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香蕉枯萎病菌2小种间pme1和pme2基因比较和功能研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词及中英文对照第7-15页
1 前言第15-21页
    1.1 香蕉枯萎病概况第15-16页
        1.1.1 香蕉产业及其重要性第15页
        1.1.2 香蕉枯萎病的发生与危害情况第15-16页
    1.2 香蕉枯萎病的防治现状第16-17页
        1.2.1 化学防治第16页
        1.2.2 抗病品种的选育第16-17页
        1.2.3 生物防治第17页
        1.2.4 其他防治方法第17页
    1.3 植物病原菌分泌的细胞壁降解酶第17-18页
    1.4 果胶甲酯酶研究进展第18-20页
    1.5 研究目的与意义第20-21页
2 材料与方法第21-60页
    2.1 主要仪器和设备第21页
    2.2 主要试剂第21-22页
    2.3 供试菌株第22页
    2.4 供试植物第22页
    2.5 宿主菌第22页
    2.6 质粒载体第22页
    2.7 主要培养基和溶液的配置第22-26页
    2.8 试验方法第26-60页
        2.8.1 pme1和pme2相对表达情况第26-29页
            2.8.1.1 香蕉枯萎病菌1号和4号小种接种香蕉根部第26页
            2.8.1.2 香蕉根部总RNA的提取第26-27页
            2.8.1.3 c DNA第一链的合成第27页
            2.8.1.4 Real-time PCR引物设计第27-28页
            2.8.1.5 Real-time PCR反应第28-29页
        2.8.2 pme1和pme2的克隆第29-37页
            2.8.2.1 香蕉枯萎病菌1号和4号小种基因组DNA提取第29-30页
            2.8.2.2 香蕉枯萎病菌1号和4号小种RNA提取第30-31页
            2.8.2.3 基因克隆引物设计第31页
            2.8.2.4 香蕉枯萎病菌1号和4号小种pme1和pme2基因DNA的扩增第31-32页
            2.8.2.5 香蕉枯萎病菌1号和4号小种pme1和pme2基因c DNA的扩增第32-33页
            2.8.2.6 PCR产物的回收第33-34页
            2.8.2.7 宿主菌E.coli DH5α感受态细胞的制备第34页
            2.8.2.8 回收产物的连接转化、蓝白斑筛选转化子第34-35页
            2.8.2.9 单菌落PCR筛选阳性克隆第35-36页
            2.8.2.10 阳性克隆质粒的抽提及测序第36页
            2.8.2.11 生物信息学分析第36-37页
        2.8.3 pme1和pme2真核表达载体构建第37-48页
            2.8.3.1 真核表达载体构建路线第37-38页
            2.8.3.2 真核表达引物设计第38页
            2.8.3.3 pme1和pme2的扩增和PCR产物的回收第38页
            2.8.3.4 回收产物的连接转化、蓝白斑筛选转化子第38页
            2.8.3.5 单菌落PCR筛选阳性克隆第38页
            2.8.3.6 阳性克隆质粒的抽提及测序第38页
            2.8.3.7 质粒的限制性内切酶消化第38-39页
            2.8.3.8 酶切产物的纯化回收第39页
            2.8.3.9 酶切产物的连接第39页
            2.8.3.10 酶切产物的转化第39-40页
            2.8.3.11 单菌落PCR筛选阳性克隆第40页
            2.8.3.12 初筛阳性克隆的抽提、酶切鉴定和测序第40页
            2.8.3.13 酵母感受态的制备第40页
            2.8.3.14 线性化重组表达质粒的制备第40-41页
            2.8.3.15 电击转化酵母感受态Pichiapastoris GS115第41页
            2.8.3.16 酵母基因组提取第41-42页
            2.8.3.17 转化子PCR鉴定第42页
            2.8.3.18 转化子的诱导表达第42-43页
            2.8.3.19 表达产物SDS-PAGE电泳分析第43-45页
            2.8.3.20 表达产物的浓缩第45页
            2.8.3.21 浓缩蛋白的浓度测定第45-46页
            2.8.3.22 Western Blot检测重组蛋白第46-47页
            2.8.3.23 重组蛋白酶活测定第47-48页
        2.8.4 PME1、PME2同工酶功能验证第48-60页
            2.8.4.1 hi TAIL-PCR扩增pme1、pme2上下游同源片段第48-51页
            2.8.4.2 基因敲除引物的设计第51-52页
            2.8.4.3 pme1和pme2基因敲除载体构建第52-53页
