中文摘要 | 第1-16页 |
ABSTRACT | 第16-20页 |
缩略词 | 第20-22页 |
前言 | 第22-28页 |
1. 糖尿病病证结合研究的意义 | 第22-24页 |
·糖尿病研究的重要性 | 第22页 |
·中医药治疗糖尿病的优势 | 第22页 |
·糖尿病辨证研究的现状及不足 | 第22-23页 |
·肾虚证在糖尿病发生演变过程中的地位 | 第23页 |
·糖尿病和肾虚证结合的病证结合研究方法 | 第23-24页 |
2. 多学科方法结合研究复杂疾病的意义 | 第24-25页 |
·糖尿病和肾虚证的复杂疾病特性 | 第24页 |
·多学科方法的整合研究复杂疾病的优势 | 第24-25页 |
3. 糖尿病肾虚证微观遗传特征研究—家系双生子研究方法 | 第25-28页 |
·从遗传学角度切入糖尿病肾虚证研究的意义 | 第25页 |
·家系及双生子样本研究糖尿病肾虚证的优势 | 第25页 |
·基因芯片技术整合家系双生子研究的方法学平台 | 第25-28页 |
第一部分 肾虚证在糖尿病群体中的分布特征研究 | 第28-48页 |
引言 | 第28页 |
1. 资料与方法 | 第28-32页 |
·糖尿病西医诊断标准 | 第28-29页 |
·纳入标准 | 第29页 |
·排除标准 | 第29页 |
·肾虚证辨证标准 | 第29页 |
·糖尿病四诊症状调查表 | 第29-30页 |
·病例资料来源及内容 | 第30页 |
·糖尿病病历资料症状术语规范 | 第30-31页 |
·症状指标赋值 | 第31页 |
·糖尿病调查结果的录入 | 第31页 |
·数据分析方法 | 第31-32页 |
·一般的数学统计方法 | 第31页 |
·新型的模型判别方法 | 第31-32页 |
2. 结果 | 第32-43页 |
·病例的一般信息 | 第32-34页 |
·性别分布 | 第32页 |
·年龄分布 | 第32-33页 |
·病程分布 | 第33-34页 |
·证候分布统计分析结果 | 第34-43页 |
·症状出现频率描述 | 第34-35页 |
·系统聚类分析 | 第35-36页 |
·因子分析 | 第36-41页 |
·各成分的公因子方差 | 第36-37页 |
·采用方差最大旋转法后的因子载荷 | 第37-38页 |
·因子载荷碎石图及散点图 | 第38-39页 |
·提取的主因子及其辩证 | 第39页 |
·根据因子得分矩阵进行系统聚类分析 | 第39-41页 |
·聚类图 | 第39-40页 |
·各因子聚类层次所解释的症状指标及其辨证 | 第40-41页 |
·广义词典模型判别 | 第41-43页 |
·广义词典模型判别得到的23个症状模块 | 第41-42页 |
·将23个症状模块辨证组合得到的9个证候模块 | 第42-43页 |
3. 讨论 | 第43-48页 |
·糖尿病四诊症状调查表的制定 | 第43-44页 |
·病历资料的可靠性及可利用性 | 第44页 |
·病历数据症状术语规范的必要性 | 第44-45页 |
·多元统计方法在糖尿病肾虚证分布研究中的运用 | 第45-47页 |
·聚类分析方法 | 第45页 |
·因子分析方法 | 第45-46页 |
·广义词典模型新方法的应用 | 第46-47页 |
·肾虚证是糖尿病的基础证候 | 第47-48页 |
第二部分 糖尿病家系中肾虚证分布特征研究 | 第48-64页 |
引言 | 第48-49页 |
1. T2DM家族史背景调查 | 第49-52页 |
·对象与方法 | 第49页 |
·调查对象 | 第49页 |
·调查内容 | 第49页 |
·调查方法 | 第49页 |
·调查结果 | 第49-52页 |
·T2DM家族史阳性组和阴性组性别分布比较 | 第49页 |
·T2DM家族史阳性组和阴性组年龄分布比较 | 第49-50页 |
·T2DM家族史阳性组和阴性组病程分布比较 | 第50-51页 |
·症状定性总分比较 | 第51页 |
·相关因素logistic回归分析 | 第51-52页 |
2. 典型T2DM家系及家系双生子证候调查 | 第52-62页 |
·调查对象 | 第52页 |
·调查途径 | 第52-53页 |
·调查方法 | 第53-54页 |
·T2DM家系筛选标准 | 第53页 |
·纳入标准 | 第53页 |
·排除标准 | 第53页 |
·糖尿病四诊症状调查表 | 第53页 |
·双生子卵型鉴别方法 | 第53-54页 |
·调查内容 | 第54页 |
·结果 | 第54-62页 |
·家系调查一般情况 | 第54页 |
·四川彭州蒲姓T2DM家系 | 第54-57页 |
