分子模拟研究电场对人Ⅰ型电压依赖阴离子选择性通道的影响
| 内容提要 | 第1-8页 |
| 第一章 前言 | 第8-16页 |
| ·概述 | 第8-10页 |
| ·研究对象 | 第10-15页 |
| ·研究意义 | 第15-16页 |
| 第二章 理论基础 | 第16-38页 |
| ·Born-Oppenheimer 近似 | 第16-17页 |
| ·力场 | 第17-20页 |
| ·力场的能量表示 | 第17-18页 |
| ·力场的组成和定义 | 第18-19页 |
| ·常用力场 | 第19-20页 |
| ·分子力学 | 第20-23页 |
| ·优化的概念 | 第20-21页 |
| ·优化算法 | 第21-22页 |
| ·优化中的注意事项 | 第22-23页 |
| ·分子动力学 | 第23-35页 |
| ·积分算法 | 第24-26页 |
| ·长程相互作用 | 第26-28页 |
| ·边界条件 | 第28-29页 |
| ·恒温恒压分子动力学模拟的实现 | 第29-30页 |
| ·提高效率的方法 | 第30-31页 |
| ·各系综的分子动力学模拟 | 第31-35页 |
| ·平均力势 | 第35-36页 |
| ·主成分分析 | 第36-38页 |
| 第三章 计算方法 | 第38-40页 |
| ·体系的构建 | 第38页 |
| ·分子动力学模拟和数据收集 | 第38-40页 |
| 第四章 结果与讨论 | 第40-53页 |
| ·分子动力学模拟 | 第40-43页 |
| ·N 端肽段骨架的变化 | 第43-44页 |
| ·hVDAC1 分子通道孔径的改变 | 第44-46页 |
| ·离子分布 | 第46-48页 |
| ·平均力势 | 第48-49页 |
| ·主成份分析 | 第49-51页 |
| ·小结 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-62页 |
| 作者简介及攻读学位期间的主要成果 | 第62-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 摘要 | 第64-65页 |
| ABSTRACT | 第65-66页 |
