| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-11页 |
| 缩略词表(Abbreviations) | 第11-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-26页 |
| 1 引言 | 第13-14页 |
| 2 中国奶牛遗传改良现状 | 第14-15页 |
| 3 奶牛基因组DNA提取研究进展 | 第15-16页 |
| 4 分子标记概述 | 第16-19页 |
| ·分子标记的发展简介 | 第16-18页 |
| ·以分子杂交为基础的Ⅰ类分子标记 | 第16-17页 |
| ·以PCR为基础的Ⅱ类分子标记 | 第17-18页 |
| ·以测序为核心的Ⅲ类分子标记及其它标记 | 第18页 |
| ·常用的分子遗传标记原理和特点 | 第18-19页 |
| ·限制性片段长度多态性 | 第18页 |
| ·随机扩增多态性DNA | 第18页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第18-19页 |
| ·微卫星标记 | 第19页 |
| ·微卫星标记 | 第19页 |
| ·单链构象多态性 | 第19页 |
| ·单核苷酸多态性 | 第19页 |
| 5 奶牛泌乳相关基因研究进展 | 第19-23页 |
| 6 BTN基因家族的研究进展 | 第23-24页 |
| 7 HSP基因家族研究进展 | 第24-25页 |
| 8 本研究目的与意义 | 第25-26页 |
| 第二章 从奶牛中提取基因组DNA方法的建立 | 第26-36页 |
| 1 试验材料 | 第26-28页 |
| ·奶样样品 | 第26页 |
| ·血液样品 | 第26页 |
| ·采样方法和数据资料的收集 | 第26页 |
| ·主要仪器设备 | 第26-27页 |
| ·主要试剂及配制 | 第27-28页 |
| ·主要试剂 | 第27页 |
| ·主要试剂的配制 | 第27-28页 |
| 2 试验方法 | 第28-31页 |
| ·DNA的提取 | 第28-30页 |
| ·从牛奶中提取基因组DNA常规法建立 | 第28-29页 |
| ·从牛奶中提取基因组DNA试剂盒法建立 | 第29-30页 |
| ·从牛血液中提取基因组DNA的方法 | 第30页 |
| ·基因组DNA质量和浓度的检测 | 第30页 |
| ·牛奶中提取基因组DNA琼脂糖凝胶电泳检测和PCR检测 | 第30-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-35页 |
| ·常规方法提取DNA肉眼观察结果 | 第31页 |
| ·紫外分光广度计检测DNA纯度和浓度 | 第31-32页 |
| ·DNA含量和体细胞数之间的回归关系 | 第32-33页 |
| ·从奶样和血样中提取基因组DNA效果比较和PCR检测 | 第33-35页 |
| 4 讨论 | 第35页 |
| 5 小结 | 第35-36页 |
| 第三章 BBTN1A1和HSA1B基因SNP位点与产奶性状的关联分析 | 第36-57页 |
| 1 材料与方法 | 第36-43页 |
| ·主要仪器 | 第36页 |
| ·主要试剂及其配置 | 第36页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第36页 |
| ·PCR引物设计合成、反应体系、反应程序、产物检测和PCR-RFLP | 第36-39页 |
| ·PCR引物设计合成 | 第36-37页 |
| ·BBTN1A1基因 | 第36-37页 |
| ·HSPA1B基因 | 第37页 |
| ·PCR反应体系 | 第37-38页 |
| ·BBTN1A1基因 | 第37-38页 |
| ·HSPA1B基因 | 第38页 |
| ·PCR反应程序 | 第38页 |
| ·BBTN1A1基因 | 第38页 |
| ·HSPA1B基因 | 第38页 |
| ·PCR产物检测 | 第38页 |
| ·PCR-RFLP分析 | 第38-39页 |
| ·PCR产物的克隆回收测序 | 第39-40页 |
| ·测序 | 第40页 |
| ·分子生物学软件和数据分析软件 | 第40页 |
| ·分子标记位点的统计分析方法 | 第40-41页 |
| ·基因频率和基因型频率的计算 | 第40页 |
| ·有效等位基因数(Effective number of alleles,Ne) | 第40-41页 |
| ·群体纯合度和杂合度(Ho和He) | 第41页 |
| ·Hardy-Weinberg平衡检测 | 第41页 |
| ·数据统计分析方法 | 第41-43页 |
| ·场、年、季、胎次的确定 | 第41页 |
| ·产奶量的校正 | 第41-42页 |
| ·分子标记位点与荷斯坦牛产奶性能关系的数学模型 | 第42-43页 |
| 2 结果与分析 | 第43-51页 |
| ·BBTN1A1基因SNP位点及其与产奶性状关联分析 | 第43-48页 |
| ·BBTN1A1基因exon 1和exon 3 PCR产物的检测 | 第43页 |
| ·BBTN1A1基因exon 1和exon 3 PCR-RFLP SNP检测 | 第43-44页 |
| ·BBTN1A1基因exon 1和exon 3 SNP测序结果 | 第44-45页 |
| ·BBTN1A1基因SNP位点在牛群中的基因型频率和等位基因频率 | 第45-46页 |
| ·BBTN1A1基因多态性与产奶性状的相关性分析 | 第46-48页 |
| ·HSPA1B基因SNP位点及其与产奶性状关联分析 | 第48-51页 |
| ·HSPA1B基因PCR产物的检测 | 第48页 |
| ·HSPA1B基因PCR-RFLP SNP检测 | 第48-49页 |
| ·HSPA1B基因SNP测序结果 | 第49-50页 |
| ·HSPA1B基因SNP位点Sp Ⅱ-RFLP基因型与产奶性状的统计分析 | 第50-51页 |
| 3 讨论 | 第51-55页 |
| ·试验操作中的几个问题 | 第52页 |
| ·DNA提取方法的改进 | 第52页 |
| ·引物的设计 | 第52页 |
| ·PCR扩增 | 第52页 |
| ·PCR-RFLP分析 | 第52-53页 |
| ·克隆测序分析 | 第53页 |
| ·群体遗传特性分析 | 第53-54页 |
| ·测序结果讨论 | 第54-55页 |
| ·基因型效应与产奶性状相关分析 | 第55页 |
| 4 小结 | 第55-57页 |
| 本研究创新点 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
