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琼花不孕花和可孕花转录组分析及发育过程形态结构观察

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
英文缩写符号及中英文对照表第10-11页
第一章 文献综述第11-22页
    1. 花器官发育分子调控机制研究综述第11-21页
        1.1 花器官形态大小的调控机制第11-14页
            1.1.1 植物激素参与调控花器官大小第12-13页
            1.1.2 泛素途径参与调控花器官大小第13页
            1.1.3 microRNA参与调控花器官大小第13-14页
            1.1.4 调控花器官细胞扩增和细胞扩张的基因和转录因子第14页
        1.2 花器官雄性不育的分子调控机制第14-17页
            1.2.1 减数分裂异常导致的雄性不育第15页
            1.2.2 胼胝质代谢异常导致的雄性不育第15页
            1.2.3 绒毡层发育异常导致的雄性不育第15-16页
            1.2.4 花粉壁发育异常导致的雄性不育第16页
            1.2.5 花药开裂异常导致的雄性不育第16页
            1.2.6 其他导致雄性不育的基因第16-17页
        1.3 花器官发育模型的研究第17-21页
            1.3.1 花发育模型的建立和发展第17-18页
            1.3.2 ABCD模型第18-19页
            1.3.3 ABCDE模型第19-20页
            1.3.4 四聚体模型第20-21页
    2. 本实验研究目的和意义第21-22页
第二章 材料与方法第22-36页
    2.1 植物材料第22页
    2.2 琼花可孕花、不孕花形态及解剖学观察第22-24页
        2.2.1 实验主要仪器与试剂第22-23页
        2.2.2 所需试剂的配制第23页
        2.2.3 试验方法第23-24页
    2.3 琼花转录组测序样品采集、制备与测序第24-27页
        2.3.1 主要仪器第24页
        2.3.2 所需试剂配制第24-25页
        2.3.3 应用的软件或工具第25页
        2.3.4 试验方法第25-27页
    2.4 琼花可孕花、不孕花转录组数据分析第27-30页
        2.4.1 原始序列数据质量评估第27-29页
        2.4.2 测序数据过滤第29页
        2.4.3 转录本拼接第29-30页
        2.4.4 功能注释第30页
    2.5 荧光定量PCR验证第30-36页
        2.5.1 试验主要仪器与试剂第30-31页
        2.5.2 试验方法第31-35页
        2.5.3 相对表达水平的计算方法第35-36页
第三章 结果与分析第36-63页
    3.1 琼花不孕花与可孕花发育过程中形态结构变化第36-42页
        3.1.1 琼花聚伞花序发育形态观察第36-37页
        3.1.2 琼花不孕花、可孕花雌雄蕊解剖结构观察第37-39页
        3.1.3 琼花不孕花、可孕花的花瓣细胞扫描电镜观察第39-41页
        3.1.4 琼花花瓣半薄、超薄切片观察第41-42页
    3.2 琼花总RNA提取质量评估第42-43页
    3.3 琼花高通量测序及数据组装第43-48页
        3.3.1 测序产量统计及质量评估第43-44页
        3.3.2 转录本拼接及质量评估第44页
        3.3.3 功能注释第44-48页
    3.4 差异基因表达分析第48-50页
        3.4.1 差异表达基因筛选第49页
        3.4.2 差异基因表达水平聚类分析第49-50页
    3.5 主要功能类群的差异表达基因的确定第50-58页
        3.5.1 与细胞增殖和扩张及激素相关的差异表达基因第50-51页
        3.5.2 与植物育性相关的差异表达基因第51-58页
    3.6 琼花转录因子分析第58-60页
        3.6.1 转录因子家族及成员第58页
        3.6.2 差异表达的转录因子家族及成员第58-59页
        3.6.3 MADS-box转录因子分析第59-60页
    3.7 荧光定量验证第60-63页
第四章 小结与讨论第63-69页
    4.1 琼花解剖结构观察及细胞生物学研究第63页
    4.2 琼花转录组测序、拼接和功能注释第63-64页
    4.3 花器官大小相关基因及及表达模式第64-66页
    4.4 花器官育性相关基因及表达模式第66-67页
    4.5 与花器官发育相关的转录因子及表达模式第67-69页
参考文献第69-75页
致谢第75-76页

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