| 摘要 | 第3-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 引言 | 第14-16页 |
| 第一章 文献研究 | 第16-27页 |
| 1.1 石斛属物种鉴定研究概述 | 第16-21页 |
| 1.1.1 石斛属植物资源研究现状 | 第16-17页 |
| 1.1.2 石斛属种质资源鉴定技术 | 第17-21页 |
| 1.2 DNA条形码技术在石斛属物种鉴定中的研究进展概述 | 第21-26页 |
| 1.2.1 DNA条形码序列在石斛属物种鉴定中的研究进展概述 | 第22-24页 |
| 1.2.2 DNA测序技术 | 第24-26页 |
| 1.3 结语 | 第26-27页 |
| 第二章 石斛属叶绿体基因组研究 | 第27-51页 |
| 2.1 石斛属叶绿体基因组的提取和测序 | 第27-30页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第27-28页 |
| 2.1.2 实验方法 | 第28-30页 |
| 2.2 石斛属叶绿体基因组DNA的提取和测序结果 | 第30-34页 |
| 2.2.1 样本信息及DNA检测结果 | 第30-33页 |
| 2.2.2 原始测序数据质量剪切及统计结果 | 第33-34页 |
| 2.3 石斛属叶绿体基因组测序生物信息学分析 | 第34-42页 |
| 2.3.1 中科4号铁皮石斛叶绿体基因组组装和注释方法 | 第34页 |
| 2.3.2 中科4号铁皮石斛叶绿体基因组组装和注释结果 | 第34-39页 |
| 2.3.3 基因功能注释分析 | 第39-42页 |
| 2.4 构建石斛属叶绿体基因组DNA条形码鉴定体系 | 第42-49页 |
| 2.4.1 石斛属叶绿体基因组测序数据处理及比对 | 第42-43页 |
| 2.4.2 石斛属叶绿体基因组SNP和InDel分析 | 第43-45页 |
| 2.4.3 群体遗传学分析 | 第45-49页 |
| 2.5 结论与讨论 | 第49-51页 |
| 第三章 石斛属DNA条形码筛选及验证 | 第51-68页 |
| 3.1 石斛属候选DNA条形码筛选 | 第51-55页 |
| 3.1.1 基于石斛属叶绿体基因组中SNP富集基因组合分析效果筛选 | 第51-55页 |
| 3.1.2 基于石斛属叶绿体基因组序列信息筛选 | 第55页 |
| 3.2 石斛属候选DNA条形码的验证 | 第55-66页 |
| 3.2.1 材料与方法 | 第55-57页 |
| 3.2.2 DNA条形码验证实验结果 | 第57-66页 |
| 3.3 结论与讨论 | 第66-68页 |
| 第四章 结语与展望 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-79页 |
| 附录 | 第79-108页 |
| 在校期间发表论文情况 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109-110页 |
| 附件 | 第110页 |
