摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-8页 |
第1章 绪论 | 第11-18页 |
1.1 研究背景和意义 | 第11-14页 |
1.2 差异表达基因在肾细胞癌研究中的应用 | 第14-15页 |
1.3 本文的主要工作 | 第15-16页 |
1.4 本文的组织结构 | 第16-18页 |
第2章 显著性分析算法 | 第18-21页 |
2.1 显著性分析概论 | 第18-19页 |
2.2 SAM算法 | 第19-21页 |
2.2.1 SAM算法引言 | 第19页 |
2.2.2 SAM算法计算原理 | 第19-20页 |
2.2.3 SAM算法的优点 | 第20-21页 |
第3章 基于Spark肾细胞癌差异表达基因筛选算法SAM并行化实现及分析 | 第21-44页 |
3.1 实验数据的获取及预处理 | 第21-24页 |
3.2 基于Spark平台SAM算法的并行化实现 | 第24-34页 |
3.2.1 Spark概述 | 第25-29页 |
3.2.2 SAM算法并行化的可行性分析 | 第29-30页 |
3.2.3 集群搭建 | 第30-32页 |
3.2.4 Spark并行化实验 | 第32-34页 |
3.3 并行化SAM算法与串行化实验的对比分析 | 第34-38页 |
3.3.1 R语言概述 | 第34-35页 |
3.3.2 基于R的SAM算法串行实验 | 第35-38页 |
3.4 实验结果对比分析 | 第38-44页 |
第4章 SAM算法并行化系统实现 | 第44-50页 |
4.1 系统需求分析 | 第44页 |
4.2 系统设计 | 第44-45页 |
4.2.1 开发工具及系统模块介绍 | 第44-45页 |
4.2.2 系统完成的功能 | 第45页 |
4.3 系统的实现 | 第45-49页 |
4.3.1 系统登录界面 | 第45页 |
4.3.2 系统主页面 | 第45-46页 |
4.3.3 SAM算法介绍页面 | 第46页 |
4.3.4 SAM算法原数据介绍页面 | 第46-47页 |
4.3.5 SAM算法计算页面 | 第47-48页 |
4.3.6 SAM运行结果分析页面 | 第48-49页 |
4.4 本章小结 | 第49-50页 |
第5章 总结与展望 | 第50-52页 |
5.1 总结 | 第50-51页 |
5.2 展望 | 第51-52页 |
参考文献 | 第52-56页 |
作者简介 | 第56-57页 |
致谢 | 第57页 |