| 中文摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 第1章 引言 | 第12-21页 |
| 1.1 研究背景 | 第12-14页 |
| 1.2 相关问题 | 第14-19页 |
| 1.2.1 基础知识 | 第14-17页 |
| 1.2.2 基因组短块移动排序 | 第17-18页 |
| 1.2.3 基于A-Bruijn图的副本分类 | 第18-19页 |
| 1.3 论文组织结构 | 第19-21页 |
| 第2章 排列短块移动排序距离的新下界 | 第21-32页 |
| 2.1 相关研究 | 第21-23页 |
| 2.1.1 Heath的算法下界 | 第22页 |
| 2.1.2 基于双蘑菇阵列的算法下界 | 第22-23页 |
| 2.2 符号与定义 | 第23-26页 |
| 2.3 新下界 | 第26-31页 |
| 2.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第3章 基于A-Bruijn图的副本分类 | 第32-49页 |
| 3.1 相关研究 | 第32-34页 |
| 3.2 De Bruijn图与A-Bruijn图 | 第34-36页 |
| 3.2.1 De Bruijn图 | 第34-36页 |
| 3.2.2 De Bruijn图与A-Bruijn图的比较 | 第36页 |
| 3.3 A-Bruijn图 | 第36-41页 |
| 3.3.1 符号与标记 | 第36-38页 |
| 3.3.2 构造过程 | 第38-41页 |
| 3.4 RepeatGluer算法 | 第41-49页 |
| 3.4.1 算法步骤 | 第41-46页 |
| 3.4.2 部分代码 | 第46-49页 |
| 第4章 总结与展望 | 第49-51页 |
| 4.1 工作总结 | 第49-50页 |
| 4.2 未来展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文目录 | 第55-56页 |
| 附件 | 第56页 |