摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-20页 |
1.1 舌头多元化的生理功能及特化功能 | 第10-12页 |
1.1.1 舌头多元化的生理功能 | 第10-11页 |
1.1.2 舌头的特化功能 | 第11-12页 |
1.2 蝙蝠的物种分类及食性分化 | 第12-17页 |
1.2.1 蝙蝠的物种分类 | 第12-14页 |
1.2.2 蝙蝠的食性分化 | 第14-15页 |
1.2.3 蝙蝠食性的适应性进化 | 第15页 |
1.2.4 以蝙蝠作为研究对象的优势 | 第15-16页 |
1.2.5 三种蝙蝠的习性和生物学特征 | 第16-17页 |
1.3 本论文的研究概述 | 第17-20页 |
1.3.1 本论文的研究目的 | 第17-18页 |
1.3.2 本论文的研究方法 | 第18-19页 |
1.3.3 本论文的结构和研究意义 | 第19-20页 |
第二章 转录组分析技术 | 第20-29页 |
2.1 新一代高通量测序技术的简介 | 第20-21页 |
2.2 Illumina测序技术的基本原理 | 第21-23页 |
2.2.1 基因组DNA或cDNA测序的经典流程 | 第21页 |
2.2.2 桥式PCR扩增 | 第21-22页 |
2.2.3 四色循环可逆终止法测序 | 第22-23页 |
2.3 转录组深度测序 | 第23-27页 |
2.3.1 转录组深度测序的简介 | 第23-24页 |
2.3.2 转录组深度测序的应用 | 第24-27页 |
2.4 提取总RNA的方法 | 第27-29页 |
2.4.1 异硫氰酸胍/氯化铯超速离心法提取总RNA | 第27页 |
2.4.2 盐酸胍-有机溶剂法 | 第27页 |
2.4.3 氯化锂-尿素法 | 第27-28页 |
2.4.4 细胞质RNA提取法 | 第28页 |
2.4.5 一步快速热酚提取法 | 第28页 |
2.4.6 Triozl法提取总RNA | 第28-29页 |
第三章 材料与方法 | 第29-36页 |
3.1 实验材料 | 第29页 |
3.2 舌头组织总RNA的提取与质量检测 | 第29-31页 |
3.2.1 舌头组织总RNA的提取 | 第29-30页 |
3.2.2 RNA的质量检测 | 第30-31页 |
3.3 舌头组织cDNA文库的构建和测序 | 第31-32页 |
3.4 原始测序数据处理 | 第32-34页 |
3.4.1 原始测序数据的质量检测 | 第32-33页 |
3.4.2 数据过滤 | 第33-34页 |
3.4.3 转录组的从头拼接 | 第34页 |
3.5 舌头转录组的比较分析 | 第34-36页 |
3.5.1 直系同源基因的筛选 | 第34页 |
3.5.2 三种蝙蝠舌头普遍高表达基因的鉴定 | 第34-35页 |
3.5.3 三种蝙蝠舌头差异表达基因的鉴定 | 第35页 |
3.5.4 三种蝙蝠舌头差异表达基因的功能富集 | 第35-36页 |
第四章 结果 | 第36-44页 |
4.1 三种蝙蝠舌头组织总RNA的提取 | 第36页 |
4.2 三种蝙蝠舌头组织cDNA文库的构建和测序 | 第36页 |
4.3 原始测序数据的处理 | 第36-39页 |
4.3.1 原始测序数据的质量检测 | 第36-38页 |
4.3.2 数据过滤 | 第38页 |
4.3.3 转录组的从头拼接 | 第38-39页 |
4.4 三种蝙蝠舌头转录组的比较分析 | 第39-44页 |
4.4.1 直系同源基因的筛选 | 第39页 |
4.4.2 三种蝙蝠舌头普遍高表达的基因 | 第39-41页 |
4.4.3 三种蝙蝠舌头差异表达的基因 | 第41-42页 |
4.4.4 三种蝙蝠舌头差异表达基因的功能富集分析 | 第42-44页 |
第五章 讨论 | 第44-49页 |
5.1 与免疫功能相关的基因 | 第44-46页 |
5.1.1 GLUL基因 | 第44-45页 |
5.1.2 LCN2基因 | 第45页 |
5.1.3 IGFBP5基因 | 第45-46页 |
5.2 与糖类代谢相关的基因 | 第46-47页 |
5.2.1 GALM基因 | 第46页 |
5.2.2 KLF15基因 | 第46-47页 |
5.3 总结 | 第47-49页 |
参考文献 | 第49-54页 |
攻硕期间发表的与学位论文相关的科研成果 | 第54-55页 |
致谢 | 第55-56页 |