| 目录 | 第1-6页 |
| 图表索引 | 第6-8页 |
| 英文缩略词 | 第8-9页 |
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| 英文摘要 | 第11-13页 |
| 导论(含文献综述) | 第13-25页 |
| 1 microRNA(miRNA)概述 | 第14-15页 |
| 2 miRNA的分析研究技术 | 第15-16页 |
| 3 miRNA表达谱作为分子标志物的优势 | 第16-19页 |
| 4 miRNA表达谱的研究现状 | 第19-22页 |
| 5 课题研究目的和基本策略 | 第22-25页 |
| 材料与方法 | 第25-37页 |
| 一、实验材料 | 第25-29页 |
| 1 喉鳞癌福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织标本及新鲜冻存(FF)组织标本采集及储存 | 第25-27页 |
| 2 主要试剂 | 第27-28页 |
| ·基因芯片 | 第27页 |
| ·组织切片及染色试剂 | 第27页 |
| ·组织保存、总RNA提取及质控试剂(盒) | 第27-28页 |
| ·miRNA芯片杂交试剂 | 第28页 |
| 3 主要仪器 | 第28-29页 |
| 4 主要分析软件 | 第29页 |
| 二、实验方法 | 第29-37页 |
| 1 喉鳞癌FFPE和FF组织标本的处理及质量鉴定 | 第29页 |
| 2 喉鳞癌FFPE和FF组织总RNA制备及质量控制 | 第29-31页 |
| ·喉鳞癌FFPE组织总RNA的提取 | 第30页 |
| ·喉鳞癌FF组织总RNA的提取 | 第30-31页 |
| ·RNA样品的质量控制 | 第31页 |
| 3 miRNA表达谱芯片杂交、清洗、扫描、数据提取 | 第31-36页 |
| ·准备标记反应 | 第31-33页 |
| ·准备l0×阻滞剂 | 第33页 |
| ·准备杂交样品 | 第33页 |
| ·准备杂交盒 | 第33页 |
| ·芯片清洗 | 第33-35页 |
| ·芯片扫描和数据提取 | 第35-36页 |
| 4 miRNA表达谱芯片的数据分析 | 第36-37页 |
| 结果 | 第37-61页 |
| 1 喉鳞癌FFPE和FF组织的miRNA芯片杂交分析 | 第37-42页 |
| ·被测组织样品肿瘤细胞含量的控制 | 第37-38页 |
| ·从被测组织样品中获得高质量总RNA | 第38-41页 |
| ·杂交后芯片的扫描 | 第41页 |
| ·杂交后芯片数据的提取 | 第41-42页 |
| 2 喉鳞癌FFPE和FF组织的miRNA表达谱实验数据的分析 | 第42-61页 |
| ·杂交芯片的质量控制 | 第42-43页 |
| ·喉鳞癌FFPE和FF组织miRNA表达谱的芯片数据分析 | 第43-61页 |
| ·芯片原始数据标准化 | 第43-45页 |
| ·FFPE和FF组织中miRNA表达谱分析 | 第45-48页 |
| ·差异miRNA表达分析 | 第48-59页 |
| ·差异表达miRNA靶基因预测及分析 | 第59-61页 |
| 讨论 | 第61-69页 |
| 1 将福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织用于miRNA芯片研究 | 第61-62页 |
| 2 喉鳞癌FFPE组织miRNA表达谱与现有相关研究资料的比对分析 | 第62-64页 |
| 3 喉鳞癌新鲜冻存组织miRNA表达谱与现有相关研究资料的比对分析 | 第64-65页 |
| 4 喉鳞癌福尔马林固定石蜡包埋组织与新鲜冻存组织miRNA表达谱数据的比对分析 | 第65-67页 |
| 5 喉鳞癌相关miRNA的靶基因预测和GO分析及其意义 | 第67-68页 |
| 6 审视与展望 | 第68-69页 |
| 小结 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-75页 |
| 课题资助基金 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