            2.8.4.4 根癌农杆菌感受态细胞的制备第53页
            2.8.4.5 敲除载体质粒电击转化根癌农杆菌第53-54页
            2.8.4.6 ATMT介导转化第54页
            2.8.4.7 Southern杂交鉴定第54-57页
            2.8.4.8 pme1和pme2同工酶基因敲除突变体的分析第57-58页
            2.8.4.9 pme1和pme2同工酶基因敲除突变体的致病性测定第58-60页
3 结果与分析第60-108页
    3.1 pme1和pme2基因相对表达情况第60-63页
    3.2 基因克隆及生物信息学分析第63-81页
        3.2.1 香蕉枯萎病菌1号和4号小种总DNA的提取第63页
        3.2.2 香蕉枯萎病菌1号和4号小种RNA的提取第63-64页
        3.2.3 pme1和pme2基因DNA与c DNA的扩增与克隆第64-65页
            3.2.3.1 pme1基因DNA的扩增与克隆第64页
            3.2.3.2 pme2基因DNA的扩增与克隆第64-65页
            3.2.3.3 pme1和pme2基因c DNA的扩增与克隆第65页
        3.2.4 pme1和pme2基因c DNA与DNA序列分析第65-81页
            3.2.4.1 Foc1-pme1和Foc4-pme1核苷酸及氨基酸序列比对分析第65-67页
            3.2.4.2 Foc1-pme2和Foc4-pme2核苷酸及氨基酸序列比对分析第67-69页
            3.2.4.3 Foc1-pme1和Foc4-pme1编码蛋白的理化性质分析第69-70页
            3.2.4.4 Foc1-pme1和Foc4-pme1编码蛋白的理化性质分析第70-71页
            3.2.4.5 pme1和pme2编码蛋白功能域预测及活性位点分析第71-76页
            3.2.4.6 pme1和pme2编码蛋白二级结构预测分析第76-79页
            3.2.4.7 pme1和pme2编码蛋白三级结构预测分析第79-81页
    3.3 pme1和pme2真核表达第81-90页
        3.3.1 pme1和pme2基因c DNA的提取第81页
        3.3.2 重组质粒p PICZαA-pme菌落PCR鉴定第81-82页
        3.3.3 重组质粒p PICZαA-pme双酶切鉴定第82-83页
        3.3.4 线性化表达载体Sac I单酶切线性化第83-84页
        3.3.5 pme酵母转化子PCR第84-85页
        3.3.6 Western blot检测目的蛋白第85-86页
        3.3.7 真核表达SDS-PAGE分析第86-88页
        3.3.8 表达产物的蛋白浓度测定第88页
        3.3.9 重组蛋白酶活测定第88-90页
    3.4 pme1和pme2基因敲除第90-108页
        3.4.1 hiTAIL-PCR扩增pme1上下游序列第90-91页
        3.4.2 hiTAIL-PCR扩增pme2上下游序列第91-92页
        3.4.3 pme1和pme2敲除载体构建第92-97页
            3.4.3.1 pme1敲除载体PCR检测第92-93页
            3.3.3.2 pme1敲除载体双酶切鉴定第93-94页
            3.3.3.3 pme2敲除载体PCR检测第94-96页
            3.3.3.4 pme2敲除载体双酶切鉴定第96-97页
        3.4.4 pme1和pme2重组敲除质粒转化根癌农杆菌AGL1第97-99页
            3.4.4.1 pme1重组敲除质粒转化根癌农杆菌AGL1检测第97-98页
            3.4.4.2 pme2重组敲除质粒转化根癌农杆菌AGL1检测第98-99页
        3.4.5 敲除突变体PCR检测第99-101页
        3.4.6 pme1、pme2敲除突变体的Southern Blot检测第101-102页
        3.4.7 PME1和PME2同工酶敲除突变体的表型第102-103页
        3.4.8 PME1和PME2同工酶敲除突变体的遗传稳定性第103页
        3.4.9 PME1和PME2同工酶敲除突变体的产孢子能力测定第103-106页
        3.4.10 PME1和PME2同工酶敲除突变体的致病性验证第106-108页
4 结论与讨论第108-116页
    4.1 结论第108-111页
        4.1.1 pme1、pme2 Real-time PCR验证第108页
        4.1.2 PME1、PME2同工酶基因克隆及生物信息学分析第108-109页
        4.1.3 PME1、PME2同工酶基因的真核表达第109-110页
        4.1.4 PME1、PME2同工酶基因的功能验证第110-111页
    4.2 讨论第111-115页
    4.3 展望第115-116页
致谢第116-117页
参考文献第117-124页
附录A 香蕉枯萎病菌2小种PME同工酶基因的核苷酸序列第124-126页

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