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西藏米拉山高寒草甸土壤微生物多样性研究

摘要第1-8页
Abstract第8-15页
第一章 绪论第15-40页
   ·西藏高寒草甸土壤的基本特征第15-16页
     ·西藏地质形态及土壤概况第15页
     ·西藏高寒草甸土壤微生物概况第15-16页
   ·土壤微生物多样性研究内容第16-18页
     ·土壤微生物物种多样性第16-17页
     ·土壤微生物遗传多样性第17页
     ·土壤微生物生态特征多样性第17-18页
     ·土壤微生物功能多样性第18页
   ·土壤微生物多样性研究方法第18-29页
     ·土壤微生物 DNA 提取技术第18-21页
     ·微生物核糖体 RNA(rRNA)技术第21-22页
     ·分子生态学技术第22-23页
     ·宏基因组学技术第23-29页
   ·土壤微生物硝化功能概况第29-32页
     ·硝化微生物种类第29页
     ·硝化功能基因类型第29-31页
     ·氨氧化微生物研究进展第31-32页
   ·微生物在植物病害生物防治中的应用概况第32-39页
     ·微生物宏基因组学在植物病害生物防治中的应用前景第32-34页
     ·利用微生物防治植物寄生线虫的研究进展第34-39页
   ·本研究的科学问题、目的和意义第39-40页
第二章 西藏高寒草甸土壤微生物总 DNA 提取和纯化方法研究第40-53页
   ·引言第40-41页
   ·西藏高寒草甸土壤微生物总 DNA 的提取方法比较第41-47页
     ·土壤样品的采集和理化性质第41页
     ·土壤微生物 DNA 的提取第41-42页
     ·不同方法提取的 DNA 纯度及效率检测第42-43页
     ·结果与分析第43-45页
     ·讨论第45-47页
   ·西藏高寒草甸土壤微生物总 DNA 的纯化方法比较第47-53页
     ·土壤样品和粗 DNA 制备第47页
     ·土壤微生物 DNA 提纯方法及纯度检测第47-48页
     ·结果与分析第48-50页
     ·讨论第50-53页
第三章 西藏高寒草甸土壤微生物宏基因组质粒文库的构建第53-62页
   ·引言第53页
   ·材料和方法第53-57页
     ·土壤样品采集和理化性质第53页
     ·pUC19 质粒提取、纯化及酶切第53-54页
     ·土壤微生物总 DNA 提取、纯化及酶切第54-55页
     ·构建质粒文库第55-56页
     ·质粒文库插入片段鉴定第56-57页
   ·结果与分析第57-61页
     ·pUC19 质粒质量检测第57页
     ·土壤微生物总 DNA 质量检测第57-58页
     ·土壤微生物总 DNA 酶切体系确定第58-59页
     ·质粒文库插入片段检测第59-61页
   ·讨论第61-62页
第四章 西藏高寒草甸土壤微生物宏基因组 FOSMID 文库的构建第62-68页
   ·引言第62页
   ·材料和方法第62-65页
     ·土壤样品采集和理化性质第62页
     ·土壤微生物总 DNA 的提取及纯化第62-63页
     ·构建 Fosmid 文库第63-64页
     ·Fosmid 文库的质量鉴定第64-65页
   ·结果与分析第65-67页
     ·土壤微生物总 DNA 质量检测第65页
     ·Fosmid 文库插入片段检测第65-67页
   ·讨论第67-68页
第五章 西藏高寒草甸土壤细菌和古菌多样性第68-82页
   ·引言第68页
   ·材料和方法第68-73页
     ·土壤样品的采集和理化性质第68-69页
     ·土壤微生物总 DNA 的提取和纯化第69-70页
     ·细菌16S rRNA 基因的克隆文库构建及测序第70-72页
     ·细菌和古菌16S rRNA 基因序列登录号第72页
     ·细菌和古菌16S rRNA 基因序列分析第72-73页
   ·结果与分析第73-80页
     ·土壤微生物 DNA 提取质量检测第73-74页
     ·细菌16S rRNA 基因文库构建质量检测第74页
     ·细菌和古菌16S rRNA 基因序列的分类、丰度和系统发育分析第74-80页
     ·比较文库间微生物群落结构的差异结果第80页
   ·讨论第80-82页
第六章 西藏高寒草甸土壤氨氧化细菌和古菌多样性第82-91页
   ·引言第82-83页
   ·材料和方法第83-84页
     ·土壤样品的采集和理化性质第83页
     ·土壤微生物总 DNA 的提取和纯化第83页
     ·氨氧化细菌amoA 基因的克隆文库构建及测序第83页
     ·氨氧化细菌和氨氧化古菌amoA 基因序列登录号第83页
     ·氨氧化细菌和氨氧化古菌amoA 基因序列的分析第83-84页
   ·结果与分析第84-89页
     ·氨氧化细菌amoA 基因文库构建质量检测第84-85页
     ·氨氧化细菌和古菌amoA 基因序列的分类、丰度和系统发育分析第85-89页
     ·比较文库间氨氧化微生物群落结构的差异结果第89页
   ·讨论第89-91页
第七章 西藏高寒草甸土壤微生物蛋白酶基因多样性第91-103页
   ·引言第91-92页
   ·材料和方法第92-95页
     ·土壤样品、微生物总 DNA 及宏基因组文库第92页
     ·基于宏基因组 DNA 的丝氨酸蛋白酶基因多样性第92-93页
     ·基于宏基因组pUC19 质粒文库测序分析的蛋白酶基因筛选第93页
     ·基于宏基因组 Fosmid 文库的表达蛋白酶阳性克隆筛选第93-95页
   ·结果与分析第95-101页
     ·丝氨酸蛋白酶基因多样性分析第95-97页
     ·pUC19 质粒文库测序分析筛选蛋白酶基因及其多样性评估第97页
     ·Fosmid 文库中表达蛋白酶阳性克隆筛选结果及序列分析第97-101页
   ·讨论第101-103页
第八章 全文结论第103-107页
   ·结论与讨论第103-106页
   ·需要继续研究的内容第106-107页
附录第107-113页
参考文献第113-128页
致谢第128-129页
作者简历第129页

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