猪伪狂犬病病毒gC基因的克隆及生物信息学分析

摘要	第1-4页
Abstract	第4-9页
文献综述	第9-29页
一、猪伪狂犬病的概况	第9-21页
1 流行病学	第9-10页
2 病原	第10-16页
·伪狂犬病病毒的主要理化和生物学特性	第10-11页
·伪狂犬病病毒的分子生物学特性	第11-16页
·伪狂犬病病毒的基因组	第11-12页
·伪狂犬病病毒的蛋白及其功能	第12-16页
3 临床症状	第16页
4 病理变化	第16-17页
5 诊断	第17-21页
·血清学诊断技术	第17-19页
·分子生物学诊断技术	第19-21页
·核酸探针诊断技术	第19页
·PCR技术	第19-21页
6 防制	第21页
二、gC基因概况	第21-28页
1 gC基因的功能	第22-23页
·病毒吸附方面	第22页
·影响病毒的释放和病毒粒子的稳定性	第22-23页
·影响毒力	第23页
2 gC的免疫学意义	第23页
3 相关PRV新型疫苗研究	第23-24页
4 生物信息学在病毒研究中的作用	第24-28页
·通过多重序列对齐搜寻保守序列	第25-26页
·通过数量关系的优化推导敏感位点	第26-27页
·通过同源建模预测序列的高级结构	第27-28页
三、实验目的和意义	第28-29页
材料与方法	第29-37页
1 材料	第29-30页
·细胞、毒株、载体和菌株	第29页
·主要试剂及其配制	第29-30页
·主要仪器	第30页
2 方法	第30-37页
·病毒基因组DNA的抽提	第30-31页
·PRV病毒的细胞增殖	第30-31页
·病毒基因组DNA的抽提	第31页
·PRV-gC基因的PCR扩增	第31-32页
·引物的设计与合成	第31页
·gC基因的PCR扩增	第31-32页
·PRV-gC基因的克隆	第32-33页
·PCR产物目的DNA片段的回收	第32页
·质粒载体的准备	第32页
·连接	第32页
·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备	第32-33页
·重组质粒的转化	第33页
·重组质粒的鉴定	第33-34页
·菌落PCR法鉴定	第33页
·酶切鉴定	第33-34页
·gC基因的序列测定	第34页
·gC基因的序列分析	第34-37页
·PRV-gC基因序列的汇总	第34页
·PRV-gC基因核苷酸序列分析	第34-35页
·PRV-gC基因氨基酸序列分析	第35-37页
结果	第37-52页
1 PRV-gC基因的PCR扩增	第37页
2 PRV-gC基因的克隆	第37-38页
·重组质粒菌落PCR法鉴定	第37-38页
·重组质粒的双酶切鉴定	第38页
3 序列测定	第38-39页
4 序列分析	第39-52页
·PRV-gC基因序列汇总	第39-40页
·PRV-gC基因核苷酸序列分析	第40-45页
·PRV-gC基因核苷酸序列同源性分析	第40页
·PRV-gC基因核苷酸高变缺失序列分析	第40-41页
·PRV-gC基因核苷酸序列遗传进化树分析	第41-42页
·PRV-gC基因核苷酸序列酶切位点分析	第42-43页
·PRV-gC基因核苷酸序列密码子偏爱性分析	第43-45页
·PRV-gC基因氨基酸序列分析	第45-52页
·PRV-gC基因氨基酸序列同源性分析	第45页
·PRV-gC蛋白抗原性预测分析	第45-50页
·PRV-gC蛋白高级结构预测	第50-52页
讨论	第52-56页
1 关于伪狂犬病病毒gC基因的克隆	第52页
2 关于PRV-gC基因的核苷酸序列分析	第52-53页
3 关于gC基因变异与抗原性的关系	第53-54页
4 关于PRV-gC蛋白高级结构的预测和分析	第54-56页
结论	第56-57页
参考文献	第57-64页
致谢	第64页