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催化RNA切割反应的新型短结合臂脱氧核酶

摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
第一章 前言第12-20页
    1.SELEX技术的基本原理第12-13页
    2.脱氧核酶及其功能第13页
    3.两种普适性的脱氧核酶及其应用第13-15页
    4.本课题的研究目标和内容第15-16页
    参考文献第16-20页
第二章 催化RNA切割反应的脱氧核酶的体外筛选第20-31页
    1.引言第20页
    2.实验材料第20-21页
        2.1 核酸,蛋白酶和感受态细胞第20-21页
        2.2 实验试剂及耗材第21页
        2.3 实验仪器第21页
    3.实验方法第21-24页
        3.1 催化RNA切割反应的脱氧核酶的体外筛选方案第21-23页
        3.2 10-12opt切割产物的鉴定第23-24页
    4.结果与讨论第24-30页
        4.1 催化RNA切割反应的脱氧核酶的体外筛选流程第24-25页
        4.2 活性脱氧核酶的挑选,命名及其底物切割位点的鉴定第25-26页
        4.3 对10-12结合臂的初步优化第26-27页
        4.4 对10-12催化环的优化第27-28页
        4.5 10-12opt与8-17同源性分析第28-29页
        4.6 利用质谱对10-12opt的切割产物进行分析第29-30页
    参考文献第30-31页
第三章 10-12OPT的生物化学参数表征第31-54页
    1.引言第31-32页
    2.实验材料第32页
        2.1 核酸,蛋白酶第32页
        2.2 实验试剂及耗材第32页
        2.3 实验仪器第32页
    3.实验方法第32-39页
        3.1 10-12opt保守碱基及非经典碱基对上的基团保守性分析第32-33页
        3.2 10-12opt对底物切割位点选择性分析第33页
        3.3 FRET分析镁离子诱导的10-12opt与底物复合物的空间折叠第33-34页
        3.4 10-12opt对二价金属离子的依赖性及pH依赖性分析第34页
        3.5 10-12opt的动力学测定第34-39页
    4.结果与讨论第39-53页
        4.1 10-12opt左侧结合臂及催化环的保守碱基分析第39-40页
        4.2 10-12opt左侧结合臂非经典碱基对的深入研究第40-43页
        4.3 10-12opt对底物切割位点的碱基选择性分析第43-44页
        4.4 10-12opt 7号位T与切割位点碱基相互作用分析第44-45页
        4.5 10-12opt的结合臂长度对催化活性的影响第45-47页
        4.6 缩短的10-12opt左侧结合臂上非经典碱基对特异性分析第47-48页
        4.7 荧光共振能量转移分析镁离子诱导的10-12opt与底物的构象第48-50页
        4.8 10-12opt的金属离子依赖性分析第50-51页
        4.9 10-12opt的pH依赖性分析第51-52页
        4.10 10-12opt的酶切反应动力学分析第52-53页
    参考文献第53-54页
第四章 10-12OPT在切割MICRORNA及ATP传感器中的应用第54-60页
    1.引言第54页
    2.实验材料第54-55页
        2.1 核酸第54-55页
        2.2 实验试剂及耗材第55页
        2.3 实验仪器第55页
    3.实验方法第55-56页
        3.1 10-12opt对不同切割位点的microRNA序列的体外剪切第55页
        3.2 10-12opt参与构建的ATP传感器对靶标的特异性检测第55-56页
    4.结果与讨论第56-59页
        4.1 10-12opt能切割位点不同的microRNA序列第56-57页
        4.2 10-12opt参与构建的ATP传感器能对ATP分子实现特异性检测第57-59页
    参考文献第59-60页
结论第60-62页
讨论第62-66页
致谢第66-68页

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