摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-8页 |
1 绪论 | 第8-10页 |
2 噬菌体展示技术筛选材料与方法 | 第10-27页 |
·材料 | 第10-12页 |
·主要试剂 | 第10页 |
·肽库与脐带来源 | 第10-11页 |
·主要仪器 | 第11页 |
·试剂配制 | 第11-12页 |
·方法 | 第12-16页 |
·HUVEC原代培养 | 第12-13页 |
·HUVEC Ⅷ因子相关抗原间接免疫荧光鉴定方法 | 第13页 |
·Ph.D.-C7C噬菌体环七肽库的滴度测定 | 第13-14页 |
·PEG/NaCl二次沉淀法纯化噬菌体扩增液 | 第14页 |
·BRASIL法筛选噬菌体环七肽库 | 第14-15页 |
·噬菌体DNA的提取及纯化 | 第15页 |
·PCR扩增含插入目的片段的噬菌体DNA | 第15页 |
·噬菌体DNA序列测定及氨基酸序列推导 | 第15-16页 |
·结果 | 第16-21页 |
·HUVEC原代培养与鉴定结果 | 第16页 |
·Ph.D.-C7C噬菌体展示肽库的库容量测定结果 | 第16页 |
·噬菌体肽库的筛选及富集效果分析 | 第16-17页 |
·噬菌体DNA电泳鉴定结果 | 第17页 |
·PCR产物电泳鉴定结果 | 第17页 |
·PCR产物DNA测序结果及氨基酸序列推导 | 第17-21页 |
·讨论 | 第21-25页 |
·小结 | 第25-27页 |
3 噬菌体展示肽的生物信息学分析平台建立及分析 | 第27-50页 |
·材料 | 第27-32页 |
·计算机信息处理软件和硬件 | 第27-28页 |
·序列数据和数据库 | 第28-29页 |
·蛋白质序列分析软件 | 第29-32页 |
·方法 | 第32-34页 |
·噬菌体展示七肽序列的去冗余分析 | 第32页 |
·三肽残基的计算及显著性分析 | 第32-33页 |
·特征性短肽残基的分析 | 第33页 |
·包含特征性短肽的人类蛋白的分析 | 第33页 |
·分泌蛋白的预测分析 | 第33-34页 |
·跨膜蛋白的预测分析 | 第34页 |
·结果 | 第34-43页 |
·三肽计算及丰度统计 | 第34-35页 |
·三肽的显著性分析 | 第35页 |
·特征性短肽基序的获得 | 第35页 |
·候选验证噬菌体克隆的分析结果 | 第35-36页 |
·包含特征性短肽的人类蛋白的分析结果 | 第36-37页 |
·分泌蛋白的预测分析结果 | 第37-40页 |
·跨膜蛋白的预测分析结果 | 第40-42页 |
·功能蛋白及相应短肽基序的分析结果 | 第42-43页 |
·讨论 | 第43-48页 |
·生物信息学的发展及其重要性 | 第43-44页 |
·泊松分布检验在本研究中的应用 | 第44页 |
·短肽序列的同源性分析 | 第44-45页 |
·候选验证噬菌体克隆的再筛选 | 第45页 |
·序列相似性比较分析 | 第45-46页 |
·功能蛋白表位模拟肽的分析 | 第46-48页 |
·功能蛋白表位模拟肽的分析 | 第48页 |
·小结 | 第48-50页 |
结论与讨论 | 第50-51页 |
参考文献 | 第51-55页 |
附录 | 第55-56页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第56-57页 |
致谢 | 第57-58页 |