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基于蛋白质组与代谢组的肉鸡热应激分子机制研究

附件第3-5页
摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
英文缩略表第13-14页
第一章 引言第14-28页
    1.1 热应激对肉鸡的影响第14-17页
        1.1.1 热应激对肉鸡生产性能的影响第14-15页
        1.1.2 热应激对肉鸡神经内分泌机能的影响第15页
        1.1.3 热应激对肉鸡免疫机能的影响第15-16页
        1.1.4 热应激对肉鸡血液生化指标的影响第16页
        1.1.5 热应激对肉鸡物质代谢的影响第16-17页
        1.1.6 热应激对肉鸡氧化应激、细胞增殖和细胞调亡的影响第17页
    1.2 热应激分子机制研究进展第17-20页
        1.2.1 热休克蛋白研究进展第17页
        1.2.2 热应激系统生物学研究进展第17-20页
    1.3 蛋白质组学研究进展第20-25页
        1.3.1 蛋白质组学的概论第20-21页
        1.3.2 蛋白质组学的工作流程第21页
        1.3.3 蛋白质组学中多肽鉴定及谱库解析研究进展第21-22页
        1.3.4 定量蛋白质组学研究进展第22-25页
    1.4 代谢组学研究进展第25-26页
        1.4.1 代谢组学的概论第25-26页
        1.4.2 代谢组学研究方法第26页
    1.5 本研究目的和意义第26-28页
第二章 肉鸡热应激模型构建第28-36页
    2.1 材料与方法第28-31页
        2.1.1 试验设计及操作第28页
        2.1.2 试验日粮第28-29页
        2.1.3 饲养管理第29-30页
        2.1.4 取样方法及指标测定第30-31页
        2.1.5 数据处理与统计分析第31页
    2.2 结果与分析第31-33页
        2.2.1 热应激对肉鸡体核温度及健康状况的影响第31-32页
        2.2.2 热应激对肉鸡生产性能的影响第32页
        2.2.3 热应激对肉鸡血液生化指标的影响第32-33页
    2.3 讨论第33-34页
        2.3.1 体温及健康状况第33页
        2.3.2 生产性能第33-34页
        2.3.3 血液生化指标第34页
    2.4 小结第34-36页
第三章 基于质谱的肉鸡肝脏蛋白质组鉴定方法研究第36-51页
    3.1 材料与方法第36-39页
        3.1.1 试验材料第36-37页
        3.1.2 蛋白质提取和酶切方法第37-38页
        3.1.3 鸡肝蛋白质组分析第38页
        3.1.4 数据处理与统计分析第38-39页
    3.2 结果与分析第39-49页
        3.2.1 鸡肝蛋白提取效果第39-40页
        3.2.2 鸡肝蛋白质的质谱分析第40-43页
        3.2.3 液相条件的优化第43-46页
        3.2.4 质谱方法的优化第46-48页
        3.2.5 鸡肝蛋白的通路分析第48-49页
        3.2.6 鸡肝蛋白的翻译后修饰分析第49页
    3.3 讨论第49-50页
    3.4 小结第50-51页
第四章 非标定量技术解析肉鸡肝蛋白的热应激响应机制第51-72页
    4.1 材料与方法第52-55页
        4.1.1 试验材料与试验设计第52-53页
        4.1.2 蛋白质提取和消化第53页
        4.1.3 SWATH-MS分析和目标数据提取第53-54页
        4.1.4 MRM验证试验第54页
        4.1.5 Western Blotting验证试验第54-55页
        4.1.6 数据统计和GO分析第55页
    4.2 结果与分析第55-65页
        4.2.1 样品和实验流程具有较好的生物可重复性第55页
        4.2.2 SWATH策略蛋白质定量通量高、可重复性高第55-56页
        4.2.3 肉鸡肝脏热应激差异表达蛋白鉴定结果第56-59页
        4.2.4 肉鸡热应激差异表达蛋白差异蛋白的GO功能分析第59-62页
        4.2.5 肉鸡热应激差异表达蛋白的KEGG代谢通路分析第62-63页
        4.2.6 MRM部分差异蛋白质的表达水平第63页
        4.2.7 Western Blotting验证部份差异蛋白质的表达水平第63-65页
    4.3 讨论第65-70页
        4.3.1 肉鸡热应激肝蛋白质组数据的重复性和可靠性分析第65页
        4.3.2 肉鸡肝脏差异表达蛋白质的生物学功能鉴定第65-66页
        4.3.3 热应激通过抑制的ERK1/2 信号路径调节细胞存活第66-68页
        4.3.4 热应激影响肉鸡肝脏脂类代谢和氨基酸代谢第68-70页
        4.3.5 热应激诱导肝细胞炎症反应和免疫应答第70页
    4.4 小结第70-72页
第五章 基于代谢组学的肉仔鸡热应激分子机制研究第72-79页
    5.1 材料与方法第72-73页
        5.1.1 试验材料与试验设计第72-73页
        5.1.2 样品制备方法第73页
        5.1.3 LC-MS/MS代谢组学分析与数据采集第73页
        5.1.4 数据处理与统计分析第73页
    5.2 结果与分析第73-77页
        5.2.1 热应激组与对照组离子流图第73-75页
        5.2.2 多维统计分析第75-76页
        5.2.3 潜在生物标记物第76-77页
    5.3 讨论第77-78页
        5.3.1 粪便上清代谢组学可能成为环境应激早期预警非损伤性评价手段第77-78页
        5.3.2 肉鸡热应激差异代谢物分析第78页
    5.4 小结第78-79页
第六章 全文结论第79-81页
    6.1 主要结论第79页
    6.2 主要创新点第79-80页
    6.3 待进一步研究的问题第80-81页
参考文献第81-98页
附录第98-130页
    附表1 MRM分析中所用的肽段和离子对列表第98-102页
    附表2 热应激下257个鸡肝差异蛋白GO分析列表第102-130页
致谢第130-131页
作者简历第131页
博士阶段的相关论文及成果第131-132页

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