胞内冰生长的理论分析及保护剂溶液氢键特性的MD模拟
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 1 绪论 | 第12-25页 |
| ·选题的科学依据与意义 | 第12-13页 |
| ·细胞冷冻损伤的研究进展 | 第13-23页 |
| ·理论模型 | 第13-15页 |
| ·实验研究 | 第15-21页 |
| ·数值模拟研究 | 第21-23页 |
| ·当前研究的不足 | 第23页 |
| ·本文研究的内容 | 第23-25页 |
| 2 基于软冲突的扩散控制的胞内冰生长模型 | 第25-45页 |
| ·细胞脱水方程 | 第25-27页 |
| ·方程的推导 | 第25-27页 |
| ·方程的适用性 | 第27页 |
| ·扩散控制的胞内冰生长模型 | 第27-28页 |
| ·成核速率 | 第27页 |
| ·晶体半径 | 第27-28页 |
| ·晶核数目 | 第28页 |
| ·冰晶体积 | 第28页 |
| ·冰晶生长的制约因素 | 第28-30页 |
| ·冰晶的相互制约 | 第28-30页 |
| ·细胞脱水对冰晶生长的制约 | 第30页 |
| ·相关参数的确定 | 第30-37页 |
| ·模型细胞和CPA的选择 | 第30页 |
| ·均相成核温度 | 第30-36页 |
| ·其它参数 | 第36-37页 |
| ·模型求解及结果 | 第37-43页 |
| ·模型的求解 | 第37页 |
| ·时间间隔的选取 | 第37-38页 |
| ·临界冷冻速率和临界CPA浓度 | 第38-40页 |
| ·冰晶生长 | 第40-41页 |
| ·PPSI对冰晶生长的影响 | 第41-43页 |
| ·本章小结 | 第43-45页 |
| ·主要内容总结 | 第43-44页 |
| ·作者主要贡献 | 第44-45页 |
| 3 分子动力学模拟方法 | 第45-55页 |
| ·分子动力学模拟方法概述 | 第45-48页 |
| ·发展简史 | 第45页 |
| ·基本原理 | 第45-46页 |
| ·处理细节 | 第46-48页 |
| ·优点和缺点 | 第48页 |
| ·模拟程序 | 第48页 |
| ·简单流体扩散系数的计算 | 第48-54页 |
| ·模拟方法 | 第48-49页 |
| ·模拟体系 | 第49-50页 |
| ·模拟参数选择 | 第50-52页 |
| ·自扩散系数的模拟 | 第52页 |
| ·自扩散系数与温度关系的模拟 | 第52-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 4 保护剂—水二元体系的分子动力学模拟 | 第55-84页 |
| ·模拟细节 | 第56-58页 |
| ·势能模型 | 第56-57页 |
| ·计算细节 | 第57页 |
| ·模拟体系 | 第57-58页 |
| ·平衡的判定 | 第58-60页 |
| ·模拟结果和讨论 | 第60-82页 |
| ·径向分布函数 | 第60-66页 |
| ·甘油分子的构型分布 | 第66页 |
| ·溶液的密度 | 第66-67页 |
| ·氢键分析 | 第67-75页 |
| ·讨论 | 第75-82页 |
| ·本章小结 | 第82-84页 |
| ·主要内容总结 | 第82-83页 |
| ·作者主要贡献 | 第83-84页 |
| 5 保护剂—水—盐三元体系的分子动力学模拟 | 第84-101页 |
| ·模拟细节 | 第84-85页 |
| ·模拟结果和讨论 | 第85-98页 |
| ·径向分布函数 | 第85-90页 |
| ·氢键分析 | 第90-94页 |
| ·离子水合分析 | 第94-96页 |
| ·讨论 | 第96-98页 |
| ·本章小结 | 第98-101页 |
| ·主要内容总结 | 第98-100页 |
| ·作者主要贡献 | 第100-101页 |
| 6 平衡融化温度与溶液氢键结构的关系 | 第101-133页 |
| ·氢键受体数目与供体数目比 | 第101页 |
| ·氢键受体数目与供体数目比与溶液浓度的关系 | 第101-104页 |
| ·氢键受体数目与供体数目比与溶液融化温度的关系 | 第104-131页 |
| ·甘油—水二元体系 | 第104-118页 |
| ·甘油—水—氯化钠三元体系 | 第118-127页 |
| ·讨论 | 第127-131页 |
| ·本章小结 | 第131-133页 |
| ·主要内容总结 | 第131-132页 |
| ·作者主要贡献 | 第132-133页 |
| 7 总结和展望 | 第133-136页 |
| ·主要结论 | 第133-135页 |
| ·研究展望 | 第135页 |
| ·创新点 | 第135-136页 |
| 参考文献 | 第136-152页 |
| 附录A 胞内冰生长模型求解的初始参数 | 第152-153页 |
| 附录B 原子和离子的类型定义 | 第153-154页 |
| 附录C 势能模型的参数 | 第154-156页 |
| 附录D 氢键准则 | 第156-160页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第160-162页 |
| 致谢 | 第162-163页 |
| 作者简介 | 第163-164页 |
