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芸薹属人工合成异源六倍体的稳定性分析、遗传图谱构建及QTL定位

致谢第7-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-11页
缩略词表第12-16页
第一章 文献综述第16-42页
    1.1 引言第16页
    1.2 芸薹属植物远缘杂交的研究进展第16-20页
        1.2.1 芸薹属A、B、C基因组间的关系第16-18页
        1.2.2 芸薹属植物远缘杂交的研究进展第18-19页
        1.2.3 芸薹属植物远缘杂交在生产上的应用第19-20页
    1.3 多倍体育种的研究进展第20-24页
        1.3.1 多倍体的获取方法第21-22页
        1.3.2 植株倍性的鉴定第22-23页
        1.3.3 多倍体的应用第23-24页
    1.4 DNA分子标记第24-33页
        1.4.1 DNA分子标记的类型第24-28页
        1.4.2 简化基因组测序技术第28-31页
            1.4.2.1 高通量测序技术第28-29页
            1.4.2.2 简化基因组测序技术第29页
            1.4.2.3 RAD-seq技术第29-31页
        1.4.3 分子标记的应用第31-33页
    1.5 遗传连锁图谱的构建第33-37页
        1.5.1 作图亲本的选择第33-34页
        1.5.2 作图分离群体的构建第34-35页
        1.5.3 遗传连锁图的构建原理和方法第35-37页
            1.5.3.1 遗传连锁图的构建原理第35页
            1.5.3.2 遗传连锁图的构建方法第35-36页
            1.5.3.3 作图软件第36-37页
    1.6 数量性状遗传解析第37-41页
        1.6.1 数量性状的特点及研究方法第37页
        1.6.2 QTL定位的原理第37页
        1.6.3 QTL定位的方法第37-39页
        1.6.4 QTL定位的软件第39-40页
        1.6.5 芸薹属QTL定位的研究进展第40-41页
    1.7 本研究的目的和意义第41-42页
第二章 芸薹属异源六倍体DH系稳定性分析及农艺性状鉴定第42-50页
    2.1 引言第42页
    2.2 材料和方法第42-44页
        2.2.1 试验材料第42-43页
        2.2.2 试验方法第43-44页
    2.3 结果分析第44-48页
        2.3.1 DH系的植株倍性第44-45页
        2.3.2 DH系的染色体数目第45-46页
        2.3.3 DH系的花粉活性第46页
        2.3.4 DH系的表型性状第46-48页
    2.4 讨论第48-50页
第三章 基于SSR分子标记的芸薹属异源六倍体的遗传连锁框架图的构建第50-70页
    3.1 引言第50页
    3.2 材料和方法第50-54页
        3.2.1 试验材料第50-51页
        3.2.2 亲本和DH群体基因组DNA的提取及检测第51-52页
        3.2.3 SSR分子标记来源第52-53页
        3.2.4 PCR扩增反应及PAGE凝胶电泳分析第53-54页
    3.3 结果分析第54-67页
        3.3.1 基因组DNA的提取第54页
        3.3.2 引物在亲本中的多态性及DH群体中的分离第54-57页
        3.3.3 芸薹属异源六倍体遗传图谱构建第57-64页
        3.3.4 连锁群上SSR标记与之前的遗传图的比对第64页
        3.3.5 DH群体中连锁群的缺失频率分析第64-67页
    3.4 讨论与小结第67-70页
        3.4.1 讨论第67-69页
        3.4.2 小结第69-70页
第四章 基于RAD-seq的芸薹属异源六倍体的商密度遗传连锁图谱的构建第70-84页
    4.1 引言第70页
    4.2 材料和方法第70-73页
        4.2.1 试验材料第70页
        4.2.2 试验方法第70-73页
            4.2.2.1 文库构建和RAD-seq第71-72页
            4.2.2.2 RAD-seq数据分析、SNP识别及基因分型第72-73页
            4.2.2.3 高密度遗传图谱的构建第73页
    4.3 结果分析第73-81页
        4.3.1 测序数据和基因分型第73-75页
        4.3.2 高密度遗传连锁图谱的构建第75-81页
    4.4 讨论第81-84页
        4.4.1 偏分离情况第81页
        4.4.2 连锁图谱的构建和分析第81-82页
        4.4.3 同源和异源重组分析第82-83页
        4.4.4 小结第83-84页
第五章 芸薹属人工合成异源六倍体的QTL定位第84-92页
    5.1 引言第84页
    5.2 材料和方法第84-85页
        5.2.1 试验材料第84页
        5.2.2 试验方法第84-85页
            5.2.2.1 QTL检测第84-85页
            5.2.2.2 候选基因预测第85页
    5.3 结果分析第85-90页
        5.3.1 加性QTL的定位第85-89页
        5.3.2 上位性QTL的定位第89-90页
        5.3.3 候选基因挖掘第90页
    5.4 讨论第90-92页
        5.4.1 加性QTL的分析第90-91页
        5.4.2 上位性QTL的分析第91页
        5.4.3 小结第91-92页
第六章 结论与展望第92-94页
    6.1 研究结果与创新点第92-93页
    6.2 研究展望第93-94页
参考文献第94-105页
附录第105-129页
博士期间主要成果第129页

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