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番茄抗黄化曲叶病毒病基因的分子标记研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
缩写词第8-10页
目录第10-14页
1 文献综述第14-30页
   ·番茄种植的现状第14页
   ·黄化曲叶病毒病的发生、危害以及防治措施第14-16页
     ·番茄黄化曲叶病的发生和危害第14-15页
     ·防治措施第15-16页
       ·农业措施第15页
       ·物理措施第15-16页
       ·化学防治第16页
       ·实行轮作换茬第16页
       ·新品种的培育第16页
   ·番茄黄化曲叶病的研究进展第16-18页
     ·遗传规律的研究第16-17页
     ·番茄抗黄化曲叶病毒病抗性基因的研究第17-18页
       ·TY-1抗性基因第17页
       ·Ty-2、Ty-3和Ty-3a抗性基因第17-18页
     ·TYLCV抗性鉴定第18页
   ·烟粉虱的研究第18-20页
     ·烟粉虱概述第18-19页
     ·生物学与生态学特征第19-20页
   ·双生病毒的研究第20-23页
     ·双生病毒概述第20页
     ·双生病毒的分类和特征第20-21页
     ·双生病毒的复制第21-22页
     ·番茄黄化曲叶病毒与烟粉虱第22-23页
   ·几种病毒检测方法第23-24页
     ·以病毒的外壳蛋白为基础的检测方法第23-24页
       ·酶联免疫吸附测定(ELISA)第23页
       ·斑点免疫吸附法(DIBA)第23页
       ·电印迹免疫分析法(EBLA)第23页
       ·直接组织斑免疫测定法(DDTB)第23-24页
     ·以病毒核酸为检测基础的方法第24页
       ·PCR直接检测技术第24页
       ·免疫PCR技术第24页
     ·黄化曲叶病毒的检测第24页
   ·黄化曲叶病毒病研究中遇到的困难与展望第24-25页
   ·分子标记第25-30页
     ·几种常用的分子标记第25-28页
       ·AFLP分子标记第25-26页
       ·RAPD分子标记第26页
       ·SRAP分子标记第26-27页
       ·SSR分子标记第27页
       ·SCAR分子标记第27页
       ·SNP分子标记第27-28页
     ·分子标记在番茄育种上的应用第28-30页
       ·番茄图谱的构建第28页
       ·番茄种质资源与品种纯度鉴定第28页
       ·分子标记在番茄育种的应用第28-30页
2 番茄抗黄化曲叶病毒病相关基因的AFLP分子标记研究第30-55页
   ·实验材料第30页
   ·苗期鉴定与遗传规律分析第30页
   ·实验用的试剂和仪器第30-31页
     ·实验用的试剂第30-31页
     ·仪器第31页
   ·基因组DNA的制备第31-32页
     ·番茄基因组DNA的提取与纯化第31-32页
     ·基因组DNA的检测第32页
   ·抗病池与感病池的构建第32页
   ·AFLP分子标记的分析第32-43页
     ·AFLP分子标记所用到的接头与引物序列第32-33页
     ·AFLP方法第33-35页
       ·接头的制备第33-34页
       ·酶切与连接第34-35页
       ·AFLP预扩反应第35页
       ·AFLP的选择性扩增第35页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第35-37页
       ·上样缓冲液、Binding Silane试剂与Sigmacoe不粘试剂的配制第35-36页
       ·40%聚丙烯酰胺原液的配制(Acr/Bis=19/1)第36页
       ·6%聚丙烯酰胺凝胶液的配制第36页
       ·制备聚丙烯酰胺凝胶第36页
       ·电泳第36-37页
     ·银染与显色第37-38页
       ·相关试剂的配制第37页
       ·染色第37页
       ·显影第37-38页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳上回收多态性条带第38页
     ·琼脂糖上回收DNA片段第38-39页
     ·目的片段的克隆转化与测序第39-42页
       ·相关试剂的准备第39-40页
       ·感受态细胞的制备第40页
       ·目的片段与T载体的连接第40-41页
       ·质粒的检测第41-42页
       ·多态性片段测序第42页
     ·AFLP标记的SCAR标记转化第42-43页
   ·结果与分析第43-51页
     ·番茄材料黄化曲叶病毒病抗性鉴定及遗传分析第43页
     ·DNA提取与检测第43-44页
     ·酶切连接结果第44页
     ·预扩增与选择扩增第44-45页
     ·AFLP引物的筛选以及差异条带的获得第45-47页
     ·AFLP标记小群体的检测第47-49页
     ·差异条带的回收、克隆和测序第49-50页
     ·AFLP标记转为SCAR标记第50页
     ·SCAR-PCR反应退火温度的筛选第50-51页
     ·用SCAR标记验证单株,遗传距离计算第51页
   ·讨论第51-53页
     ·DNA提取与纯度的问题第51-52页
     ·酶切与连接第52页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第52-53页
       ·制备聚丙烯酰胺凝胶注意的问题第52-53页
       ·染色与显色应注意的问题第53页
     ·AFLP标记转化SCAR标记第53页
   ·结论第53-55页
3 番茄抗黄化曲叶病毒病相关基因的SRAP分子标记研究第55-62页
   ·实验材料第55-56页
   ·SRAP分析方法第56-57页
     ·SRAP-PCR的反应体系以及反应程序第56-57页
     ·差异条带的筛选、回收、连接第57页
   ·SRAP结果分析第57-61页
     ·SRAP标记的筛选第57-59页
     ·回收与克隆第59-60页
     ·测序并设计了SCAR引物第60-61页
   ·讨论与小结第61-62页
4 利用cDNA-AFLP技术分析黄化曲叶病毒诱导的番茄抗黄化曲叶病毒病基因的表达差异第62-79页
   ·材料与方法第62-63页
     ·实验材料第62页
     ·实验准备第62页
     ·实验试剂第62-63页
   ·cDNA-AFLP分析第63-66页
     ·RNA的提取与相关试剂配制第63-65页
       ·相关试剂配制第63页
       ·RNA的提取第63-64页
       ·RNA质量的检测第64-65页
     ·cDNA的合成第65-66页
       ·第一链cDNA的合成第65-66页
       ·第二链cDNA的合成第66页
   ·cDNA-AFLP结果与分析第66-71页
     ·番茄叶片总RNA的提取第67页
     ·反转录成cDNA第67-68页
     ·酶切连接第68页
     ·预扩增结果第68-69页
     ·选择性扩增产物聚丙烯酰胺凝胶电泳结果分析第69-70页
     ·cDNA差异片段分离与分析第70-71页
   ·测序结果与分析第71-76页
     ·E32/M50引物组合第71-72页
       ·测序结果第71-72页
       ·对比结果第72页
     ·E38/M59引物组合第72-73页
       ·3859-1的测序结果第72-73页
       ·3859-2的测序结果第73页
       ·3859-3的测序结果第73页
     ·E36/M59引物组合第73-76页
       ·3659-1的测序与比对结果第73-74页
       ·3659-2的测序与比对结果第74-75页
       ·3659-4的测序与比对结果第75页
       ·3659-5的测序与比对结果第75-76页
     ·根据以上的测序结果设计了引物序列第76页
   ·讨论第76-78页
     ·RNA提取第76-77页
     ·合成cDNA第77页
     ·cDNA-AFLP分析过程中的问题第77页
     ·cDNA-AFLP的缺点第77-78页
   ·小结第78-79页
5 总结第79-81页
参考文献第81-89页
致谢第89-90页
攻读学位期间发表的学术论文第90-91页

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