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Simaomicin α生物合成途径的初步研究

中文摘要第2-3页
Abstract第3页
中文文摘第4-11页
绪论第11-27页
    1 微生物次级代谢产物第11-12页
        1.1 微生物次级代谢产物简介第11页
        1.2 微生物次级代谢产物研究进展第11-12页
    2 聚酮类抗生素第12-18页
        2.1 聚酮类化合物的药物应用第13-14页
        2.2 聚酮类化合物的分类第14-18页
    3 多环氧杂蒽酮类抗生素第18-21页
        3.1 Albofungin第18页
        3.2 Lysolipin第18-19页
        3.3 Simaomicin a第19页
        3.4 Kigamycin第19页
        3.5 Citreamicin第19-20页
        3.6 Xantholipin第20-21页
    4 Simaomicin a应用第21-27页
        4.1 simaomicin a的抑菌活性第21-22页
        4.2 Simaomicin a的抗鸡球虫病生物学活性第22-23页
        4.3 Simaomicin a特异性识别并诱导G1阶段的肿瘤细胞凋亡第23-24页
        4.4 Simaomicin a选择性破坏G2检查点第24页
        4.5 Simaomicin a的抗疟疾生物学活性第24-27页
第一章 Nonomuraea sp.FIM 02-765的培养和发酵产物分析第27-35页
    1.1 实验材料第27页
        1.1.1 菌种第27页
        1.1.2 培养基及化学试剂第27页
    1.2 实验方法第27-30页
        1.2.1 菌种的保藏第27页
        1.2.2 高效液相色谱(HPLC)使用说明第27-30页
        1.2.3 液相色谱-质谱连用(HPLC-MS)方法分析第30页
    1.3 实验结果分析第30-35页
        1.3.1 Nonomuraea sp.FIM 02-765的培养第30-31页
        1.3.2 发酵产物的检测第31-35页
第二章 Nonomuraea sp.FIM 02-765的基因组文库的构建第35-45页
    2.1 实验材料第35-36页
        2.1.1 菌种第35页
        2.1.2 DNA质粒第35页
        2.1.3 培养基及化学试剂第35-36页
    2.2 实验方法第36-38页
        2.2.1 碱裂解法提取大肠杆菌质粒DNA第36-37页
        2.2.2 Nonomuraea sp.FIM 02-765总DNA提取第37页
        2.2.3 低熔点琼脂糖凝胶的回收第37页
        2.2.4 Fosmid克隆的包装与滴度测定第37-38页
        2.2.5 DNA浓度的测量方法第38页
    2.3 实验结果及分析第38-45页
        2.3.1 Nonomuraea sp.FIM 02-765总DNA的提取第38-39页
        2.3.2 科斯质粒载体pJT2554的准备第39-41页
        2.3.4 插入DNA片段的准备第41-42页
        2.3.5 基因组cosmid质粒文库的构建第42-45页
第三章 Simaomicin α生物合成基因簇的克隆第45-59页
    3.1 实验材料第45-46页
        3.1.1 菌种第45页
        3.1.2 质粒第45页
        3.1.3 培养基及生化试剂第45-46页
    3.2 实验方法第46-49页
        3.2.1 简并引物的设计第46页
        3.2.2 生物信息学分析第46-47页
        3.2.3 southern杂交印记第47-48页
        3.2.4 DNA片段的纯化回收(琼脂糖凝胶DNA片段回收试剂盒的使用)第48-49页
    3.3 实验结果第49-59页
        3.3.1 基因组文库筛选探针的获取第49-50页
        3.3.2 Nonomuraea sp.基因组文库的筛选第50-52页
        3.3.3 southern杂交分析第52-54页
        3.3.4 simaomicin a聚酮合酶基因clf的获取第54-59页
第四章 simaomicin a生物合成基因簇异源表达第59-67页
    4.1 实验材料第59-60页
        4.1.1 菌株第59页
        4.1.2 培养基与生化试剂第59-60页
    4.2 实验方法第60-61页
        4.2.1 S.lividans K4原生质体制备第60页
        4.2.2 少量质粒提取试剂盒的使用方法第60-61页
        4.2.3 原生质体转化步骤第61页
    4.3 实验结果第61-67页
        4.3.1 S.lividans K4异源表达体系的构建第61-63页
        4.3.2 异源表达菌株Simaomicin a产量检测第63-67页
第五章 Simaomicin a基因敲除突变株的构建第67-79页
    5.1 实验材料第67-68页
        5.1.1 菌株第67页
        5.1.2 质粒第67页
        5.1.3 培养基及生化试剂第67-68页
    5.2 实验方法第68-71页
        5.2.1 碱裂解法少量提取质粒第68页
        5.2.2 钙转感受态的制备与转化第68-69页
        5.2.3 E.coli BW25113/pIJ790电转感受态的制备与转化第69-70页
        5.2.4 两异源亲本杂交介导的DNA质粒的跨属转移(接合转移)第70-71页
    5.3 实验结果第71-79页
        5.3.1 基因置换载体pyh28构建第71-78页
        5.3.2 CLF基因置换突变株的构建和筛选第78-79页
第六章 Simaomicin α生物合成基因簇的ORF预测及生物合成途径的推导第79-89页
    6.1 实验方法第79页
    6.2 实验结果第79-89页
        6.2.1 开放阅读框的预测第79-87页
        6.2.2 simaomicin α生物合成途径推导第87-89页
总结与讨论第89-93页
参考文献第93-99页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第99-101页
致谢第101-103页
个人简历第103-105页

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