.4.3 重复隐性雄配子致死基因DPL1/DPL2 | 第31-32页 |
| 2.4.4 重复隐性雄配子致死基因S27/S28 | 第32-33页 |
| 2.5 杂种偏分离研究进展 | 第33-38页 |
| 2.5.1 杂种偏分离现象 | 第33页 |
| 2.5.2 杂种偏分离的遗传研究 | 第33-37页 |
| 2.5.2.1 黑腹果蝇杂种偏分离(segregation distortion)系统 | 第33-35页 |
| 2.5.2.2 小鼠杂种偏分离(Transmission ratio distortion)系统 | 第35-36页 |
| 2.5.2.3 杂种偏分离系统的遗传模型 | 第36-37页 |
| 2.5.3 水稻杂种偏分离研究进展 | 第37-38页 |
| 3 研究目的和意义 | 第38-39页 |
| 第一章 水稻杂种胚囊不育及广亲和位点S5的基因互作研究 | 第39-109页 |
| 4 材料和方法 | 第40-52页 |
| 4.1 材料 | 第40-41页 |
| 4.1.1 水稻材料及简写 | 第40页 |
| 4.1.2 转化载体及菌株 | 第40页 |
| 4.1.3 BAC文库和cDNA | 第40页 |
| 4.1.4 试剂和耗材 | 第40-41页 |
| 4.2 方法 | 第41-52页 |
| 4.2.1 近等基因系的构建 | 第41页 |
| 4.2.2 S5遗传转化载体构建 | 第41-49页 |
| 4.2.2.1 S5 ORF4+互补载体构建 | 第41-44页 |
| 4.2.2.2 S5 ORF4抑制载体构建 | 第44-46页 |
| 4.2.2.3 S5 ORF5抑制载体构建 | 第46-49页 |
| 4.2.2.4 ORF4+超表达载体构建 | 第49页 |
| 4.2.3 农杆菌介导的遗传转化 | 第49页 |
| 4.2.4 水稻幼穗的葡聚糖处理 | 第49-50页 |
| 4.2.5 水稻材料基因型检测方法 | 第50页 |
| 4.2.6 水稻总RNA抽提和cDNA合成 | 第50-51页 |
| 4.2.7 水稻育性考察方法 | 第51-52页 |
| 5 结果与分析 | 第52-109页 |
| 5.1 水稻S5位点近等基因系构建及遗传分析 | 第52-56页 |
| 5.1.1 S5位点近等基因系构建方案和表示方法 | 第52页 |
| 5.1.2 S5位点近等基因系效应分析 | 第52-56页 |
| 5.1.2.1 纯合背景下的S5效应分析 | 第52-55页 |
| 5.1.2.2 杂合背景下的S5效应分析 | 第55-56页 |
| 5.2 水稻S5位点杂种不育及广亲和的基因互作研究 | 第56-103页 |
| 5.2.1 S5偏分离分析与研究新思路的形成 | 第58-75页 |
| 5.2.1.1 S5位点偏分离分析 | 第58-60页 |
| 5.2.1.2 S5-ORF5互作基因的精细定位 | 第60-63页 |
| 5.2.1.3 S5定位区域候选基因的序列比较 | 第63-75页 |
| 5.2.1.4 S5研究新思路-偏分离遗传模型 | 第75页 |
| 5.2.2 S5候选基因ORF3、ORF4和ORF5的功能验证 | 第75-91页 |
| 5.2.2.1 ORF3、ORF4和ORF5的生物信息分析 | 第76-80页 |
| 5.2.2.2 ORF3、ORF4、ORF5的转化策略及表示方法 | 第80-81页 |
| 5.2.2.3 互补转化验S5 ORF3基因功能 | 第81-85页 |
| 5.2.2.4 互补转化验证S5 ORF4基因功能 | 第85-86页 |
| 5.2.2.5 S5 ORF5和ORF4抑制(RNAi)效应分析 | 第86-89页 |
