| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-14页 |
| 第一部分 文献综述 | 第14-48页 |
| 1 肝脏 | 第14-16页 |
| ·肝脏的结构 | 第14-16页 |
| ·肝脏的功能 | 第16页 |
| 2 肝再生 | 第16-28页 |
| ·肝再生动物模型 | 第17-18页 |
| ·肝再生进程及调控 | 第18-27页 |
| ·肝再生中肝脏细胞间相互作用关系 | 第27-28页 |
| 3 肝窦内皮细胞与肝再生 | 第28-29页 |
| 4 肝窦内皮细胞 | 第29-35页 |
| ·肝窦内皮细胞的结构 | 第29-30页 |
| ·肝窦内皮细胞的异质性 | 第30页 |
| ·肝窦内皮细胞的标志物 | 第30-31页 |
| ·肝窦内皮细胞表面的特异受体 | 第31-32页 |
| ·肝窦内皮细胞的功能 | 第32-35页 |
| 5 肝窦内皮细胞的分离和纯化 | 第35-36页 |
| 6 高通量基因表达谱检测 | 第36-37页 |
| 参考文献 | 第37-48页 |
| 第二部分 大鼠肝再生中肝窦内皮细胞的基因表达谱分析 | 第48-143页 |
| 引言 | 第50-51页 |
| 第一章 材料与方法 | 第51-73页 |
| 1 实验动物与分组 | 第51页 |
| 2 大鼠2/3 肝切除模型制备 | 第51-52页 |
| ·实验用品 | 第51页 |
| ·操作步骤 | 第51-52页 |
| 3 大鼠肝脏细胞的分散 | 第52-53页 |
| ·实验用品 | 第52页 |
| ·试剂配制 | 第52-53页 |
| ·操作步骤 | 第53页 |
| 4 肝窦内皮细胞的分离和纯化 | 第53-55页 |
| ·实验用品 | 第53-54页 |
| ·试剂配制 | 第54页 |
| ·操作步骤 | 第54-55页 |
| 5 肝窦内皮细胞的鉴定 | 第55-61页 |
| ·免疫细胞化学检测 | 第55-56页 |
| ·免疫组织化学检测 | 第56-57页 |
| ·Western blot 检测 | 第57-61页 |
| 6 总RNA 的提取与纯化 | 第61-62页 |
| ·总RNA 的提取 | 第61页 |
| ·RNA 质量检测 | 第61-62页 |
| ·总RNA 的纯化 | 第62页 |
| ·纯化的总RNA 质量检测 | 第62页 |
| 7 cDNA、cRNA 的合成与纯化 | 第62-65页 |
| ·cDNA 的合成与纯化 | 第62-64页 |
| ·cRNA 的合成与纯化 | 第64-65页 |
| 8 cRNA 片段化和Rat Genome 230 2.0 芯片检测 | 第65-67页 |
| ·cRNA 片段化 | 第65页 |
| ·杂交液的配制 | 第65页 |
| ·芯片预杂交和杂交 | 第65-66页 |
| ·芯片洗脱 | 第66页 |
| ·芯片扫描 | 第66页 |
| ·芯片检测数据的获取、预处理、均一化及数据转换 | 第66-67页 |
| ·芯片检测数据的校正 | 第67页 |
| 9 荧光定量RT-PCR 检测芯片结果的可靠性 | 第67-69页 |
| ·引物的设计与合成 | 第67-68页 |
| ·标准曲线的建立 | 第68-69页 |
| ·定量PCR 检测 | 第69页 |
| ·定量分析 | 第69页 |
| 10 基因芯片数据分析 | 第69-70页 |
| ·大鼠再生肝窦内皮细胞中肝再生相关基因的确认 | 第69页 |
| ·基因的聚类分析 | 第69-70页 |
| ·基因的表达模式分析 | 第70页 |
| 11 基因功能注释及统计学分析 | 第70页 |
| 12 基因协同作用分析 | 第70-71页 |
| 13 大鼠未知基因编码产物的亚细胞定位预测 | 第71-73页 |
| ·未知基因电子克隆 | 第71页 |
| ·大鼠蛋白亚细胞定位方法的建立 | 第71-72页 |
| ·预测未知基因编码产物的亚细胞定位 | 第72-73页 |
| 第二章 研究结果 | 第73-121页 |
| 1 大鼠肝再生中肝系数变化 | 第73-74页 |
| 2 大鼠肝再生中肝窦内皮细胞形态结构变化 | 第74-77页 |
| 3 大鼠肝再生中肝窦内皮细胞数量变化 | 第77-79页 |
| 4 大鼠肝再生中窦内皮细胞的标志蛋白及其mRNA 的含量变化 | 第79-80页 |
| 5 大鼠肝再生中肝窦内皮细胞基因转录表达谱概述 | 第80-85页 |
| 6 荧光定量RT-PCR 检测结果与Rat Genome 230 2.0 芯片结果比较 | 第85-88页 |
| 7 大鼠再生肝窦内皮细胞中肝再生相关的已知基因的表达谱分析 | 第88-115页 |
| ·基因的表达模式分析 | 第88-89页 |
| ·基因功能注释 | 第89-92页 |
| ·八种表达模式中基因功能群的富集分析 | 第92-96页 |
| ·显著富集的功能群在大鼠部分肝切除后窦内皮细胞中的活动变化 | 第96-97页 |
| ·凝血反应相关基因的转录谱变化 | 第97-99页 |
| ·肝窦内皮细胞重要的生理功能---吞噬作用和运输相关基因的转录谱变化 | 第99-101页 |
| ·解毒作用相关基因的差异表达调控 | 第101-102页 |
| ·活性物质分泌调控相关基因的转录谱变化 | 第102-103页 |
| ·防御应答、免疫炎症及免疫炎症信号途径相关基因的转录谱变化 | 第103-106页 |
| ·细胞信号转导相关基因的转录谱变化 | 第106-108页 |
| ·氨基酸代谢和糖代谢相关基因的差异表达调控 | 第108-109页 |
| ·蛋白质代谢相关基因的转录谱变化 | 第109-111页 |
| ·细胞生长增殖相关基因的转录谱变化 | 第111-112页 |
| ·细胞分化相关基因的转录谱变化 | 第112-113页 |
| ·细胞凋亡相关基因的转录谱变化 | 第113-115页 |
| 8 大鼠肝窦内皮细胞中肝再生相关未知基因的功能预测 | 第115-121页 |
| ·大鼠蛋白亚细胞定位预测数据库构建 | 第115-116页 |
| ·未知基因亚细胞定位预测结果 | 第116-121页 |
| 第三章 讨论 | 第121-134页 |
| 参考文献 | 第134-143页 |
| 第三部分 结论 | 第143-145页 |
| 附录 1 英文缩略语 | 第145-149页 |
| 附录 2 主要实验仪器 | 第149-150页 |
| 个人简介 | 第150-151页 |
| 在攻读博士学位期间参加的科研项目和发表的论文 | 第151-152页 |
| 致谢 | 第152页 |
