脑膜炎大肠杆菌CE10的基因组学研究

目录	第1-5页
中文摘要	第5-6页
英文摘要	第6-7页
1. 脑膜炎大肠杆菌CE10的基因组学研究	第7-33页
·材料与方法	第7-12页
·菌株和核酸提取	第7页
·高通量测序	第7页
·序列拼接	第7-8页
·序列缺口填补	第8-10页
·序列验证	第10页
·基因组注释	第10-11页
·提交NCBI	第11-12页
·基因组学分析	第12页
·比较基因组学和进化分析	第12页
·CE10基因组中的潜在毒力因子分析	第12页
·结果与讨论	第12-33页
·基因组学分析	第12-21页
·比较基因组学和进化分析	第21-25页
·CE10基因组中的潜在毒力因子分析	第25-33页
2. 文献综述	第33-54页
·基因组学	第33-34页
·微生物基因组学及微生物基因组计划	第34-36页
·生物信息学	第36-38页
·序列分析	第37页
·基因组注释	第37-38页
·计算进化生物学	第38页
·比较基因组学	第38页
·几个基因组学的基本概念	第38-42页
·一致性、相似性和同源性	第38-40页
·趋同进化和趋异进化	第40页
·直系同源和旁系同源	第40-41页
·横向基因转移	第41-42页
·基因组岛和毒力岛	第42页
·基因组学研究的常用生物信息学软件	第42-49页
·序列拼接软件	第42-44页
·基因预测软件	第44-47页
·序列比对软件	第47-49页
·大肠杆菌概况	第49-50页
·新生儿脑膜炎大肠杆菌K1株基因组研究现状	第50页
·Ⅲ型分泌系统	第50-54页
·Ⅲ型分泌系统结构	第51-52页
·Ⅲ型分泌系统蛋白	第52页
·Ⅲ型分泌系统介导感染	第52-53页
·Ⅲ型分泌系统研究中的困境	第53-54页
参考文献	第54-60页
发表文章	第60-61页
致谢	第61-62页