| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 缩写表 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-24页 |
| 第一章 龟鳖目淡水龟科具闭壳结构龟类的线粒体基因组研究进展 | 第12-24页 |
| 1 脊椎动物线粒体基因组 | 第12-14页 |
| 2 淡水龟科闭壳龟类的线粒体基因组 | 第14-20页 |
| ·淡水龟科闭壳龟类简介 | 第14-15页 |
| ·闭壳龟类线粒体基因组的结构和特征 | 第15-17页 |
| ·mtDNA 在闭壳龟类系统发生中的应用 | 第17-20页 |
| 参考文献 | 第20-24页 |
| 第二部分 研究论文 | 第24-58页 |
| 第二章 黄缘盒龟和黄额盒龟mtDNA 全序列的测定与分析 | 第24-37页 |
| 1 材料和方法 | 第25-27页 |
| ·实验材料 | 第25页 |
| ·基因组DNA 的提取 | 第25页 |
| ·引物设计和PCR 扩增 | 第25-27页 |
| ·DNA 序列数据处理及分析 | 第27页 |
| 2 结果 | 第27-33页 |
| ·基因组结构和基因排布 | 第27-29页 |
| ·碱基组成 | 第29页 |
| ·蛋白编码基因 | 第29-32页 |
| ·rRNA 和tRNA 基因 | 第32页 |
| ·轻链复制起始点（OL） | 第32-33页 |
| 3 讨论 | 第33-34页 |
| 参考文献 | 第34-37页 |
| 第三章 淡水龟科5 种具闭壳结构龟类线粒体基因组控制区的比较研究 | 第37-48页 |
| 1 材料与方法 | 第38-39页 |
| ·材料和基因组DNA 的提取 | 第38页 |
| ·Long-PCR 和测序 | 第38页 |
| ·序列分析 | 第38-39页 |
| 2 结果 | 第39-42页 |
| ·5 种闭壳龟类控制区序列的碱基组成及结构分析 | 第39-42页 |
| ·控制区 3’端的微卫星序列 | 第42页 |
| 3 讨论 | 第42-44页 |
| ·5 种闭壳龟类控制区的基因结构特点 | 第42-43页 |
| ·关于微卫星的起源与进化 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 第四章 基于mtDNA全序列探讨淡水龟科具闭壳结构龟类及龟鳖类动物的系统发生关系 | 第48-58页 |
| 1 方法 | 第50-52页 |
| ·物种的选择 | 第50-51页 |
| ·系统发生分析 | 第51-52页 |
| 2 结果与分析 | 第52页 |
| 3 讨论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 致谢 | 第58-59页 |
| 附录：硕士在读期间科研及发表论文及获奖情况 | 第59页 |
