| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-15页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第15-16页 |
| 第一部分 文献综述 | 第16-48页 |
| 第一章 棉花分子标记定位研究进展 | 第16-26页 |
| 1 DNA分子标记技术的发展 | 第16-18页 |
| 2 遗传图谱的作图群体 | 第18-19页 |
| 3 棉花分子遗传图谱研究进展 | 第19-22页 |
| ·棉花种间分子遗传图谱研究进展 | 第19-21页 |
| ·陆地棉种内分子遗传图谱研究进展 | 第21-22页 |
| ·二倍体棉花分子遗传图谱研究进展 | 第22页 |
| 4 棉花质量性状定位研究进展 | 第22-23页 |
| 5 QTL定位方法研究进展 | 第23-24页 |
| 6 棉花纤维品质及产量QTL定位研究进展 | 第24-26页 |
| 第二章 棉纤维发育研究进展 | 第26-42页 |
| 1 棉纤维发育概述 | 第26-27页 |
| 2 棉纤维的发育特征、机制与重要基因 | 第27-42页 |
| ·纤维的分化和起始期 | 第27-29页 |
| ·棉纤维细胞伸长期 | 第29-33页 |
| ·棉纤维细胞伸长的驱动力 | 第30-31页 |
| ·细胞骨架变化及扩展蛋白对棉纤维伸长的影响 | 第31页 |
| ·激素对棉纤维伸长的影响 | 第31-32页 |
| ·棉纤维伸长的模型 | 第32-33页 |
| ·次生壁合成期 | 第33-41页 |
| ·纤维素合酶复合体及纤维素的合成场所 | 第34-35页 |
| ·纤维素合成的过程 | 第35-37页 |
| ·棉纤维次生壁加厚相关基因 | 第37-39页 |
| ·植物激素及活性氧物质对棉纤维次生壁发育的影响 | 第39-40页 |
| ·细胞骨架对棉纤维次生壁发育的影响 | 第40-41页 |
| ·脱水成熟期 | 第41-42页 |
| 第三章 棉纤维发育转录组研究进展 | 第42-48页 |
| 1 棉花EST数据库 | 第42-43页 |
| 2 转录组学的主要研究方法 | 第43-46页 |
| ·基于微阵列技术的表达谱分析手段 | 第44-45页 |
| ·基于测序技术的表达谱分析手段 | 第45-46页 |
| 3 棉纤维发育转录组学研究进展 | 第46-48页 |
| ·微阵列技术在棉纤维转录学研究上的应用 | 第46-47页 |
| ·测序技术在棉纤维转录学研究上的应用 | 第47-48页 |
| 本研究的目的与意义 | 第48-50页 |
| 第二部分 研究报告 | 第50-116页 |
| 第四章 棉花不成熟纤维突变基因(im)的定位及其对重要纤维品质性状及衣分的影响 | 第50-82页 |
| 1 材料与方法 | 第51-56页 |
| ·实验材料及群体构建 | 第51页 |
| ·性状调查 | 第51-52页 |
| ·纤维品质测定 | 第52页 |
| ·棉花DNA的提取 | 第52-54页 |
| ·SSR分析 | 第54-55页 |
| ·SSR引物 | 第54页 |
| ·SSR标记PCR扩增 | 第54页 |
| ·PAGE/银染分析 | 第54-55页 |
| ·数据分析 | 第55-56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-78页 |
| ·im突变体的遗传分析 | 第56-57页 |
| ·群体分子标记基因型的分析和遗传图谱的构建 | 第57-62页 |
| ·亲本及作图群体纤维品质及衣分性状统计分析 | 第62-67页 |
| ·纤维品质及衣分性状表现 | 第62页 |
| ·纤维品质及衣分性状相关分析 | 第62-67页 |
| ·纤维品质及产量性状QTL检测及Meta分析 | 第67-78页 |
| ·纤维长度(FL) | 第67页 |
| ·纤维强度(FS) | 第67-68页 |
| ·纤维马克隆值(Mic) | 第68页 |
| ·纤维整齐度(FU) | 第68页 |
| ·短纤维指数(SFI) | 第68-69页 |
| ·纤维成熟度(Mat) | 第69页 |
| ·衣分(LP) | 第69-78页 |
| 3 讨论 | 第78-82页 |
| ·棉花种内与种间遗传多态性 | 第78页 |
| ·CSILs在基因定位和QTL检测中的作用 | 第78-80页 |
| ·im基因对纤维品质及衣分性状的影响 | 第80-82页 |
| 第五章 棉花不成熟纤维突变体纤维次生壁加厚期基因表达谱分析 | 第82-116页 |
| 1 材料与方法 | 第83-89页 |
| ·植物材料 | 第83页 |
| ·葡萄糖、果糖及蔗糖含量测定 | 第83-84页 |
| ·棉纤维纤维素含量测定 | 第84页 |
| ·棉纤维细胞壁显微观察与细胞壁厚度测定 | 第84-85页 |
| ·RNA提取和纯化 | 第85页 |
| ·RNA样品标记探针 | 第85-86页 |
| ·cDNA芯片杂交 | 第86页 |
| ·统计分析 | 第86页 |
| ·定量PCR分析 | 第86-89页 |
| 2 结果 | 第89-111页 |
| ·棉纤维中纤维素含量和细胞壁厚度分析 | 第89-91页 |
| ·纤维发育进程中葡萄糖、果糖及蔗糖含量变化 | 第91-93页 |
| ·im突变体和TM-1在纤维发育进程中的表达谱变化 | 第93-94页 |
| ·相邻时期差异表达基因的GO功能注释与富集分析 | 第94-97页 |
| ·im突变体和TM-1差异表达基因的GO功能注释与富集分析 | 第97-100页 |
| ·参与次生壁合成的碳水化合物活性酶基因分析 | 第100-101页 |
| ·转录因子分析 | 第101-102页 |
| ·差异表达基因的定量验证 | 第102-105页 |
| ·im候选基因预测分析 | 第105-111页 |
| 3 讨论 | 第111-116页 |
| ·im基因对次生壁发育的影响 | 第111页 |
| ·TM-1和im突变体具有不同步的纤维发育进程 | 第111-112页 |
| ·糖代谢与次生壁合成进程 | 第112-113页 |
| ·转录因子 | 第113页 |
| ·im候选基因 | 第113-116页 |
| 全文结论 | 第116-118页 |
| 参考文献 | 第118-138页 |
| 致谢 | 第138-140页 |
| 攻读博士学位期间发表及待发表论文 | 第140页 |
