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基于核糖体基因以及线粒体基因对大熊猫等21种野生动物寄生蛔虫的种系发育分析

中文摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一部分 文献综述第12-23页
 一、大熊猫等野生动物生存现状第12-16页
  1 各科动物感染的蛔虫及危害第13-16页
   ·大熊猫第13-14页
   ·小熊猫第14页
   ·黑猩猩等灵长类动物第14-15页
   ·熊科第15页
   ·犬科和猫科动物第15-16页
 二 分类学研究概况以及常用的遗传标记基因第16-22页
  1 大熊猫、小熊猫、熊科、猫科和犬科动物寄生蛔虫的分类学的研究概况第16-18页
   ·大熊猫、小熊猫、熊科动物和黑猩猩等灵长类动物寄生蛔虫分类学研究第16-17页
   ·犬科和猫科动物寄生的蛔虫分类学研究第17-18页
  2 核糖体18SrDNA、28SrDNA基因以及线粒体12srDNA、cytb基因研究进展第18-22页
   ·核糖体大小亚基18s,28s的研究第18-20页
   ·线粒体小亚基12s基因的研究第20-21页
   ·线粒体Cytb基因的研究第21-22页
 三 研究目的与意义第22-23页
第二部分 研究内容第23-51页
 第一章 基于核糖体18SrDNA、28SrDNA基因和线粒体12SrDNA基因序列对大熊猫等21种野生哺乳动物蛔虫的分析第23-49页
  1 材料与方法第25-33页
   ·试验材料第25-30页
     ·试验样品第25-29页
     ·主要试剂第29页
     ·主要仪器设备第29-30页
     ·主要生物信息学数据库和计算机软件第30页
   ·试验方法第30-33页
     ·虫体总DNA的提取与纯化第30-31页
     ·引物设计第31页
     ·PCR反应扩增体系及程序第31-32页
     ·PCR产物的回收与纯化第32页
     ·序列比对,分析序列差异性第32-33页
     ·序列特征第33页
     ·系统进化树的构建第33页
  2 实验结果第33-46页
     ·序列特征第33-34页
   ·大熊猫等21种野生哺乳动物感染蛔虫的18s、28s和12s三个基因序列分析第34-39页
     ·核糖体18s基因序列分歧度以及相似性分析第34-35页
     ·核糖体28s基因序列分歧度以及相似性分析第35-37页
     ·线粒体12s基因分歧度以及相似性分析第37-39页
   ·分子系统进化树的构建与分析第39-46页
     ·多基因不一致水平检验第39页
     ·系统进化树的构建第39-46页
       ·基于rDNA数据构建的系统进化树第39-42页
       ·基于12s数据构建的系统进化树第42-44页
       ·基于三个基因组合数据构建的系统进化树第44-46页
  3 讨论第46-49页
   ·基因变异性第46页
   ·种群分类鉴定第46-48页
     ·贝蛔属种群第46-47页
     ·蛔属种群第47页
     ·狮弓蛔虫种群第47页
     ·弓首蛔虫种群第47-48页
   ·系统进化分析第48-49页
     ·蛔亚科第48-49页
     ·弓首亚科第49页
 4 小结第49-51页
第二章 对大熊猫等6种动物感染蛔虫的cytb基因的分析第51-57页
 引言第51-52页
 1 材料与方法第52页
   ·材料与试剂第52页
   ·方法第52-53页
     ·蛔虫虫体总DNA的提取第52页
     ·蛔虫cytb基因PCR扩增及测序第52-53页
     ·序列比对分析以及系统进化分析第53页
 2 实验结果与分析第53-55页
   ·6种野生动物感染蛔虫的序列特征第53-54页
   ·系统进化树的构建第54-55页
 3 讨论第55-56页
 4 小结第56-57页
第三部分 结论和创新点第57-59页
 1.结论第57-58页
   ·基于12s、18s和28s基因对大熊猫等21种野生哺乳动物感染的蛔虫的分子分类研究第57-58页
   ·基于cytb基因对大熊猫等6种野生动物感染蛔虫的分子分类研究 #472 创新点第58页
 2 创新点第58-59页
参考文献第59-71页
致谢第71页

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