| 5.2.2.6 S5 ORF4+超表达效应分析 | 第89-91页 |
| 5.2.3 S5三基因的遗传多样性分析和进化思考 | 第91-94页 |
| 5.2.4 ORF3、ORF4和ORF5全生育期表达模式分析 | 第94-95页 |
| 5.2.5 S5遗传分析材料芯片表达谱数据分析 | 第95-101页 |
| 5.2.5.1 内质网胁迫反应基因分析 | 第96页 |
| 5.2.5.2 自免疫反应相关基因分析 | 第96-101页 |
| 5.2.6 S5的分子模型 | 第101-103页 |
| 5.3 对S5研究工作的思考 | 第103-109页 |
| 5.3.1 S5符合单位点孢子体-配子体互作模型 | 第103页 |
| 5.3.2 籼粳杂种不育：等位基因互作还是非等位基因互作? | 第103-105页 |
| 5.3.3 水稻杂种不育及广亲和的偏分离遗传模型 | 第105-107页 |
| 5.3.4 背景基因对S5偏分离的影响 | 第107-109页 |
| 第二章 水稻杂种花粉不育及广亲和基因f5的克隆 | 第109-138页 |
| 6 材料和方法 | 第110-114页 |
| 6.1 材料 | 第110-111页 |
| 6.1.1 水稻材料及简写 | 第110页 |
| 6.1.2 转化载体及菌株 | 第110页 |
| 6.1.3 BAC文库和cDNA | 第110-111页 |
| 6.2 方法 | 第111-114页 |
| 6.2.1 近等基因系的构建 | 第111页 |
| 6.2.2 f5遗传转化载体构建 | 第111-112页 |
| 6.2.2.1 f5 ORF2互补转化载体构建 | 第111-112页 |
| 6.2.2.2 f5 ORF2超表达载体构建 | 第112页 |
| 6.2.3 水稻基因组DNA抽提 | 第112-114页 |
| 7 结果与分析 | 第114-138页 |
| 7.1 杂种花粉不育位f570kb定位区段基因遗传转化 | 第114-117页 |
| 7.2 水稻f5位点近等基因系构建及遗传分析 | 第117-128页 |
| 7.2.1 f5位点近等基因系构建方案和表示方法 | 第117页 |
| 7.2.2 近等基因系构建过程 | 第117-118页 |
| 7.2.3 f5单位点近等基因系效应分析 | 第118-125页 |
| 7.2.3.1 纯合背景下的f5效应分析 | 第118-124页 |
| 7.2.3.2 杂合背景下的f5效应分析 | 第124-125页 |
| 7.2.4 f5和S5双位点近等基因系效应分析 | 第125-128页 |
| 7.2.4.1 纯合背景下的双位点(f5和S5)遗传分析 | 第125-127页 |
| 7.2.4.2 杂合背景下的双位点(f5和S5)遗传分析 | 第127-128页 |
| 7.3 f5候选基因ORF1、ORF2的功能验证 | 第128-135页 |
| 7.3.1 候选基因ORF1、ORF2的遗传转化及表示方法 | 第128-129页 |
| 7.3.2 f5 ORF1互补功能验证 | 第129-131页 |
| 7.3.3 f5 ORF2互补和超表达功能验证 | 第131-133页 |
| 7.3.4 ORF1和ORF2突变体效应分析 | 第133-135页 |
| 7.4 对f5图位克隆的思考 | 第135-138页 |
| 7.4.1 f5研究过程中遇到的困难 | 第135-137页 |
| 7.4.2 偏分离位点近等基因系构建方法 | 第137-138页 |
| 参考文献 | 第138-146页 |
| 附录Ⅰ 实验所用PCR引物 | 第146-151页 |
| 附录Ⅱ 在读期间研究成果 | 第151-152页 |
| 致谢 | 第152页 |
