| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 英文缩略表 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-24页 |
| ·植物花芽分化诱导阶段的调控及相关基因研究进展 | 第11-16页 |
| ·光周期反应途径 | 第12-13页 |
| ·春化反应途径 | 第13-14页 |
| ·自主反应途径 | 第14-15页 |
| ·赤霉素反应途径 | 第15页 |
| ·其它因素的影响 | 第15-16页 |
| ·各条途径间的相互作用 | 第16页 |
| ·转录组学分析方法的研究进展 | 第16-23页 |
| ·基于核酸杂交的表达谱分析方法 | 第17-18页 |
| ·基于第一代测序技术的表达谱分析方法 | 第18-20页 |
| ·基于新一代高通量测序技术的表达谱分析方法 | 第20-23页 |
| ·本研究的目的意义 | 第23-24页 |
| 2 材料方法 | 第24-31页 |
| ·实验材料 | 第24页 |
| ·实验方法 | 第24-31页 |
| ·中棉所36和TM-1花芽分化时期的观察 | 第24页 |
| ·所取样品RNA的提取 | 第24-26页 |
| ·RNA的检测 | 第26页 |
| ·反转录 | 第26页 |
| ·荧光定量PCR | 第26-27页 |
| ·Tag的制备及测序 | 第27页 |
| ·测序数据的分析 | 第27-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-51页 |
| ·解剖学观察 | 第31-33页 |
| ·RNA质量检测 | 第33页 |
| ·测序质量评估 | 第33-35页 |
| ·Tag的整体质量评估 | 第33-34页 |
| ·Clean Tag拷贝数分布统计 | 第34-35页 |
| ·测序饱和度分析 | 第35页 |
| ·基因表达注释 | 第35-40页 |
| ·参考基因序列数据库的基本情况 | 第35-36页 |
| ·Clean Tag比对具体情况的统计分析 | 第36-39页 |
| ·酶切效率评价 | 第39-40页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第40页 |
| ·数据的深入分析 | 第40-48页 |
| ·持家基因的表达分析 | 第40-42页 |
| ·花芽分化标志基因的表达分析 | 第42-43页 |
| ·花芽分化诱导相关基因差异表达时期的确定 | 第43页 |
| ·中棉所36与TM-1差异表达基因的比较 | 第43-47页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第47-48页 |
| ·荧光定量PCR结果验证数字基因表达谱分析的准确性 | 第48-51页 |
| 4 讨论 | 第51-59页 |
| ·早熟品种与晚熟品种花芽分化解剖学观察的比较 | 第51页 |
| ·参考基因序列数据库的选择 | 第51-54页 |
| ·比对标准的确定 | 第54-56页 |
| ·中棉所36花芽分化诱导相关基因的表达 | 第56页 |
| ·陆地棉花芽分化诱导途径的分析 | 第56-57页 |
| ·陆地棉数字基因表达谱数据分析中的问题 | 第57-58页 |
| ·本研究的不足与展望 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 附表 | 第66-75页 |
| 致谢 | 第75页 |