| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一部分 前言 | 第11-21页 |
| 1.1 线粒体基因组用于进化生物学研究的优势 | 第11页 |
| 1.2 后生动物线粒体进化基因组研究简介 | 第11-13页 |
| 1.2.1 后生动物线粒体基因组的进化特点及测序进展 | 第11-13页 |
| 1.2.2 线粒体基因组生物信息学分析体系 | 第13页 |
| 1.3 自然选择检测原理方法与工具 | 第13-15页 |
| 1.4 直翅目昆虫系统发育研究现状及研究物种介绍 | 第15-19页 |
| 1.4.1 蝗虫系统分类研究进展的介绍 | 第15-16页 |
| 1.4.2 中华板胸蝗介绍 | 第16-17页 |
| 1.4.3 大胫刺蝗介绍 | 第17-18页 |
| 1.4.4 青海痂蝗介绍 | 第18页 |
| 1.4.5 日本鸣蝗介绍 | 第18-19页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第19-21页 |
| 第二部分 实验材料和方法 | 第21-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 标本采集、鉴定及保存 | 第21页 |
| 2.1.2 实验试剂与仪器 | 第21-22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-27页 |
| 2.3 线粒体DNA数据编辑与分析方法 | 第27-28页 |
| 2.4 直翅目昆虫系统发生分析方法 | 第28-33页 |
| 2.5 直翅目昆虫进化基因组学分析 | 第33-35页 |
| 第三部分 实验结果 | 第35-37页 |
| 3.1 总DAN提取结果 | 第35页 |
| 3.2 Long-PCR扩增结果 | 第35页 |
| 3.3 Sub-PCR扩增结果 | 第35-37页 |
| 第四部分 4个物种线粒体基因组分析结果 | 第37-65页 |
| 4.1 中华板胸蝗线粒体基因组分析结果 | 第37-44页 |
| 4.1.1 线粒体基因组结构组成 | 第37-39页 |
| 4.1.2 线粒体基因组核苷酸组成特点 | 第39页 |
| 4.1.3 蛋白编码基因的密码子使用情况与氨基酸组成分析 | 第39-41页 |
| 4.1.4 tRNA二级结构预测 | 第41-42页 |
| 4.1.5 rRNA二级结构预测 | 第42-43页 |
| 4.1.6 A+T丰富区 | 第43-44页 |
| 4.2 日本鸣蝗线粒体基因组分析结果 | 第44-51页 |
| 4.2.1 线粒体基因组结构组成 | 第44-46页 |
| 4.2.2 线粒体基因组核苷酸组成特点 | 第46页 |
| 4.2.3 蛋白编码基因的密码子使用情况与氨基酸组成分析 | 第46-48页 |
| 4.2.4 tRNA二级结构预测 | 第48-49页 |
| 4.2.5 rRNA二级结构预测 | 第49-50页 |
| 4.2.6 A+T丰富区 | 第50-51页 |
| 4.3 大胫刺蝗线粒体基因组分析结果 | 第51-58页 |
| 4.3.1 线粒体基因组结构组成 | 第51-53页 |
| 4.3.2 线粒体基因组核苷酸组成特点 | 第53页 |
| 4.3.3 蛋白编码基因的密码子使用情况与氨基酸组成分析 | 第53-55页 |
| 4.3.4 tRNA二级结构预测 | 第55-56页 |
| 4.3.5 rRNA二级结构预测 | 第56-57页 |
| 4.3.6 A+T丰富区 | 第57-58页 |
| 4.4 青海痂蝗线粒体基因组分析结果 | 第58-65页 |
| 4.4.1 线粒体基因组结构组成 | 第58-60页 |
| 4.4.2 线粒体基因组核苷酸组成特点 | 第60页 |
| 4.4.3 蛋白编码基因的密码子使用情况与氨基酸组成分析 | 第60-62页 |
| 4.4.4 tRNA二级结构预测 | 第62-63页 |
| 4.4.5 rRNA二级结构预测 | 第63-64页 |
| 4.4.6 A+T丰富区 | 第64-65页 |
| 第五部分 直翅目昆虫系统发育关系结果及讨论 | 第65-91页 |
| 5.1 数据集组成特征 | 第65-66页 |
| 5.2 碱基替换饱和性分析以及gl和PTP检验 | 第66-70页 |
| 5.2.1 碱基替换饱和性分析 | 第66-68页 |
| 5.2.2 树长分布偏斜型检验(TLD)和PTP检验 | 第68-70页 |
| 5.3 构建系统发育树及结果分析 | 第70-88页 |
| 5.3.1 最大似然法建树结果 | 第70-71页 |
| 5.3.2 贝叶斯法建树结果 | 第71-88页 |
| 5.4 系统发育关系分析讨论 | 第88-91页 |
| 第六部分 直翅目线粒体进化基因组学分析结果及讨论 | 第91-95页 |
| 6.1 直翅目昆虫线粒体蛋白编码基因的选择压力检验结果 | 第91-94页 |
| 6.2 讨论 | 第94-95页 |
| 第七部分 结论 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-107页 |
| 致谢 | 第107-109页 |
| 读硕士期间的研究成果 | 第109页 |
