| 目录 | 第1-6页 |
| 中文摘要 | 第6-8页 |
| 英文摘要 | 第8-10页 |
| 第一章 序言 | 第10-20页 |
| ·蛋白质 | 第10-11页 |
| ·蛋白质折叠 | 第11-15页 |
| ·复杂网络在蛋白质折叠中的应用进展 | 第15-18页 |
| ·本文的研究工作 | 第18-20页 |
| 第二章 复杂网络理论基础 | 第20-28页 |
| ·复杂网络的静态几何量 | 第20-23页 |
| ·度及其分布 | 第20-22页 |
| ·集聚系数 | 第22页 |
| ·路径长度 | 第22-23页 |
| ·复杂网络的机制模型 | 第23-28页 |
| ·规则网络(regular network) | 第23-24页 |
| ·随机网络(random network) | 第24-25页 |
| ·小世界网络(small world network) | 第25-26页 |
| ·无标度网络(scale free network) | 第26-28页 |
| 第三章 用小世界网络方法识别小蛋白的疏水核残基和成核残基 | 第28-44页 |
| ·引言 | 第28-29页 |
| ·材料与方法 | 第29-32页 |
| ·研究对象的选取 | 第29-31页 |
| ·网络构造方法及分子动力学模拟 | 第31-32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-42页 |
| ·氨基酸残基网络呈现出小世界特性 | 第32-34页 |
| ·由蛋白质天然态氨基酸网络的介数分布识别疏水核残基 | 第34-36页 |
| ·去折叠路径中网络参数的变化 | 第36-39页 |
| ·由蛋白质折叠过渡态氨基酸网络的介数分布识别小蛋白GB1和CI2的成核残基 | 第39-42页 |
| ·结论 | 第42-44页 |
| 第四章 蛋白质拓扑和折叠动力学的网络分析 | 第44-56页 |
| ·引言 | 第44-45页 |
| ·三种不同尺度网络的构造方法 | 第45-46页 |
| ·研究对象的选取 | 第45页 |
| ·构建PSN,LIN,SIN及相应的随机网络 | 第45-46页 |
| ·PSN,LIN,SIN的网络特征量 | 第46-52页 |
| ·网络的平均度 | 第46-47页 |
| ·小世界特性 | 第47-49页 |
| ·度分布 | 第49-51页 |
| ·节点度的匹配混合特性 | 第51-52页 |
| ·蛋白质网络特征量与折叠速率(lnk_f)和接触序(CO)之间的关系 | 第52-54页 |
| ·二态动力学的相关性 | 第52-54页 |
| ·三态动力学的相关性 | 第54页 |
| ·结论 | 第54-56页 |
| 第五章 总结 | 第56-58页 |
| 附录 | 第58-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 攻读硕士学位期间完成的论文 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