·家系图 | 第54-55页 |
·OGTT检测结果 | 第55页 |
·糖尿病四诊症状调查表调查结果 | 第55-57页 |
·成都陈姓双生子家系 | 第57-60页 |
·家系图 | 第57页 |
·OGTT检测结果 | 第57-58页 |
·糖尿病四诊症状调查表调查结果 | 第58-59页 |
·OGTT结果异常者和正常者之间症状总分比较 | 第59-60页 |
·北京吕姓双生子家系 | 第60-62页 |
·家系图 | 第60页 |
·临床生化检测结果 | 第60-61页 |
·四诊症状调查表调查结果 | 第61-62页 |
·双生子病证结合调查结果 | 第62页 |
3. 讨论 | 第62-64页 |
·糖尿病家系中肾虚证的家族聚集性 | 第62-63页 |
·同卵双生子病和证的罹患一致性 | 第63-64页 |
第三部分 糖尿病肾虚证家系双生子基因表达谱研究 | 第64-94页 |
引言 | 第64页 |
1. 试验对象 | 第64-65页 |
2. 材料与方法 | 第65-71页 |
·标本的采集与分离白细胞 | 第65页 |
·主要仪器与试剂 | 第65页 |
·实验步骡 | 第65页 |
·RNA 的提取 | 第65-67页 |
·主要仪器与试剂 | 第65页 |
·实验步骤 | 第65-67页 |
·物品器械的去RNA酶处理 | 第65-66页 |
·总RNA的提取 | 第66页 |
·总RNA的纯化 | 第66-67页 |
·RNA样品质量检测 | 第67页 |
·基因芯片检测 | 第67-69页 |
·基因芯片的制备 | 第67-68页 |
·主要仪器与试剂 | 第67页 |
·基因芯片的制备 | 第67-68页 |
·对样品RNA进行荧光标记 | 第68页 |
·基因芯片的杂交 | 第68-69页 |
·主要仪器与试剂 | 第68-69页 |
·基因芯片的杂交与清洗 | 第69页 |
·基因芯片的扫描 | 第69页 |
·芯片图像的采集与数据分析 | 第69页 |
·基因芯片实验分组 | 第69页 |
·基因表达谱数据分析工具 | 第69-71页 |
·SOURCE | 第69-70页 |
·Gene Ontology(GO) | 第70页 |
·KEGG | 第70页 |
·SAM | 第70-71页 |
·FuncAssociate | 第71页 |
3. 结果 | 第71-89页 |
·蒲姓家系基因芯片检测结果 | 第71-75页 |
·RNA样品质检结果 | 第71-72页 |
·显著基因筛选结果 | 第72-75页 |
·SAM plot | 第72-73页 |
·显著表达基因 | 第73-74页 |
·81个显著表达基因GO功能注释 | 第74-75页 |
·81个显著基因KEGG通路注释 | 第75页 |
·吕姓双生子家系基因芯片检测结果 | 第75-79页 |
·RNA样品质检结果 | 第75-76页 |
·显著表达基因筛选结果 | 第76-79页 |
·SAM plot | 第76-77页 |
·显著表达基因 | 第77-78页 |
·70个显著表达基因GO功能注释 | 第78-79页 |
·70个显著表达基因KEGG通路注释 | 第79页 |
·非家系T2DM患者基因芯片检测结果 | 第79-84页 |
·RNA样品质检结果 | 第79-80页 |
·显著表达基因筛选结果 | 第80-84页 |
·SAM plOt | 第80-81页 |
·显著表达基因 | 第81-82页 |
·99个显著表达基因GO功能注释 | 第82-83页 |
·99个显著表达基因KEGG通路注释 | 第83-84页 |
·家系及双生子基因表达谱比较结果 | 第84-89页 |
·吕姓双生子之间基因表达谱比较结果 | 第84-88页 |
·相同差异表达基因 | 第84-85页 |
·双生子相同差异表达基因GO功能注释 | 第85页 |
·双生子相同差异表达基因KEGG通路注释 | 第85-86页 |
·双生子之间差异表达基因GO功能类及Pathway比较 | 第86-88页 |
·家系非家系差异基因表达谱比较结果 | 第88页 |
·家系差异表达基因相关的疾病比较结果 | 第88-89页 |
4. 讨论 | 第89-94页 |
·引入家系双生子样本研究糖尿病肾虚证的意义 | 第89-90页 |
·糖尿病肾虚证差异基因表达谱分析 | 第90-92页 |
·蒲姓家系基因表达谱分析 | 第90-91页 |
·吕姓双生子家系基因表达谱分析 | 第91页 |
·非家系糖尿病肾虚证的基因表达谱分析 | 第91-92页 |
·双生子、家系及非家系差异基因功能比较研究 | 第92页 |
