| 英文缩略词表 | 第5-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 引言 | 第10-13页 |
| 实验材料与方法 | 第13-33页 |
| 1. 实验材料 | 第13-15页 |
| 1.1 主要试剂 | 第13-14页 |
| 1.2 实验仪器 | 第14-15页 |
| 2. 实验方法 | 第15-33页 |
| 2.1 细胞培养 | 第15页 |
| 2.2 双荧光素酶报告基因载体的构建 | 第15-21页 |
| 2.3 双荧光素酶报告基因实验 | 第21页 |
| 2.4 CRISPR系统相关的质粒载体构建 | 第21-24页 |
| 2.5 基因组编辑技术 | 第24-27页 |
| 2.6 制备RNA-seq测序样品 | 第27页 |
| 2.7 CRISPR干扰实验 | 第27-30页 |
| 2.8 细胞增殖活性检测实验 | 第30-31页 |
| 2.9 生物信息学分析 | 第31-33页 |
| 结果 | 第33-44页 |
| 1. rs6858698位点功能的生物信息学分析 | 第33-34页 |
| 1.1 SNP位点rs6858698的DNA敏感位点及组蛋白修饰信号 | 第33页 |
| 1.2 SNP位点rs6858698的转录因子结合情况 | 第33-34页 |
| 2. SNP位点rs6858698所在DNA片段的双荧光结果 | 第34-35页 |
| 3. CRISPR/Cas9系统介导的基因组编辑 | 第35-36页 |
| 4. RNA-seq分析不同基因型细胞之间的基因表达差异情况 | 第36-42页 |
| 4.1 RNA-seq测序分析不同样品之间的相关性 | 第36-37页 |
| 4.2 差异表达基因变化情况 | 第37-38页 |
| 4.3 GO生物学过程富集分析结果 | 第38-40页 |
| 4.4 KPA信号通路富集分析结果 | 第40-41页 |
| 4.5 差异表达基因之间的共表达分析 | 第41-42页 |
| 5. qPCR验证RNA-seq的分析结果 | 第42页 |
| 6. CRISPR干扰实验验证RNA-seq的分析结果 | 第42-43页 |
| 7. SNP位点rs6858698对细胞表型的影响 | 第43-44页 |
| 结论 | 第44-45页 |
| 讨论 | 第45-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 综述 | 第53-66页 |
| 参考文献 | 第61-66页 |
| 附录1: ENCODE内的ChIP-seq数据下载地址 | 第66-68页 |
| 附录2: RNA-seq分析出的差异表达基因列表 | 第68-73页 |
| 附录3: 信号通路富集分析中涉及的Key Hubs | 第73-74页 |
| 附录4: Key Hubs基因所对应的差异表达基因 | 第74-76页 |
| 个人简历 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-79页 |
