| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 1 前言 | 第13-23页 |
| 1.1 珠江口环境概述 | 第13-14页 |
| 1.2 厌氧氨氧化细菌研究进展 | 第14-19页 |
| 1.2.1 厌氧氨氧化细菌概述 | 第14-15页 |
| 1.2.2 厌氧氨氧化过程对海洋氮损失的贡献 | 第15页 |
| 1.2.3 厌氧氨氧化细菌的分布及多样性 | 第15-16页 |
| 1.2.4 环境因子对厌氧氨氧化细菌群落结构及分布的影响 | 第16-19页 |
| 1.3 厌氧氨氧化细菌分子生物学研究方法 | 第19-22页 |
| 1.3.1 基因克隆文库法 | 第20-22页 |
| 1.3.2 变性梯度凝胶电泳 | 第22页 |
| 1.4 珠江口厌氧氨氧化细菌研究现状 | 第22页 |
| 1.5 本论文研究的目的及意义 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第23-26页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第23-24页 |
| 2.1.2 实验主要分子生物学试剂盒 | 第24页 |
| 2.1.3 实验主要培养基 | 第24-25页 |
| 2.1.4 实验主要引物 | 第25页 |
| 2.1.5 实验主要仪器 | 第25-26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-35页 |
| 2.2.1 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 和 hzo 基因克隆文库的构建 | 第26-29页 |
| 2.2.1.1 沉积物样品总环境 DNA 的提取 | 第26-27页 |
| 2.2.1.2 沉积物、水体样品环境参数的获得 | 第27页 |
| 2.2.1.3 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 和 hzo 基因序列的扩增 | 第27-28页 |
| 2.2.1.4 PCR 产物的纯化 | 第28-29页 |
| 2.2.1.5 纯化的 PCR 产物的连接 | 第29页 |
| 2.2.1.6 感受态细胞的制备 | 第29页 |
| 2.2.1.7 重组载体的转化 | 第29页 |
| 2.2.2 荧光定量检测沉积物、水体中总细菌及厌氧氨氧化细菌丰度 | 第29-32页 |
| 2.2.2.1 表层、底层水体样品环境总 DNA 的提取 | 第29-30页 |
| 2.2.2.2 总细菌及厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因标准质粒的构建 | 第30-31页 |
| 2.2.2.3 总细菌及厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因标准曲线的构建 | 第31-32页 |
| 2.2.2.4 沉积物、表底层水体样品定量分析 | 第32页 |
| 2.2.3 沉积物厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 与 hzo 基因序列分析 | 第32-35页 |
| 2.2.3.1 测序结果分析 | 第32-33页 |
| 2.2.3.2 可操作分类单元和多样性指数的计算 | 第33页 |
| 2.2.3.3 统计学分析 | 第33-34页 |
| 2.2.3.4 系统发育树的建立 | 第34页 |
| 2.2.3.5 聚类分析 | 第34-35页 |
| 2.2.3.7 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 及 hzo 基因序列的提交 | 第35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-59页 |
| 3.1 沉积物、水体样品环境因子分析 | 第35-38页 |
| 3.2 厌氧氨氧化细菌菌 16S rRNA 基因克隆文库分析 | 第38-46页 |
| 3.2.1 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因 PCR 产物电泳结果 | 第38-39页 |
| 3.2.2 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因文库多样性指数分析 | 第39-40页 |
| 3.2.3 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因覆盖率与稀释曲线 | 第40页 |
| 3.2.4 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因系统进化分析 | 第40-43页 |
| 3.2.5 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因聚类分析 | 第43-44页 |
| 3.2.6 厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因群落结构与环境因子的相关性分析 | 第44-46页 |
| 3.3 厌氧氨氧化细菌 hzo 基因克隆文库分析 | 第46-53页 |
| 3.3.1 厌氧氨氧化细菌 hzo 基因扩增产物电泳结果 | 第46页 |
| 3.3.2 厌氧氨氧化细菌 hzo 基因文库多样性指数分析 | 第46-47页 |
| 3.3.3 厌氧氨氧化细菌 HZO 氨基酸序列稀释曲线 | 第47-48页 |
| 3.3.4 厌氧氨氧化细菌 HZO 氨基酸序列系统进化分析 | 第48-50页 |
| 3.3.5 厌氧氨氧化细菌 HZO 氨基酸序列聚类分析 | 第50-51页 |
| 3.3.6 厌氧氨氧化细菌 HZO 氨基酸序列群落结构与环境因子的相关性分析 | 第51-53页 |
| 3.4 厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 及 hzo 基因序列号 | 第53页 |
| 3.5 表层沉积物、表层水、底层水总细菌及厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因定量分析 | 第53-59页 |
| 3.5.1 总细菌及厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因 Q-PCR 标准曲线结果 | 第53-54页 |
| 3.5.2 总细菌及厌氧氨氧化细菌 16S rRNA 基因拷贝数结果 | 第54-57页 |
| 3.5.3 总细菌及厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因丰度与环境因子间相关性分析 | 第57-59页 |
| 4 讨论 | 第59-65页 |
| 4.1 厌氧氨氧化细菌多样性及分布 | 第59-61页 |
| 4.2 厌氧氨氧化细菌丰度 | 第61-63页 |
| 4.3 环境因子对厌氧氨氧化细菌的影响 | 第63-65页 |
| 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 个人简历 | 第71页 |
| 参与发表的学术论文 | 第71-72页 |
