| 摘要 | 第1-16页 |
| ABSTRACT | 第16-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-47页 |
| ·基因芯片技术 | 第19-22页 |
| ·基因芯片的概念及检测流程 | 第19-20页 |
| ·基因芯片的原理、类型和制备 | 第20页 |
| ·杂交信号检测原理 | 第20-21页 |
| ·表达谱芯片 | 第21-22页 |
| ·基因芯片技术在植物病害研究中的应用 | 第22-25页 |
| ·植物—病原物基因组测序 | 第22页 |
| ·寻找新的抗病与致病基因 | 第22-23页 |
| ·植物—病原物基因组表达水平分析检测 | 第23页 |
| ·转基因植物产品检测与植物检疫 | 第23-25页 |
| ·植物 MIRNA研究进展 | 第25-41页 |
| ·植物 MICRORNA功能的多样性 | 第26-39页 |
| ·MIRNA与叶的发育 | 第27-36页 |
| ·MIRNA与花的发育以及营养阶段的改变 | 第36页 |
| ·MIRNA与芽和跟的发育 | 第36-37页 |
| ·MIRNA调控的MIRNA和 SIRNA的BIOGENESIS和功能 | 第37页 |
| ·MIRNA与信号转导、环境压力响应和病毒胁迫的关系 | 第37-39页 |
| ·植物 MICRORNA的保守性 | 第39-41页 |
| ·番茄及CMV研究 | 第41-45页 |
| ·番茄的分布特征、经济价值与作物生产现状 | 第41-43页 |
| ·番茄基因组结构 | 第43-44页 |
| ·番茄病毒病及 CMV基因组结构 | 第44-45页 |
| ·研究内容和目标 | 第45-47页 |
| ·研究内容 | 第46页 |
| ·预期目标 | 第46-47页 |
| 第二章 番茄基因表达芯片的探针设计和芯片体系建立 | 第47-62页 |
| ·材料和方法 | 第48-51页 |
| ·寄主植物 | 第48页 |
| ·体外转录和病毒接种 | 第48-49页 |
| ·样品采集和总RNA提取 | 第49页 |
| ·探针设计 | 第49-50页 |
| ·荧光标记样品CDNA的制备和纯化 | 第50-51页 |
| ·芯片合成和杂交 | 第51页 |
| ·信号检测和数据分析 | 第51页 |
| ·结果与分析 | 第51-59页 |
| ·基因芯片的可靠性分析 | 第51-52页 |
| ·芯片第一代杂交结果分析 | 第52-53页 |
| ·芯片第二代杂交结果分析 | 第53-59页 |
| ·芯片第二代探针的确定 | 第53-55页 |
| ·番茄基因组差异表达分析 | 第55-58页 |
| ·CMV基因组表达分析 | 第58-59页 |
| ·小结与讨论 | 第59-62页 |
| ·CMV侵染引起的番茄基因的表达 | 第59-60页 |
| ·CMV基因组在寄主植物内的表达 | 第60-62页 |
| 第三章 CMV侵染番茄引起的基因时序表达研究 | 第62-78页 |
| ·材料与方法 | 第62-63页 |
| ·寄主植物和芯片 | 第62页 |
| ·体外转录和病毒接种 | 第62页 |
| ·样品采集和总 RNA提取 | 第62-63页 |
| ·荧光标记样品CDNA的制备和纯化 | 第63页 |
| ·芯片杂交 | 第63页 |
| ·信号检测和数据分析 | 第63页 |
| ·结果与分析 | 第63-76页 |
| ·植物症状表现 | 第63-64页 |
| ·微阵列芯片杂交实验和差异表达基因分析 | 第64-65页 |
| ·CMV侵染引起的共调控基因的聚类分析 | 第65-66页 |
| ·CMV侵染引起的共调控基因的功能分析 | 第66-76页 |
| ·小结与讨论 | 第76-78页 |
| 第四章 植物 MICRORNA芯片的探针设计和芯片检测体系建立 | 第78-93页 |
| ·材料与方法 | 第79-82页 |
| ·探针和芯片设计 | 第79页 |
| ·质控错配探针的设计 | 第79-80页 |
| ·实验材料 | 第80页 |
| ·总 RNA的提取 | 第80页 |
| ·荧光标记样品的制备和杂交反应体系 | 第80-81页 |
| ·数据获得和处理 | 第81-82页 |
| ·结果与分析 | 第82-90页 |
| ·芯片设计结果 | 第82-83页 |
| ·芯片参数分析 | 第83-86页 |
| ·探针 GC含量的分布 | 第83-84页 |
| ·探针 TM值的分布 | 第84-85页 |
| ·探针长度的分布 | 第85页 |
| ·探针复杂度(COMPLEXITY FACTOR，CF)的分布 | 第85-86页 |
| ·芯片体系性能分析 | 第86-90页 |
| ·芯片杂交特异性分析 | 第86-88页 |
| ·芯片杂交可靠性分析 | 第88-90页 |
| ·小结与讨论 | 第90-93页 |
| 第五章 番茄 MICRORN确认及其与 CMV侵染关系 | 第93-111页 |
| ·材料与方法 | 第93-95页 |
| ·实验材料 | 第93-94页 |
| ·总 RNA的提取 | 第94页 |
| ·杂交芯片 | 第94页 |
| ·荧光标记样品的制备和杂交反应体系 | 第94页 |
| ·数据获得和处理 | 第94页 |
| ·NORTHERN杂交 | 第94-95页 |
| ·结果与分析 | 第95-105页 |
| ·植物保守性 MIRNA在番茄植物上的表达 | 第95-98页 |
| ·番茄叶子发育过程中显著表达的MIRNA分析 | 第98-100页 |
| ·CMV侵染番茄显著性表达的MIRNA时序表达分析 | 第100-105页 |
| ·植物症状表现 | 第100-101页 |
| ·CMV侵染番茄不同时期 MIRNA和 MIRNA~*的差异表达情况 | 第101-103页 |
| ·CMV侵染番茄不同时期 MIRNA和 MIRNA~*的差异表达图谱分析 | 第103-105页 |
| ·NORTHERN杂交结果验证 | 第105页 |
| ·小结与讨论 | 第105-111页 |
| ·植物 MIRNA的保守性分析 | 第106-108页 |
| ·番茄保守性 MIRNA在生长发育过程中的差异表达 | 第108-109页 |
| ·CMV侵染引起了MIRNA和 MIRNA~*的差异表达 | 第109-111页 |
| 参考文献 | 第111-116页 |
| 附录1. 重要溶液的配制 | 第116页 |
