| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-17页 |
| ·鱼类转录组研究现状 | 第11-13页 |
| ·转录组的定义 | 第11页 |
| ·鱼类转录组研究现状 | 第11-12页 |
| ·草鱼转录组研究现状 | 第12-13页 |
| ·微卫星多态性研究现状 | 第13-14页 |
| ·可变剪接的研究现状 | 第14-15页 |
| ·调控可变剪接的RNA 原件及相关因子 | 第14-15页 |
| ·内含子的进化 | 第15页 |
| ·研究草鱼转录组及微卫星进化的意义 | 第15-17页 |
| 第二章 草鱼EST 文库构建及序列分析 | 第17-30页 |
| ·材料和方法 | 第17-18页 |
| ·样品来源 | 第17页 |
| ·EST 序列分析 | 第17-18页 |
| ·微卫星序列分析和SNP 位点分析 | 第18页 |
| ·基因功能分类 | 第18页 |
| ·结果 | 第18-28页 |
| ·EST 序列分析 | 第18-19页 |
| ·EST 比对结果 | 第19-22页 |
| ·草鱼与鲤鱼EST 序列比较分析结果 | 第22-23页 |
| ·Gene ontology（GO）注释 | 第23-25页 |
| ·分子标记的鉴定 | 第25-28页 |
| ·讨论 | 第28-30页 |
| 第三章 草鱼MKLN1 基因可变剪接和微卫星序列的多态性 | 第30-37页 |
| ·材料和方法 | 第30-32页 |
| ·样品来源 | 第30页 |
| ·基因组DNA 提取 | 第30-31页 |
| ·微卫星多态性的检测及序列测定 | 第31页 |
| ·MKLN1 基因组部分序列的克隆和分析 | 第31页 |
| ·RT-PCR 及可变剪接转录本的克隆 | 第31-32页 |
| ·结果 | 第32-35页 |
| ·MKLN1 cDNA 序列及其所包含的微卫星多态性 | 第32-33页 |
| ·微卫星序列位于MKLN1 第10 内含子区域 | 第33-34页 |
| ·MKLN1 的可变剪接及其组织特异性 | 第34-35页 |
| ·讨论 | 第35-37页 |
| 第四章 草鱼RRP7A 基因的可变剪接及其基因组进化 | 第37-51页 |
| ·材料和方法 | 第37-39页 |
| ·样品来源 | 第37页 |
| ·基因组DNA 提取 | 第37-38页 |
| ·微卫星多态性的检测及序列测定 | 第38页 |
| ·RRP7A 基因组序列的克隆和分析 | 第38页 |
| ·RT-PCR 及可变剪接转录本的克隆 | 第38-39页 |
| ·cDNA 序列分析和蛋白质预测分析 | 第39页 |
| ·结果 | 第39-46页 |
| ·RRP7A cDNA 序列及其所包含的微卫星多态性 | 第39-40页 |
| ·RRP7A 基因的基因结构分析 | 第40-41页 |
| ·RRP7A 基因可变剪接分析 | 第41-43页 |
| ·RRP7A 各转录本蛋白质功能及功能结构域预测 | 第43-45页 |
| ·RRP7A 基因可变剪接的组织表达情况 | 第45页 |
| ·RRP7A 基因系统进化分析 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-51页 |
| 小结 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 附录 | 第59-61页 |
| 已接受或发表的论文 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
