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石斛DNA条形码鉴定及系统分类研究

摘要第3-7页
Abstract第7-11页
引言第14-16页
第一章 文献研究第16-27页
    1.1 石斛属物种鉴定研究概述第16-21页
        1.1.1 石斛属植物资源研究现状第16-17页
        1.1.2 石斛属种质资源鉴定技术第17-21页
    1.2 DNA条形码技术在石斛属物种鉴定中的研究进展概述第21-26页
        1.2.1 DNA条形码序列在石斛属物种鉴定中的研究进展概述第22-24页
        1.2.2 DNA测序技术第24-26页
    1.3 结语第26-27页
第二章 石斛属叶绿体基因组研究第27-51页
    2.1 石斛属叶绿体基因组的提取和测序第27-30页
        2.1.1 实验材料第27-28页
        2.1.2 实验方法第28-30页
    2.2 石斛属叶绿体基因组DNA的提取和测序结果第30-34页
        2.2.1 样本信息及DNA检测结果第30-33页
        2.2.2 原始测序数据质量剪切及统计结果第33-34页
    2.3 石斛属叶绿体基因组测序生物信息学分析第34-42页
        2.3.1 中科4号铁皮石斛叶绿体基因组组装和注释方法第34页
        2.3.2 中科4号铁皮石斛叶绿体基因组组装和注释结果第34-39页
        2.3.3 基因功能注释分析第39-42页
    2.4 构建石斛属叶绿体基因组DNA条形码鉴定体系第42-49页
        2.4.1 石斛属叶绿体基因组测序数据处理及比对第42-43页
        2.4.2 石斛属叶绿体基因组SNP和InDel分析第43-45页
        2.4.3 群体遗传学分析第45-49页
    2.5 结论与讨论第49-51页
第三章 石斛属DNA条形码筛选及验证第51-68页
    3.1 石斛属候选DNA条形码筛选第51-55页
        3.1.1 基于石斛属叶绿体基因组中SNP富集基因组合分析效果筛选第51-55页
        3.1.2 基于石斛属叶绿体基因组序列信息筛选第55页
    3.2 石斛属候选DNA条形码的验证第55-66页
        3.2.1 材料与方法第55-57页
        3.2.2 DNA条形码验证实验结果第57-66页
    3.3 结论与讨论第66-68页
第四章 结语与展望第68-69页
参考文献第69-79页
附录第79-108页
在校期间发表论文情况第108-109页
致谢第109-110页
附件第110页

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