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玉米胚乳特异表达的Dof类转录因子ZmESDP的功能研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
英文缩略词第11-12页
第一章 文献综述第12-40页
    1.1 玉米胚乳发育与调控第12-24页
        1.1.1 胚乳早期发育第13-14页
        1.1.2 胚乳细胞分化第14-23页
        1.1.3 胚乳成熟过程第23-24页
    1.2 Dof类转录因子的研究进展第24-34页
        1.2.1 Dof转录因子的结构特点及识别序列第24-26页
        1.2.2 Dof转录因子的生物功能第26-34页
    1.3 植物转录因子的研究方法第34-39页
        1.3.1 生物信息学分析第34-35页
        1.3.2 转录因子蛋白定位分析第35页
        1.3.3 转录因子与靶基因启动子区元件结合的分析第35-37页
        1.3.4 转录因子之间的互作分析第37-39页
    1.4 本论文研究的目的与意义第39-40页
第二章 材料与方法第40-74页
    2.1 实验材料第40-48页
        2.1.1 宿主菌第40页
        2.1.2 质粒载体第40页
        2.1.3 植物材料第40页
        2.1.4 各种酶及试剂第40-42页
        2.1.5 主要仪器设备第42-43页
        2.1.6 实验中使用的引物及其序列第43-48页
    2.2 常用培养基及溶液的配制第48-50页
        2.2.1 常用培养基的配制第48-49页
        2.2.2 常用溶液的配制第49-50页
    2.3 实验所需试剂的配制第50-54页
        2.3.1 碱裂解法小提质粒DNA第50页
        2.3.2 大肠杆菌感受态细胞的制备第50页
        2.3.3 冻融转化法农杆菌感受态细胞的制备第50-51页
        2.3.4 SDS法提取植物基因组DNA第51页
        2.3.5 CTAB法提取植物基因组DNA第51页
        2.3.6 基因枪法转化玉米愈伤第51页
        2.3.7 SDS-PAGE第51-52页
        2.3.8 Western blot第52页
        2.3.9 酵母转录激活实验第52页
        2.3.10 His融合蛋白的表达纯化第52页
        2.3.11 GST融合蛋白的表达纯化第52-53页
        2.3.12 MBP融合蛋白的表达纯化第53页
        2.3.13 GST Pull-down实验第53页
        2.3.14 EMSA第53-54页
        2.3.15 玉米原生质体的制备第54页
        2.3.16 石蜡切片实验第54页
        2.3.17 烟草系统检测转录因子对下游基因的调控第54页
    2.4 基本实验方法第54-72页
        2.4.1 大肠杆菌感受态细胞的制备第54-55页
        2.4.2 热激法转化大肠杆菌感受态细胞第55页
        2.4.3 碱裂解法小量提取质粒DNA第55页
        2.4.4 农杆菌感受态细胞的制备第55-56页
        2.4.5 转化农杆菌感受态细胞第56-57页
        2.4.6 SDS法小量提取植物总DNA第57页
        2.4.7 CTAB法小量提取植物基因组DNA第57页
        2.4.8 CTAB法大量提取植物基因组DNA第57-58页
        2.4.9 PCR扩增目的基因第58页
        2.4.10 PCR产物或酶切产物的琼脂糖凝胶回收第58-59页
        2.4.11 植物组织总RNA的提取第59-60页
        2.4.12 RNA反转录、RT-PCR、半定量RT-PCR及qRT-PCR第60-61页
        2.4.13 酵母转录激活实验第61-62页
        2.4.14 冻融法提取酵母质粒第62-63页
        2.4.15 GST标签融合蛋白的表达和纯化第63-64页
        2.4.16 MBP标签融合蛋白的表达和纯化第64-65页
        2.4.17 His标签融合蛋白的纯化第65页
