基于降维的微阵列数据分析
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 绪论 | 第9-16页 |
| ·课题研究的背景及意义 | 第9-13页 |
| ·微阵列简介 | 第9-10页 |
| ·微阵列基因表达数据 | 第10-12页 |
| ·课题研究目的和意义 | 第12-13页 |
| ·基因表达数据分析方法研究现状 | 第13-14页 |
| ·本文主要研究内容及组织结构 | 第14-16页 |
| 2 线性降维 | 第16-33页 |
| ·主成分分析(PCA) | 第16-18页 |
| ·主成分定义 | 第17页 |
| ·主成分计算步骤 | 第17-18页 |
| ·多维尺度变换(MDS) | 第18-19页 |
| ·基本思想 | 第18页 |
| ·MDS 的计算步骤 | 第18-19页 |
| ·因子分析(FA) | 第19-22页 |
| ·因子分析原理 | 第19-20页 |
| ·因子分析计算步骤 | 第20-22页 |
| ·支持向量机 | 第22-24页 |
| ·SVM 的基本思想 | 第22页 |
| ·SVM 分类 | 第22-24页 |
| ·线性降维实验分析 | 第24-30页 |
| ·数据预处理 | 第24页 |
| ·数据线性降维与识别率计算 | 第24-25页 |
| ·PCA 降维分析 | 第25-27页 |
| ·MDS 降维分析 | 第27-28页 |
| ·FA 降维分析 | 第28-30页 |
| ·线性降维下模型确定 | 第30-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 3 非线性降维 | 第33-43页 |
| ·局部线性嵌入(LLE) | 第33-35页 |
| ·LLE 基本原理 | 第33-34页 |
| ·LLE 计算步骤 | 第34-35页 |
| ·等距离映射算法(ISOMAP) | 第35-36页 |
| ·ISOMAP 基本原理 | 第35页 |
| ·ISOMAP 计算步骤 | 第35-36页 |
| ·局部切空间排列(LTSA) | 第36页 |
| ·非线性降维实验分析 | 第36-41页 |
| ·LLE 降维分析 | 第36-38页 |
| ·ISOMAP 降维分析 | 第38-40页 |
| ·LTSA 降维分析 | 第40-41页 |
| ·非线性降维方法模型确定 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 4 基因表达数据可视化 | 第43-50页 |
| ·基因数据可视化技术简介 | 第43-44页 |
| ·基因调控网络 | 第43-44页 |
| ·信息壁与语义镜技术 | 第44页 |
| ·特征提取下基因表达数据可视化 | 第44-49页 |
| ·PCA 特征提取下表达数据三维可视化 | 第44-47页 |
| ·LLE 特征提取下表达数据三维可视化 | 第47-49页 |
| ·本章小结 | 第49-50页 |
| 5 总结与展望 | 第50-52页 |
| ·总结 | 第50-51页 |
| ·展望 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-55页 |
| 硕士阶段发表论文情况 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |