| 摘要 | 第9-12页 |
| Abstract | 第12-16页 |
| 第1章 绪论 | 第17-28页 |
| 1.1 海马齿简介及其生态适应性 | 第17页 |
| 1.2 植物对干旱胁迫的响应机制 | 第17-18页 |
| 1.2.1 水势失衡与渗透调节 | 第17-18页 |
| 1.2.2 缺水胁迫与保护机制 | 第18页 |
| 1.3 植物对盐胁迫的响应机制 | 第18-21页 |
| 1.3.1 渗透失衡与渗透调节 | 第19页 |
| 1.3.2 离子毒害与离子平衡 | 第19-21页 |
| 1.3.3 脱水胁迫与保护机制 | 第21页 |
| 1.4 植物对水淹胁迫的响应机制 | 第21-23页 |
| 1.4.1 低氧胁迫与保护机制 | 第22-23页 |
| 1.5 植物对非生物胁迫的响应机制 | 第23-26页 |
| 1.5.1 氧化胁迫(ROS)与抗氧化防御 | 第23-24页 |
| 1.5.2 植物激素变化与调节 | 第24-26页 |
| 1.6 本课题研究内容与意义 | 第26-28页 |
| 1.6.1 研究内容 | 第26页 |
| 1.6.2 研究意义 | 第26-27页 |
| 1.6.3 技术路线 | 第27-28页 |
| 第2章 海马齿参考转录组De novo组装及其质量分析 | 第28-42页 |
| 2.1 参考转录组De novo组装与数据分析方法 | 第28-32页 |
| 2.1.1 原始数据预处理和参考转录组De novo组装 | 第29-30页 |
| 2.1.2 参考转录组基因表达量的获取及其标准化处理 | 第30-31页 |
| 2.1.3 参考转录组质量检验 | 第31页 |
| 2.1.4 参考转录组Unigenes基因功能注释 | 第31-32页 |
| 2.2 参考转录组De novo组装结果与质量分析 | 第32-41页 |
| 2.2.1 转录组数据描述与De novo组装结果描述 | 第32-36页 |
| 2.2.2 样本主成分分析(PCA) | 第36-38页 |
| 2.2.3 样本数据比对率分析 | 第38页 |
| 2.2.4 参考转录组Unigenes功能预测 | 第38-41页 |
| 2.3 参考转录组De novo组装小结 | 第41-42页 |
| 第3章 海马齿在非生物胁迫下的适应性分析 | 第42-90页 |
| 3.1 差异表达基因功能富集分析方法 | 第42-44页 |
| 3.1.1 差异表达基因提取 | 第42-43页 |
| 3.1.2 GO显著性富集 | 第43页 |
| 3.1.3 KEGG显著性富集 | 第43-44页 |
| 3.2 海马齿对单一胁迫在时间维度上的响应结果与分析 | 第44-66页 |
| 3.2.1 海马齿对干旱胁迫响应的转录组分析 | 第44-51页 |
| 3.2.2 海马齿对盐胁迫响应的转录组分析 | 第51-58页 |
| 3.2.3 海马齿对水淹胁迫响应的转录组分析 | 第58-66页 |
| 3.3 海马齿对多重非生物胁迫响应的分析 | 第66-90页 |
| 3.3.1 在单一胁迫下必然发生差异表达的基因分析 | 第66-70页 |
| 3.3.2 海马齿对干旱胁迫和盐胁迫的共同响应 | 第70-81页 |
| 3.3.3 海马齿对干旱胁迫、盐胁迫和水淹胁迫的共同响应 | 第81-88页 |
| 3.3.4 qRT-PCR验证 | 第88-90页 |
| 第4章 结论 | 第90-100页 |
| 参考文献 | 第100-112页 |
| 附件 | 第112-129页 |
| 致谢 | 第129页 |
