致谢 | 第7-8页 |
摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-11页 |
缩略词表 | 第12-16页 |
第一章 文献综述 | 第16-42页 |
1.1 引言 | 第16页 |
1.2 芸薹属植物远缘杂交的研究进展 | 第16-20页 |
1.2.1 芸薹属A、B、C基因组间的关系 | 第16-18页 |
1.2.2 芸薹属植物远缘杂交的研究进展 | 第18-19页 |
1.2.3 芸薹属植物远缘杂交在生产上的应用 | 第19-20页 |
1.3 多倍体育种的研究进展 | 第20-24页 |
1.3.1 多倍体的获取方法 | 第21-22页 |
1.3.2 植株倍性的鉴定 | 第22-23页 |
1.3.3 多倍体的应用 | 第23-24页 |
1.4 DNA分子标记 | 第24-33页 |
1.4.1 DNA分子标记的类型 | 第24-28页 |
1.4.2 简化基因组测序技术 | 第28-31页 |
1.4.2.1 高通量测序技术 | 第28-29页 |
1.4.2.2 简化基因组测序技术 | 第29页 |
1.4.2.3 RAD-seq技术 | 第29-31页 |
1.4.3 分子标记的应用 | 第31-33页 |
1.5 遗传连锁图谱的构建 | 第33-37页 |
1.5.1 作图亲本的选择 | 第33-34页 |
1.5.2 作图分离群体的构建 | 第34-35页 |
1.5.3 遗传连锁图的构建原理和方法 | 第35-37页 |
1.5.3.1 遗传连锁图的构建原理 | 第35页 |
1.5.3.2 遗传连锁图的构建方法 | 第35-36页 |
1.5.3.3 作图软件 | 第36-37页 |
1.6 数量性状遗传解析 | 第37-41页 |
1.6.1 数量性状的特点及研究方法 | 第37页 |
1.6.2 QTL定位的原理 | 第37页 |
1.6.3 QTL定位的方法 | 第37-39页 |
1.6.4 QTL定位的软件 | 第39-40页 |
1.6.5 芸薹属QTL定位的研究进展 | 第40-41页 |
1.7 本研究的目的和意义 | 第41-42页 |
第二章 芸薹属异源六倍体DH系稳定性分析及农艺性状鉴定 | 第42-50页 |
2.1 引言 | 第42页 |
2.2 材料和方法 | 第42-44页 |
2.2.1 试验材料 | 第42-43页 |
2.2.2 试验方法 | 第43-44页 |
2.3 结果分析 | 第44-48页 |
2.3.1 DH系的植株倍性 | 第44-45页 |
2.3.2 DH系的染色体数目 | 第45-46页 |
2.3.3 DH系的花粉活性 | 第46页 |
2.3.4 DH系的表型性状 | 第46-48页 |
2.4 讨论 | 第48-50页 |
第三章 基于SSR分子标记的芸薹属异源六倍体的遗传连锁框架图的构建 | 第50-70页 |
3.1 引言 | 第50页 |
3.2 材料和方法 | 第50-54页 |
3.2.1 试验材料 | 第50-51页 |
3.2.2 亲本和DH群体基因组DNA的提取及检测 | 第51-52页 |
3.2.3 SSR分子标记来源 | 第52-53页 |
3.2.4 PCR扩增反应及PAGE凝胶电泳分析 | 第53-54页 |
3.3 结果分析 | 第54-67页 |
3.3.1 基因组DNA的提取 | 第54页 |
3.3.2 引物在亲本中的多态性及DH群体中的分离 | 第54-57页 |
3.3.3 芸薹属异源六倍体遗传图谱构建 | 第57-64页 |
3.3.4 连锁群上SSR标记与之前的遗传图的比对 | 第64页 |
3.3.5 DH群体中连锁群的缺失频率分析 | 第64-67页 |
3.4 讨论与小结 | 第67-70页 |
3.4.1 讨论 | 第67-69页 |
3.4.2 小结 | 第69-70页 |
第四章 基于RAD-seq的芸薹属异源六倍体的商密度遗传连锁图谱的构建 | 第70-84页 |
4.1 引言 | 第70页 |
4.2 材料和方法 | 第70-73页 |
4.2.1 试验材料 | 第70页 |
4.2.2 试验方法 | 第70-73页 |
4.2.2.1 文库构建和RAD-seq | 第71-72页 |
4.2.2.2 RAD-seq数据分析、SNP识别及基因分型 | 第72-73页 |
4.2.2.3 高密度遗传图谱的构建 | 第73页 |
4.3 结果分析 | 第73-81页 |
4.3.1 测序数据和基因分型 | 第73-75页 |
4.3.2 高密度遗传连锁图谱的构建 | 第75-81页 |
4.4 讨论 | 第81-84页 |
4.4.1 偏分离情况 | 第81页 |
4.4.2 连锁图谱的构建和分析 | 第81-82页 |
4.4.3 同源和异源重组分析 | 第82-83页 |
4.4.4 小结 | 第83-84页 |
第五章 芸薹属人工合成异源六倍体的QTL定位 | 第84-92页 |
5.1 引言 | 第84页 |
5.2 材料和方法 | 第84-85页 |
5.2.1 试验材料 | 第84页 |
5.2.2 试验方法 | 第84-85页 |
5.2.2.1 QTL检测 | 第84-85页 |
5.2.2.2 候选基因预测 | 第85页 |
5.3 结果分析 | 第85-90页 |
5.3.1 加性QTL的定位 | 第85-89页 |
5.3.2 上位性QTL的定位 | 第89-90页 |
5.3.3 候选基因挖掘 | 第90页 |
5.4 讨论 | 第90-92页 |
5.4.1 加性QTL的分析 | 第90-91页 |
5.4.2 上位性QTL的分析 | 第91页 |
5.4.3 小结 | 第91-92页 |
第六章 结论与展望 | 第92-94页 |
6.1 研究结果与创新点 | 第92-93页 |
6.2 研究展望 | 第93-94页 |
参考文献 | 第94-105页 |
附录 | 第105-129页 |
博士期间主要成果 | 第129页 |