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三种蝙蝠舌头转录组的比较分析

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第10-20页
    1.1 舌头多元化的生理功能及特化功能第10-12页
        1.1.1 舌头多元化的生理功能第10-11页
        1.1.2 舌头的特化功能第11-12页
    1.2 蝙蝠的物种分类及食性分化第12-17页
        1.2.1 蝙蝠的物种分类第12-14页
        1.2.2 蝙蝠的食性分化第14-15页
        1.2.3 蝙蝠食性的适应性进化第15页
        1.2.4 以蝙蝠作为研究对象的优势第15-16页
        1.2.5 三种蝙蝠的习性和生物学特征第16-17页
    1.3 本论文的研究概述第17-20页
        1.3.1 本论文的研究目的第17-18页
        1.3.2 本论文的研究方法第18-19页
        1.3.3 本论文的结构和研究意义第19-20页
第二章 转录组分析技术第20-29页
    2.1 新一代高通量测序技术的简介第20-21页
    2.2 Illumina测序技术的基本原理第21-23页
        2.2.1 基因组DNA或cDNA测序的经典流程第21页
        2.2.2 桥式PCR扩增第21-22页
        2.2.3 四色循环可逆终止法测序第22-23页
    2.3 转录组深度测序第23-27页
        2.3.1 转录组深度测序的简介第23-24页
        2.3.2 转录组深度测序的应用第24-27页
    2.4 提取总RNA的方法第27-29页
        2.4.1 异硫氰酸胍/氯化铯超速离心法提取总RNA第27页
        2.4.2 盐酸胍-有机溶剂法第27页
        2.4.3 氯化锂-尿素法第27-28页
        2.4.4 细胞质RNA提取法第28页
        2.4.5 一步快速热酚提取法第28页
        2.4.6 Triozl法提取总RNA第28-29页
第三章 材料与方法第29-36页
    3.1 实验材料第29页
    3.2 舌头组织总RNA的提取与质量检测第29-31页
        3.2.1 舌头组织总RNA的提取第29-30页
        3.2.2 RNA的质量检测第30-31页
    3.3 舌头组织cDNA文库的构建和测序第31-32页
    3.4 原始测序数据处理第32-34页
        3.4.1 原始测序数据的质量检测第32-33页
        3.4.2 数据过滤第33-34页
        3.4.3 转录组的从头拼接第34页
    3.5 舌头转录组的比较分析第34-36页
        3.5.1 直系同源基因的筛选第34页
        3.5.2 三种蝙蝠舌头普遍高表达基因的鉴定第34-35页
        3.5.3 三种蝙蝠舌头差异表达基因的鉴定第35页
        3.5.4 三种蝙蝠舌头差异表达基因的功能富集第35-36页
第四章 结果第36-44页
    4.1 三种蝙蝠舌头组织总RNA的提取第36页
    4.2 三种蝙蝠舌头组织cDNA文库的构建和测序第36页
    4.3 原始测序数据的处理第36-39页
        4.3.1 原始测序数据的质量检测第36-38页
        4.3.2 数据过滤第38页
        4.3.3 转录组的从头拼接第38-39页
    4.4 三种蝙蝠舌头转录组的比较分析第39-44页
        4.4.1 直系同源基因的筛选第39页
        4.4.2 三种蝙蝠舌头普遍高表达的基因第39-41页
        4.4.3 三种蝙蝠舌头差异表达的基因第41-42页
        4.4.4 三种蝙蝠舌头差异表达基因的功能富集分析第42-44页
第五章 讨论第44-49页
    5.1 与免疫功能相关的基因第44-46页
        5.1.1 GLUL基因第44-45页
        5.1.2 LCN2基因第45页
        5.1.3 IGFBP5基因第45-46页
    5.2 与糖类代谢相关的基因第46-47页
        5.2.1 GALM基因第46页
        5.2.2 KLF15基因第46-47页
    5.3 总结第47-49页
参考文献第49-54页
攻硕期间发表的与学位论文相关的科研成果第54-55页
致谢第55-56页

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