| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第14-28页 |
| 1.1 研究目的与意义 | 第14页 |
| 1.2 文献综述 | 第14-26页 |
| 1.2.1 抗生素抗性基因的威胁 | 第14-16页 |
| 1.2.2 畜禽粪便中的ARGs | 第16-18页 |
| 1.2.3 残留的抗生素和重金属与ARGs的关系 | 第18-19页 |
| 1.2.4 畜禽粪便资源化利用过程中ARGs的变化 | 第19-22页 |
| 1.2.5 厌氧发酵过程中的微生物群落变化 | 第22-23页 |
| 1.2.6 分子生物学技术在ARGs研究中的应用 | 第23-26页 |
| 1.3 主要研究内容与技术路线 | 第26-28页 |
| 1.3.1 研究内容 | 第26页 |
| 1.3.2 技术路线 | 第26-28页 |
| 第二章 温度对牛粪厌氧发酵过程抗生素抗性基因和微生物群落影响及其机理研究 | 第28-45页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-32页 |
| 2.1.1 试验材料与处理 | 第29页 |
| 2.1.2 样品采集 | 第29-30页 |
| 2.1.3 化学指标测定 | 第30页 |
| 2.1.4 DNA的提取和基因的定量 | 第30-31页 |
| 2.1.5 16S rRNA基因测序 | 第31页 |
| 2.1.6 数据分析 | 第31-32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-41页 |
| 2.2.1 温度对厌氧发酵过程VFAs的影响 | 第32-33页 |
| 2.2.2 温度对厌氧发酵前后ARGs绝对丰度变化的影响 | 第33-34页 |
| 2.2.3 温度对厌氧发酵过程中ARGs相对丰度变化的影响 | 第34-36页 |
| 2.2.4 温度对厌氧发酵过程中微生物群落变化的影响 | 第36-39页 |
| 2.2.5 ARGs、细菌群落和环境因子间关系 | 第39-41页 |
| 2.3 讨论 | 第41-44页 |
| 2.4 结论 | 第44-45页 |
| 第三章 固体含量对牛粪厌氧发酵过程抗生素抗性基因、移动基因元件和微生物群落影响机理研究 | 第45-61页 |
| 3.1 材料与方法 | 第46-48页 |
| 3.1.1 试验材料与处理 | 第46页 |
| 3.1.2 样品采集 | 第46页 |
| 3.1.3 化学指标测定 | 第46页 |
| 3.1.4 DNA的提取和基因的定量 | 第46-47页 |
| 3.1.5 16S rRNA基因测序 | 第47页 |
| 3.1.6 数据分析 | 第47-48页 |
| 3.2 结果与分析 | 第48-58页 |
| 3.2.1 TS对厌氧发酵过程ARGs的影响 | 第48-50页 |
| 3.2.2 TS对厌氧发酵过程MGEs的影响 | 第50-51页 |
| 3.2.3 厌氧发酵过程中ARGs和MGEs的共现分析 | 第51页 |
| 3.2.4 TS对厌氧发酵过程微生物群落的影响 | 第51-56页 |
| 3.2.5 厌氧发酵过程中ARGs和MGEs的潜在宿主菌分析 | 第56-57页 |
| 3.2.6 厌氧发酵过程中ARGs与MGEs及微生物群落的关系 | 第57-58页 |
| 3.3 讨论 | 第58-60页 |
| 3.4 结论 | 第60-61页 |
| 第四章 抗生素对牛粪厌氧发酵过程抗生素抗性基因 | 第61-73页 |
| 4.1 材料与方法 | 第62-63页 |
| 4.1.1 试验材料与处理 | 第62页 |
| 4.1.2 样品采集 | 第62页 |
| 4.1.3 化学指标测定 | 第62页 |
| 4.1.4 DNA提取和定量PCR | 第62页 |
| 4.1.5 16S rRNA测序 | 第62-63页 |
| 4.1.6 数据处理与分析 | 第63页 |
| 4.2 结果与分析 | 第63-69页 |
| 4.2.1 恩诺沙星对厌氧发酵过程中ARGs相对丰度的影响 | 第63-64页 |
| 4.2.2 恩诺沙星对厌氧发酵前后ARGs绝对丰度的影响 | 第64-65页 |
| 4.2.3 恩诺沙星对厌氧发酵过程微生物群落的影响 | 第65-66页 |
| 4.2.4 厌氧发酵过程中ARGs和整合子基因的潜在宿主菌分析 | 第66-67页 |
| 4.2.5 抗性基因、整合子基因与微生物群落的关系 | 第67-69页 |
| 4.3 讨论 | 第69-72页 |
| 4.4 结论 | 第72-73页 |
| 第五章 重金属对猪粪厌氧发酵过程抗生素抗性基因 | 第73-86页 |
| 5.1 材料与方法 | 第74-76页 |
| 5.1.1 试验材料与装置 | 第74页 |
| 5.1.2 试验处理设置 | 第74页 |
| 5.1.3 样品采集 | 第74页 |
| 5.1.4 化学指标测定 | 第74页 |
| 5.1.5 DNA提取和定量PCR | 第74-75页 |
| 5.1.6 16S rRNA测序 | 第75页 |
| 5.1.7 数据处理与分析 | 第75-76页 |
| 5.2 结果与分析 | 第76-82页 |
| 5.2.1 阿散酸对厌氧发酵过程ARGs和int I1丰度的影响 | 第76-77页 |
| 5.2.2 厌氧发酵过程中生物可利用态As和抗砷基因变化 | 第77-78页 |
| 5.2.3 阿散酸对厌氧发酵过程微生物群落的影响 | 第78-80页 |
| 5.2.4 ARGs、砷抗性基因、微生物群落和环境因子间的关系 | 第80-82页 |
| 5.3 讨论 | 第82-85页 |
| 5.4 结论 | 第85-86页 |
| 第六章 生物炭对牛粪厌氧发酵过程抗生素抗性基因、 | 第86-101页 |
| 6.1 材料与方法 | 第87-88页 |
| 6.1.1 试验材料与处理 | 第87页 |
| 6.1.2 样品采集 | 第87页 |
| 6.1.3 化学指标测定 | 第87页 |
| 6.1.4 DNA提取和定量PCR | 第87页 |
| 6.1.5 16S rRNA测序 | 第87页 |
| 6.1.6 数据处理与分析 | 第87-88页 |
| 6.2 结果与分析 | 第88-98页 |
| 6.2.1 生物炭对厌氧发酵产物中ARGs绝对丰度的影响 | 第88页 |
| 6.2.2 生物炭对厌氧发酵过程中ARGs相对丰度的影响 | 第88-90页 |
| 6.2.3 生物炭对厌氧发酵过程中MGEs相对丰度的影响 | 第90-91页 |
| 6.2.4 ARGs和MGEs的共现分析 | 第91页 |
| 6.2.5 生物炭对厌氧发酵过程中微生物群落的影响 | 第91-96页 |
| 6.2.6 厌氧发酵过程中ARGs和MGEs的潜在宿主菌分析 | 第96-97页 |
| 6.2.7 ARGs与MGEs和微生物群落的关系 | 第97-98页 |
| 6.3 讨论 | 第98-100页 |
| 6.4 结论 | 第100-101页 |
| 第七章 结论与展望 | 第101-103页 |
| 7.1 主要结论 | 第101-102页 |
| 7.2 研究展望 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 作者简介 | 第120-122页 |
| 附录 | 第122-125页 |
