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内毒素诱导的内皮细胞特异性结合肽的筛选及生物信息分析

摘要第1-4页
Abstract第4-8页
1 绪论第8-10页
2 噬菌体展示技术筛选材料与方法第10-27页
   ·材料第10-12页
     ·主要试剂第10页
     ·肽库与脐带来源第10-11页
     ·主要仪器第11页
     ·试剂配制第11-12页
   ·方法第12-16页
     ·HUVEC原代培养第12-13页
     ·HUVEC Ⅷ因子相关抗原间接免疫荧光鉴定方法第13页
     ·Ph.D.-C7C噬菌体环七肽库的滴度测定第13-14页
     ·PEG/NaCl二次沉淀法纯化噬菌体扩增液第14页
     ·BRASIL法筛选噬菌体环七肽库第14-15页
     ·噬菌体DNA的提取及纯化第15页
     ·PCR扩增含插入目的片段的噬菌体DNA第15页
     ·噬菌体DNA序列测定及氨基酸序列推导第15-16页
   ·结果第16-21页
     ·HUVEC原代培养与鉴定结果第16页
     ·Ph.D.-C7C噬菌体展示肽库的库容量测定结果第16页
     ·噬菌体肽库的筛选及富集效果分析第16-17页
     ·噬菌体DNA电泳鉴定结果第17页
     ·PCR产物电泳鉴定结果第17页
     ·PCR产物DNA测序结果及氨基酸序列推导第17-21页
   ·讨论第21-25页
   ·小结第25-27页
3 噬菌体展示肽的生物信息学分析平台建立及分析第27-50页
   ·材料第27-32页
     ·计算机信息处理软件和硬件第27-28页
     ·序列数据和数据库第28-29页
     ·蛋白质序列分析软件第29-32页
   ·方法第32-34页
     ·噬菌体展示七肽序列的去冗余分析第32页
     ·三肽残基的计算及显著性分析第32-33页
     ·特征性短肽残基的分析第33页
     ·包含特征性短肽的人类蛋白的分析第33页
     ·分泌蛋白的预测分析第33-34页
     ·跨膜蛋白的预测分析第34页
   ·结果第34-43页
     ·三肽计算及丰度统计第34-35页
     ·三肽的显著性分析第35页
     ·特征性短肽基序的获得第35页
     ·候选验证噬菌体克隆的分析结果第35-36页
     ·包含特征性短肽的人类蛋白的分析结果第36-37页
     ·分泌蛋白的预测分析结果第37-40页
     ·跨膜蛋白的预测分析结果第40-42页
     ·功能蛋白及相应短肽基序的分析结果第42-43页
   ·讨论第43-48页
     ·生物信息学的发展及其重要性第43-44页
     ·泊松分布检验在本研究中的应用第44页
     ·短肽序列的同源性分析第44-45页
     ·候选验证噬菌体克隆的再筛选第45页
     ·序列相似性比较分析第45-46页
     ·功能蛋白表位模拟肽的分析第46-48页
     ·功能蛋白表位模拟肽的分析第48页
   ·小结第48-50页
结论与讨论第50-51页
参考文献第51-55页
附录第55-56页
攻读学位期间发表的学术论文第56-57页
致谢第57-58页

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