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羧酸酯酶rPPE及卤过氧化物酶RhEst的结构功能研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-10页
第一章 引言第10-29页
   ·结构生物学简介第10-15页
     ·X-ray蛋白晶体衍射技术概论第10-12页
     ·蛋白质结晶第12-14页
     ·相角问题第14-15页
   ·蛋白质结构的研究意义第15-16页
   ·羧酸酯酶第16-20页
     ·羧酸酯酶及其分类第16-17页
     ·羧酸酯酶催化机理第17-18页
     ·羧酸酯酶的结构第18-20页
     ·羧酸酯酶的应用价值第20页
   ·卤过氧化物酶第20-27页
     ·卤过氧化物酶分类第20-23页
       ·亚铁血红素卤过氧化物酶第20-21页
       ·钒依赖的卤代过氧化物酶第21-22页
       ·非金属依赖的卤过氧化物酶第22-23页
     ·卤过氧化物酶介导的反应类型第23-25页
       ·卤化反应第23页
       ·氧化反应第23-24页
       ·环氧化作用第24页
       ·磺化氧化作用第24页
       ·酯水解反应第24-25页
       ·其他反应第25页
     ·卤过氧化物酶的结构第25-27页
   ·基于结构的蛋白质工程第27-28页
   ·本课题的研究目的及意义第28页
   ·本论文的主要研究内容第28-29页
第二章 一种新型耐热羧酸酯酶rPPE的结构功能研究第29-53页
   ·前言第29-30页
   ·实验材料与方法第30-38页
     ·常用试剂第30页
     ·常用溶液的配制第30-32页
     ·常用设备第32-33页
     ·菌株第33页
     ·rPE突变体的构建第33-35页
     ·羧酸酯酶rPPE_(WT)及其突变体的蛋白表达第35页
     ·羧酸酯酶rPPE_(WT)及其突变体的蛋白纯化第35-36页
     ·蛋白浓度确定第36页
     ·蛋白结晶第36-37页
       ·结晶条件初筛及优化第36页
       ·复合物晶体制备第36-37页
     ·X-ray晶体衍射及数据收集第37页
     ·衍射数据处理及结构解析第37页
     ·对硝基苯酚酯水解活力的检测方法第37-38页
     ·水解乙酰邻氯扁桃酸的活性与对映选择性测定方法第38页
   ·实验结果与讨论第38-52页
     ·rPPE_(WT)晶体结构测定第38-46页
       ·rPPE_(WT)及其突变体的蛋白纯化第38-39页
       ·rPPE_(WT)结晶及衍射数据的收集与处理第39-41页
       ·rPPE的整体结构及催化三联体第41-43页
       ·rPPE的底物结合口袋第43-44页
       ·rPPE的二聚体结构第44-46页
     ·突变体rPPE_(W187H)的晶体结构第46页
     ·rPPE_(W187H/S159A)与底物分子的复合物结构第46-48页
     ·单点突变体rPPE_(W187H)及rPPE_(D287A)催化效率提高的分子机制第48-49页
     ·rPPE手性识别机制第49-51页
     ·rPE催化机理验证第51-52页
   ·本章小结第52-53页
第三章 卤过氧化物酶RhEst的晶体结构解析第53-68页
   ·前言第53-54页
   ·实验材料与方法第54-56页
     ·常用试剂第54页
     ·常用溶液的配制第54页
     ·常用仪器第54页
     ·菌株第54页
     ·RhEst母体蛋白的表达第54-55页
     ·RhEst硒代蛋白表达第55页
     ·蛋白纯化第55页
     ·衍射数据处理及结构解析第55页
     ·进化树的构建第55-56页
   ·结果与讨论第56-67页
     ·卤过氧化物酶RhEst的晶体结构解析第56-62页
       ·RhEst母体蛋白纯化第56页
       ·RhEst母体蛋白结晶第56-57页
       ·母体RhEst的衍射数据收集及结构解析第57-58页
       ·RhEst硒代蛋白的表达纯化与结晶第58-59页
       ·硒代RhEst的数据收集及结构解析第59-60页
       ·RhEst分辨率1.95A晶体结构的解析第60-62页
     ·RhEst的整体结构第62-64页
     ·RhEst的两种不同构象第64-65页
     ·RhEst进化途径分析第65-67页
   ·本章小结第67-68页
结论与展望第68-70页
参考文献第70-76页
攻读硕士期间撰写的论文第76-77页
致谢第77页

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