| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-14页 |
| ·基因芯片简介 | 第11页 |
| ·采用概率方法的基因芯片数据分析 | 第11-12页 |
| ·本文主要研究内容和思路 | 第12-13页 |
| ·本文的组织结构 | 第13-14页 |
| 第二章 背景知识 | 第14-24页 |
| ·生物背景知识 | 第14-17页 |
| ·基因芯片技术 | 第17-23页 |
| ·基因芯片技术 | 第17页 |
| ·基因芯片实验原理 | 第17-18页 |
| ·Affymetrix 基因芯片原理 | 第18-21页 |
| ·Affymetrix 基因芯片原始数据的噪声特性 | 第21-23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 探针级别数据分析相关方法 | 第24-29页 |
| ·传统方法 | 第24-25页 |
| ·概率方法 | 第25-28页 |
| ·BGX(Bayesian Gene Expression Index) | 第25-26页 |
| ·gMOS 和mgMOS | 第26-27页 |
| ·mmgMOS | 第27-28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第四章 改进的mmgMOS 模型 | 第29-38页 |
| ·探针核苷酸序列和探针灰度的关系 | 第29-31页 |
| ·中央一个核苷酸和MM/PM 的关系 | 第29页 |
| ·中央三个核苷酸和MM/PM 的关系 | 第29-31页 |
| ·mmgMOS 模型的改进 | 第31-33页 |
| ·新模型mmgMOSⅡ的实现 | 第33-37页 |
| ·mmgMOSⅡ模型实现的软件基础 | 第33-34页 |
| ·mmgMOSⅡ模型实现的程序流程图 | 第34页 |
| ·mmgMOSⅡ模型中φ 参数的估计 | 第34-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第五章 实验结果讨论 | 第38-47页 |
| ·HGU-133 Spike-in 数据集 | 第38-40页 |
| ·数据集的描述 | 第38页 |
| ·实验结果分析与讨论 | 第38-40页 |
| ·Mouse Embryo 数据集 | 第40-41页 |
| ·数据集的描述 | 第40-41页 |
| ·实验结果分析与讨论 | 第41页 |
| ·Platinum Spike 数据集 | 第41-46页 |
| ·数据集的描述 | 第41-43页 |
| ·数据结果分析与讨论 | 第43-46页 |
| ·计算效率的比较 | 第46页 |
| ·本章小结 | 第46-47页 |
| 第六章 结束语 | 第47-49页 |
| ·工作总结 | 第47页 |
| ·研究展望 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 在学期间的研究成果与发表的学术论文 | 第53-54页 |
| 附录A | 第54-61页 |
| 附录B | 第61-67页 |
| 附录C | 第67-69页 |