·糖尿病肾虚证免疫遗传机制探讨 | 第92-94页 |
第四部分 糖尿病肾虚证免疫基因的QPCR验证 | 第94-113页 |
引言 | 第94-95页 |
1. 材料与方法 | 第95-101页 |
·临床样本的采集 | 第95页 |
·主要试剂及仪器 | 第95-96页 |
·采集血样和分离白细胞所需试剂和仪器 | 第95页 |
·提取RNA所需试剂和仪器 | 第95-96页 |
·RNA专用试剂和耗材的处理 | 第96页 |
·实时定量PCR实验试剂及仪器 | 第96页 |
·引物的设计、合成及相关网站 | 第96-97页 |
·实时定量PCR实验步骤 | 第97-100页 |
·血样的采集和白细胞的分离 | 第97页 |
·RNA的提取 | 第97-98页 |
·RNA质量鉴定 | 第98页 |
·cDNA第一链合成 | 第98-99页 |
·目的基因片段的普通PCR扩增 | 第99页 |
·实时定量PCR检测 | 第99-100页 |
·配制主混液 | 第99页 |
·荧光定量PCR循环条件 | 第99-100页 |
·仪器的操作 | 第100页 |
·各基因定量PCR扩增产物的鉴定 | 第100页 |
·各基因mRNA相对表达水平分析 | 第100页 |
·统计学分析 | 第100-101页 |
2. 结果 | 第101-108页 |
·病例组和对照组四诊症状调查表评分结果 | 第101-102页 |
·各样本RNA质检结果 | 第102-103页 |
·各样本RNA紫外分析测定结果 | 第102-103页 |
·各样本RNA质控图 | 第103页 |
·实时定量PCR结果 | 第103-108页 |
·扩增曲线和熔解曲线 | 第103-106页 |
·各基因mRNA在两组样本中的相对表达水平比较 | 第106-107页 |
·实时定量PCR结果与基因芯片结果比较 | 第107-108页 |
3. 讨论 | 第108-113页 |
·病例的选择 | 第108-109页 |
·实时定量PCR结果分析 | 第109-111页 |
·CCR3 | 第109-110页 |
·IL-10 | 第110页 |
·IL-1β | 第110-111页 |
·IL20RA | 第111页 |
·细胞因子-细胞因子受体相互作用通路与T2DM肾虚证 | 第111-112页 |
·基因芯片与定量PCR结果比较分析 | 第112-113页 |
结语 | 第113-115页 |
问题与展望 | 第115-117页 |
参考文献 | 第117-132页 |
致谢 | 第132-133页 |
文献综述——糖尿病流行病学研究策略及分子遗传学研究进展 | 第133-151页 |
1. 糖尿病临床流行病学研究概况 | 第134-137页 |
·发病概况研究 | 第134-135页 |
·糖尿病危险因素 | 第135-137页 |
·家族史 | 第135页 |
·肥胖 | 第135-136页 |
·高血压 | 第136页 |
·体力活动 | 第136页 |
·年龄 | 第136页 |
·睡眠 | 第136-137页 |
·糖尿病中医证候流行病学研究 | 第137页 |
2. 糖尿病遗传流行病学研究策略 | 第137-139页 |
·家系研究 | 第137-138页 |
·双生子研究 | 第138-139页 |
·双生子及其家系研究 | 第139页 |
·遗传流行病学和基因芯片技术的结合 | 第139页 |
3. 分子流行病学及候选基因研究 | 第139-142页 |
·胰岛素基因(INS) | 第139-140页 |
·过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPARG) | 第140页 |
·肝细胞核因子4α(HNF-4α) | 第140页 |
·钙蛋白酶10(CAPN10) | 第140页 |
·钾离子内向整流通道蛋白J亚单位11号成员(KCNJ11) | 第140-141页 |
·磷脂酰肌醇-3-激酶调节亚单位多肽(PIK3R1) | 第141页 |
·钾电压门通道KQT样亚单位1号成员(KCNQl) | 第141页 |
·转录因子7-L2(TCF7L2) | 第141-142页 |
4. 展望 | 第142页 |
参考文献 | 第142-151页 |
附件1:128项糖尿病四诊症状调查表 | 第151-154页 |
附件2:采用方差最大旋转法后的20个因子载荷 | 第154-158页 |
附件3:广义词典模型新方法的计算数据 | 第158-161页 |
附件4:双生子卵型相似判断表 | 第161-162页 |
附件5:公开发表的学术论文、专著及科研成果 | 第162-165页 |