        2.4.18 SDS-PAGE第65页
        2.4.19 Western blot第65-66页
        2.4.20 GST Pull-down实验第66页
        2.4.21 玉米原生质体的制备和转化第66-67页
        2.4.22 EMSA第67-68页
        2.4.23 烟草系统检测转录因子对下游基因的调控第68-69页
        2.4.24 基因枪法转化玉米愈伤第69-71页
        2.4.25 玉米未成熟籽粒胚乳半薄切片的制备第71页
        2.4.26 玉米成熟种子胚乳扫描电镜观察第71页
        2.4.27 玉米未成熟种子胚乳透射电镜观察第71-72页
    2.5 数据库及软件第72-74页
        2.5.1 数据库及网站第72-73页
        2.5.2 常用软件及分析工具第73-74页
第三章 玉米Dof类转录因子的鉴定和分析第74-87页
    3.1 前言第74页
    3.2 玉米Dof转录因子的鉴定和表达分析第74-87页
        3.2.1 玉米Dof转录因子家族的鉴定第74-78页
        3.2.3 ZmDofs基因的表达模式分析第78-80页
        3.2.4 ZmDof3 ZmDof28和ZmDof16基因编码序列的克隆第80-81页
        3.2.5 ZmDof3、ZmDof28和ZmDof16转录因子特性分析第81-87页
第四章 玉米胚乳特异表达基因ZmESDP对种子发育的调控作用第87-111页
    4.1 前言第87页
    4.2 ZmESDP在玉米籽粒发育过程中的表达情况第87-88页
    4.3 转ZmESDP-OE超表达载体和ZmESDP-RNAi干扰载体玉米的获得第88-93页
        4.3.1 ZmESDP-OE超表达载体和ZmESDP-RNAi干扰载体的构建第88-90页
        4.3.2 玉米愈伤的遗传转化第90-91页
        4.3.3 T_0代再生植株的PCR检测第91-93页
    4.4 ZmESDP-OE和ZmESDP-RNAi转基因玉米的表型观察第93-108页
        4.4.1 ZmESDP-OE和ZmESDP-RNAi转基因玉米的表型观察第93-94页
        4.4.2 ZmESDP表达量降低导致玉米胚乳部分位置的糊粉层细胞发育异常第94-98页
        4.4.3 ZmESDP表达量降低导致玉米籽粒胚乳发育异常第98-100页
        4.4.4 ZmESDP在种子发育过程中能够影响碳水化合物的合成第100-108页
    4.5 ZmESDP在体外和体内能够与O2和PBF发生相互作用第108-111页
第五章 讨论第111-115页
    5.1 在玉米中新鉴定了一个胚乳特异表达的Dof转录因子ZmESDP第111页
    5.2 抑制ZmESDP基因的表达导致严重异常的籽粒表型第111-112页
    5.3 ZmESDP通过调节nkd基因的表达影响糊粉层部分位置细胞的发育第112-113页
    5.4 ZmESDP和PBF/O2在调节胚乳发育过程中的关系第113页
    5.5 ZmESDP-RNAi转基因的剂量效应第113-115页
第六章 结论第115-116页
参考文献第116-127页
附录Ⅰ 响应干旱胁迫的谷子转录组研究第127-160页
    1.1 研究背景第127-135页
        1.1.1 谷子的特点和研究进展第127-129页
        1.1.2 非编码RNA的研究进展第129-135页
    1.2 响应干旱胁迫的谷子转录组研究结果第135-154页
        1.2.1 谷子干旱处理条件的选择和测序样品的准备第135-136页
        1.2.2 转录组测序、比对和拼接第136-138页
        1.2.3 干旱胁迫条件下谷子转录组的变化第138-139页
        1.2.4 差异表达基因的功能注释第139-142页
        1.2.5 谷子lncRNA的鉴定及功能分析第142-151页
        1.2.6 24-nt siRNAs在调节干旱响应基因表达方面的作用第151-154页
    1.3 小结第154-155页
    1.4 参考文献第155-160页
附录Ⅱ第160-161页
附录Ⅲ第161-162页
致谢第162-163页
个人简历第163页

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